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使用WebGBrowse管理GBrowse网站。

Administering GBrowse sites with WebGBrowse.

作者信息

Podicheti Ram, Dong Qunfeng

机构信息

Indiana University, Bloomington, Indiana, USA.

出版信息

Curr Protoc Bioinformatics. 2011 Mar;Chapter 9:Unit 9.14. doi: 10.1002/0471250953.bi0914s33.

DOI:10.1002/0471250953.bi0914s33
PMID:21400697
Abstract

GBrowse is widely used by biologists to visualize genome annotation. We have developed WebGBrowse to facilitate hosting multiple GBrowse instances specific for different users on the same Web server. WebGBrowse automatically sets up each user-specific GBrowse instance by extracting information from user-supplied data to produce the appropriate configuration. This unit describes installation and administration of WebGBrowse for bioinformaticians who plan to manage local WebGBrowse servers in their institutions.

摘要

生物学家广泛使用GBrowse来可视化基因组注释。我们开发了WebGBrowse,以便在同一Web服务器上为不同用户托管多个特定的GBrowse实例。WebGBrowse通过从用户提供的数据中提取信息来自动设置每个用户特定的GBrowse实例,以生成适当的配置。本单元介绍了WebGBrowse的安装和管理,供计划在其机构中管理本地WebGBrowse服务器的生物信息学家使用。

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