• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

人类蛋白质组在疾病应用中的挖掘进展。

Progress in mining the human proteome for disease applications.

机构信息

Fred Hutchinson Cancer Research Center, Seattle, Washington 98109-1024, USA.

出版信息

OMICS. 2011 Mar;15(3):133-9. doi: 10.1089/omi.2010.0111.

DOI:10.1089/omi.2010.0111
PMID:21375461
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC3118795/
Abstract

Currently available technologies allow in-depth analysis of multiple facets of the proteome that have clinical relevance and that complement current genomics-based approaches. Although some progress has been made in our knowledge of the human proteome in health and in disease, there is an urgent need to chart a coherent road map with clearly defined milestones to guide proteomics efforts. Areas of emphasis include: (1) building resources, (2) filling gaps in our understanding of biological variation, and (3) systematically characterizing proteome alterations that occur in well-defined disease states, all of which require an organized and collaborative effort.

摘要

目前可用的技术可以深入分析具有临床相关性且补充当前基于基因组学的方法的蛋白质组的多个方面。尽管我们在健康和疾病中的人类蛋白质组学知识方面已经取得了一些进展,但迫切需要制定一个具有明确里程碑的连贯路线图来指导蛋白质组学工作。重点领域包括:(1)构建资源,(2)填补我们对生物变异理解的空白,以及(3)系统地描述在明确界定的疾病状态中发生的蛋白质组变化,所有这些都需要有组织的协作努力。

相似文献

1
Progress in mining the human proteome for disease applications.人类蛋白质组在疾病应用中的挖掘进展。
OMICS. 2011 Mar;15(3):133-9. doi: 10.1089/omi.2010.0111.
2
Mining the plasma proteome for disease applications across seven logs of protein abundance.针对七种蛋白质丰度的日志进行疾病应用的血浆蛋白质组学挖掘。
J Proteome Res. 2011 Jan 7;10(1):46-50. doi: 10.1021/pr101052y. Epub 2010 Nov 29.
3
Key challenges in proteomics and proteoinformatics. Progress in proteins.蛋白质组学和蛋白质信息学中的关键挑战。蛋白质方面的进展。
IEEE Eng Med Biol Mag. 2005 May-Jun;24(3):34-40. doi: 10.1109/memb.2005.1436456.
4
Current progress in computational metabolomics.计算代谢组学的当前进展。
Brief Bioinform. 2007 Sep;8(5):279-93. doi: 10.1093/bib/bbm030. Epub 2007 Jul 11.
5
Current trends in computational inference from mass spectrometry-based proteomics.基于质谱的蛋白质组学计算推断的当前趋势。
Brief Bioinform. 2007 Sep;8(5):304-17. doi: 10.1093/bib/bbm023. Epub 2007 Jun 20.
6
Missing Protein Landscape of Human Chromosomes 2 and 14: Progress and Current Status.人类2号和14号染色体的缺失蛋白质图谱:进展与现状
J Proteome Res. 2016 Nov 4;15(11):3971-3978. doi: 10.1021/acs.jproteome.6b00443. Epub 2016 Aug 17.
7
Toward a definition of the complete proteome of plant peroxisomes: Where experimental proteomics must be complemented by bioinformatics.朝向植物过氧化物酶体完整蛋白质组定义:实验蛋白质组学必须由生物信息学补充。
Proteomics. 2011 May;11(9):1764-79. doi: 10.1002/pmic.201000681. Epub 2011 Apr 7.
8
Proteomic approaches to dissect platelet function: Half the story.蛋白质组学方法剖析血小板功能:故事的一半。
Blood. 2006 Dec 15;108(13):3983-91. doi: 10.1182/blood-2006-06-026518. Epub 2006 Aug 22.
9
Characterization of the vitreous proteome in diabetes without diabetic retinopathy and diabetes with proliferative diabetic retinopathy.无糖尿病视网膜病变的糖尿病患者和增殖性糖尿病视网膜病变的糖尿病患者玻璃体液蛋白质组的特征分析
J Proteome Res. 2008 Jun;7(6):2516-25. doi: 10.1021/pr800112g. Epub 2008 Apr 24.
10
From proteome lists to biological impact--tools and strategies for the analysis of large MS data sets.从蛋白质组列表到生物影响——用于分析大型 MS 数据集的工具和策略。
Proteomics. 2010 Mar;10(6):1270-83. doi: 10.1002/pmic.200900365.

引用本文的文献

1
Mass spectrometry-based proteomics identify novel serum osteoarthritis biomarkers.基于质谱的蛋白质组学鉴定新型血清骨关节炎生物标志物。
Arthritis Res Ther. 2022 May 23;24(1):120. doi: 10.1186/s13075-022-02801-1.
2
The Promise of Proteomics in the Study of Oncogenic Viruses.蛋白质组学在致癌病毒研究中的前景
Mol Cell Proteomics. 2017 Apr;16(4 suppl 1):S65-S74. doi: 10.1074/mcp.O116.065201. Epub 2017 Jan 19.
3
Challenges of deciphering gastric cancer heterogeneity.解读胃癌异质性的挑战。
World J Gastroenterol. 2015 Oct 7;21(37):10510-27. doi: 10.3748/wjg.v21.i37.10510.
4
Proteomic approaches in biomarker discovery: new perspectives in cancer diagnostics.蛋白质组学方法在生物标志物发现中的应用:癌症诊断的新视角
ScientificWorldJournal. 2014 Jan 14;2014:260348. doi: 10.1155/2014/260348. eCollection 2014.
5
Application of NMR metabolomics to search for human disease biomarkers.应用核磁共振代谢组学寻找人类疾病生物标志物。
Comb Chem High Throughput Screen. 2012 Sep;15(8):595-610. doi: 10.2174/138620712802650522.

本文引用的文献

1
Novel proteins associated with risk for coronary heart disease or stroke among postmenopausal women identified by in-depth plasma proteome profiling.通过深入的血浆蛋白质组 profiling 鉴定出与绝经后妇女患冠心病或中风风险相关的新型蛋白质。
Genome Med. 2010 Jul 28;2(7):48. doi: 10.1186/gm169.
2
Quantitative analysis of the secretome of TGF-beta signaling-deficient mammary fibroblasts.TGF-β 信号缺陷型乳腺成纤维细胞外泌体的定量分析。
Proteomics. 2010 Jul;10(13):2458-70. doi: 10.1002/pmic.200900701.
3
Proteomics-based biomarkers in chronic obstructive pulmonary disease.基于蛋白质组学的慢性阻塞性肺疾病生物标志物。
J Proteome Res. 2010 Jun 4;9(6):2798-808. doi: 10.1021/pr100063r.
4
Antibody array-based technologies for cancer protein profiling and functional proteomic analyses using serum and tissue specimens.基于抗体阵列的技术,用于使用血清和组织样本进行癌症蛋白质谱分析和功能蛋白质组学分析。
Tumour Biol. 2010 Apr;31(2):103-12. doi: 10.1007/s13277-009-0014-z. Epub 2010 Jan 21.
5
Kinome profiling of clinical cancer specimens.临床癌症标本的激酶组分析。
Cancer Res. 2010 Apr 1;70(7):2575-8. doi: 10.1158/0008-5472.CAN-09-3989. Epub 2010 Mar 23.
6
Quantitative mass spectrometry-based proteomics reveals the dynamic range of primary mouse astrocyte protein secretion.基于定量质谱的蛋白质组学揭示了原代小鼠星形胶质细胞蛋白质分泌的动态范围。
J Proteome Res. 2010 May 7;9(5):2764-74. doi: 10.1021/pr100134n.
7
Identification of quantitative trait loci underlying proteome variation in human lymphoblastoid cells.鉴定人类淋巴母细胞蛋白质组变异的数量性状基因座。
Mol Cell Proteomics. 2010 Jul;9(7):1383-99. doi: 10.1074/mcp.M900378-MCP200. Epub 2010 Feb 23.
8
Cerebrospinal fluid and plasma biomarkers in Alzheimer disease.阿尔茨海默病的脑脊液和血浆生物标志物。
Nat Rev Neurol. 2010 Mar;6(3):131-44. doi: 10.1038/nrneurol.2010.4. Epub 2010 Feb 16.
9
Quantitative phosphoproteomic analysis reveals vasopressin V2-receptor-dependent signaling pathways in renal collecting duct cells.定量磷酸化蛋白质组学分析揭示了肾集合管细胞中血管加压素 V2 受体依赖性信号通路。
Proc Natl Acad Sci U S A. 2010 Feb 23;107(8):3882-7. doi: 10.1073/pnas.0910646107. Epub 2010 Feb 5.
10
jmzML, an open-source Java API for mzML, the PSI standard for MS data.jmzML,一个用于 mzML 的开源 Java API,mzML 是 MS 数据的 PSI 标准。
Proteomics. 2010 Apr;10(7):1332-5. doi: 10.1002/pmic.200900719.