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荚膜红细菌MopB DNA结合结构域的表达、纯化、结晶及初步X射线分析

Expression, purification, crystallization and preliminary X-ray analysis of the DNA-binding domain of Rhodobacter capsulatus MopB.

作者信息

Müller Alexandra, Schlicker Christine, Fehringer Maria, Masepohl Bernd, Hofmann Eckhard

机构信息

Lehrstuhl für Biologie der Mikroorganismen, Fakultät für Biologie und Biotechnologie, Ruhr-Universität Bochum, 44780 Bochum, Germany.

出版信息

Acta Crystallogr Sect F Struct Biol Cryst Commun. 2011 Mar 1;67(Pt 3):377-9. doi: 10.1107/S1744309110054710. Epub 2011 Feb 25.

Abstract

The LysR-type regulator MopB represses transcription of several target genes (including the nitrogen-fixation gene anfA) in Rhodobacter capsulatus at high molybdenum concentrations. In this study, the isolated DNA-binding domain of MopB (MopBHTH) was overexpressed in Escherichia coli. Purified MopBHTH bound the anfA promoter as shown by DNA mobility-shift assays, demonstrating the function of the isolated regulator domain. MopBHTH was crystallized using the sitting-drop vapour-diffusion method in the presence of 0.2 M lithium sulfate, 0.1 M phosphate/citrate pH 4.2, 20%(w/v) PEG 1000 at 291 K. The crystal belonged to space group P3(1)21 or P3(2)21, with unit-cell parameters a=b=61.84, c=139.64 Å, α=β=90, γ=120°, and diffracted to 3.3 Å resolution at a synchrotron source.

摘要

LysR 型调控因子 MopB 在高钼浓度下抑制荚膜红细菌中几个靶基因(包括固氮基因 anfA)的转录。在本研究中,MopB 的分离 DNA 结合结构域(MopBHTH)在大肠杆菌中过表达。如 DNA 迁移率变动分析所示,纯化的 MopBHTH 结合 anfA 启动子,证明了分离的调控结构域的功能。采用坐滴气相扩散法,在 291 K 下,于含有 0.2 M 硫酸锂、0.1 M 磷酸盐/柠檬酸盐(pH 4.2)、20%(w/v)聚乙二醇 1000 的条件下,使 MopBHTH 结晶。晶体属于空间群 P3(1)21 或 P3(2)21,晶胞参数 a = b = 61.84,c = 139.64 Å,α = β = 90°,γ = 120°,在同步辐射源处衍射至 3.3 Å 分辨率。

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