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jmzML，一个用于 mzML 的开源 Java API，mzML 是 MS 数据的 PSI 标准。

jmzML, an open-source Java API for mzML, the PSI standard for MS data.

机构信息

EMBL Outstation, European Bioinformatics Institute, Wellcome Trust Genome Campus, Cambridge, UK.

出版信息

Proteomics. 2010 Apr;10(7):1332-5. doi: 10.1002/pmic.200900719.

DOI:10.1002/pmic.200900719
PMID:20127693
Abstract

We here present jmzML, a Java API for the Proteomics Standards Initiative mzML data standard. Based on the Java Architecture for XML Binding and XPath-based XML indexer random-access XML parser, jmzML can handle arbitrarily large files in minimal memory, allowing easy and efficient processing of mzML files using the Java programming language. jmzML also automatically resolves internal XML references on-the-fly. The library (which includes a viewer) can be downloaded from http://jmzml.googlecode.com.

摘要

我们在此介绍 jmzML，这是一个用于 Proteomics Standards Initiative mzML 数据标准的 Java API。基于 Java 架构的 XML 绑定和基于 XPath 的 XML 索引器随机访问 XML 解析器，jmzML 可以在最小的内存中处理任意大的文件，允许使用 Java 编程语言轻松高效地处理 mzML 文件。jmzML 还可以自动动态解析内部 XML 引用。该库（包括查看器）可以从 http://jmzml.googlecode.com 下载。

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