• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

人 RNase P 保守蛋白亚基的 RNA 结合特性。

RNA binding properties of conserved protein subunits of human RNase P.

机构信息

Department of Microbiology and Molecular Genetics, IMRIC, The Hebrew University-Hadassah Medical School, Jerusalem 91120, Israel.

出版信息

Nucleic Acids Res. 2011 Jul;39(13):5704-14. doi: 10.1093/nar/gkr126. Epub 2011 Mar 30.

DOI:10.1093/nar/gkr126
PMID:21450806
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC3141246/
Abstract

Human nuclear RNase P is required for transcription and processing of tRNA. This catalytic RNP has an H1 RNA moiety associated with ten distinct protein subunits. Five (Rpp20, Rpp21, Rpp25, Rpp29 and Pop5) out of eight of these protein subunits, prepared in refolded recombinant forms, bind to H1 RNA in vitro. Rpp20 and Rpp25 bind jointly to H1 RNA, even though each protein can interact independently with this transcript. Nuclease footprinting analysis reveals that Rpp20 and Rpp25 recognize overlapping regions in the P2 and P3 domains of H1 RNA. Rpp21 and Rpp29, which are sufficient for reconstitution of the endonucleolytic activity, bind to separate regions in the catalytic domain of H1 RNA. Common themes and discrepancies in the RNA-protein interactions between human nuclear RNase P and its related yeast and archaeal counterparts provide a rationale for the assembly of the fully active form of this enzyme.

摘要

人核 RNase P 是 tRNA 转录和加工所必需的。这种催化性 RNP 具有与十个不同的蛋白质亚基相关联的 H1 RNA 部分。在体外,在重新折叠的重组形式中制备的这八个蛋白质亚基中的五个(Rpp20、Rpp21、Rpp25、Rpp29 和 Pop5)与 H1 RNA 结合。Rpp20 和 Rpp25 联合结合 H1 RNA,尽管每种蛋白质都可以与该转录本独立相互作用。核酸酶足迹分析表明,Rpp20 和 Rpp25 识别 H1 RNA 的 P2 和 P3 结构域中的重叠区域。Rpp21 和 Rpp29 足以重新构建内切核酸酶活性,它们与 H1 RNA 的催化结构域中的不同区域结合。人核 RNase P 与其相关的酵母和古菌对应物之间的 RNA-蛋白质相互作用的共同主题和差异为该酶的完全活性形式的组装提供了依据。

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/a2ad/3141246/b3ca66faaad3/gkr126f7.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/a2ad/3141246/cbd5dd3ceb55/gkr126f1.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/a2ad/3141246/e3452dc0029e/gkr126f2.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/a2ad/3141246/e55378aa03a1/gkr126f3.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/a2ad/3141246/7510a83fe42e/gkr126f4.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/a2ad/3141246/2ff707fd0d70/gkr126f5.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/a2ad/3141246/90507b07c2c2/gkr126f6.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/a2ad/3141246/b3ca66faaad3/gkr126f7.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/a2ad/3141246/cbd5dd3ceb55/gkr126f1.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/a2ad/3141246/e3452dc0029e/gkr126f2.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/a2ad/3141246/e55378aa03a1/gkr126f3.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/a2ad/3141246/7510a83fe42e/gkr126f4.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/a2ad/3141246/2ff707fd0d70/gkr126f5.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/a2ad/3141246/90507b07c2c2/gkr126f6.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/a2ad/3141246/b3ca66faaad3/gkr126f7.jpg

相似文献

1
RNA binding properties of conserved protein subunits of human RNase P.人 RNase P 保守蛋白亚基的 RNA 结合特性。
Nucleic Acids Res. 2011 Jul;39(13):5704-14. doi: 10.1093/nar/gkr126. Epub 2011 Mar 30.
2
Differential association of protein subunits with the human RNase MRP and RNase P complexes.蛋白质亚基与人核糖核酸酶MRP和核糖核酸酶P复合物的差异关联。
RNA. 2006 Jul;12(7):1373-82. doi: 10.1261/rna.2293906. Epub 2006 May 24.
3
Heterodimerization of the human RNase P/MRP subunits Rpp20 and Rpp25 is a prerequisite for interaction with the P3 arm of RNase MRP RNA.人 RNase P/MRP 亚基 Rpp20 和 Rpp25 的异二聚化是与 RNase MRP RNA 的 P3 臂相互作用的前提。
Nucleic Acids Res. 2010 Jul;38(12):4052-66. doi: 10.1093/nar/gkq141. Epub 2010 Mar 9.
4
A role of human RNase P subunits, Rpp29 and Rpp21, in homology directed-repair of double-strand breaks.人 RNase P 亚基 Rpp29 和 Rpp21 在双链断裂同源定向修复中的作用。
Sci Rep. 2017 Apr 21;7(1):1002. doi: 10.1038/s41598-017-01185-6.
5
Heterodimerization regulates RNase MRP/RNase P association, localization, and expression of Rpp20 and Rpp25.异源二聚化调节核糖核酸酶MRP/核糖核酸酶P的缔合、定位以及Rpp20和Rpp25的表达。
RNA. 2007 Jan;13(1):65-75. doi: 10.1261/rna.237807. Epub 2006 Nov 21.
6
Crystal Structure of Human Rpp20/Rpp25 Reveals Quaternary Level Adaptation of the Alba Scaffold as Structural Basis for Single-stranded RNA Binding.人源 Rpp20/Rpp25 复合物的晶体结构揭示了 Alba 支架的四级结构适应作为单链 RNA 结合的结构基础。
J Mol Biol. 2018 May 11;430(10):1403-1416. doi: 10.1016/j.jmb.2018.03.029. Epub 2018 Apr 4.
7
Crystal structure of human RPP20-RPP25 proteins in complex with the P3 domain of lncRNA RMRP.人 RPP20-RPP25 蛋白与长非编码 RNA RMRP 的 P3 结构域复合物的晶体结构。
J Struct Biol. 2021 Jun;213(2):107704. doi: 10.1016/j.jsb.2021.107704. Epub 2021 Feb 9.
8
Thermodynamics of coupled folding in the interaction of archaeal RNase P proteins RPP21 and RPP29.古菌 RNase P 蛋白 RPP21 和 RPP29 相互作用中偶联折叠的热力学
Biochemistry. 2012 Jan 31;51(4):926-35. doi: 10.1021/bi201674d. Epub 2012 Jan 18.
9
Rpp14 and Rpp29, two protein subunits of human ribonuclease P.Rpp14和Rpp29,人核糖核酸酶P的两个蛋白质亚基。
RNA. 1999 Feb;5(2):153-7. doi: 10.1017/s135583829800185x.
10
Eukaryotic RNase P: role of RNA and protein subunits of a primordial catalytic ribonucleoprotein in RNA-based catalysis.真核核糖核酸酶P:一种原始催化核糖核蛋白的RNA和蛋白质亚基在基于RNA的催化中的作用。
Mol Cell. 2003 Oct;12(4):925-35. doi: 10.1016/s1097-2765(03)00357-5.

引用本文的文献

1
RNase P: Beyond Precursor tRNA Processing.RNase P:超越前体 tRNA 加工。
Genomics Proteomics Bioinformatics. 2024 May 9;22(1). doi: 10.1093/gpbjnl/qzae016.
2
Mapping of RNase P Ribozyme Regions in Proximity with a Human RNase P Subunit Protein Using Fe(II)-EDTA Cleavage and Nuclease Footprint Analyses.利用 Fe(II)-EDTA 切割和核酸酶足迹分析,绘制与人 RNase P 亚基蛋白邻近的 RNase P 核酶区域图谱。
Methods Mol Biol. 2023;2666:55-67. doi: 10.1007/978-1-0716-3191-1_4.
3
Human RNase P: overview of a ribonuclease of interrelated molecular networks and gene-targeting systems.

本文引用的文献

1
Discovery of a minimal form of RNase P in Pyrobaculum.在 Pyrobaculum 中发现了一种最小形式的 RNase P。
Proc Natl Acad Sci U S A. 2010 Dec 28;107(52):22493-8. doi: 10.1073/pnas.1013969107. Epub 2010 Dec 6.
2
Domain architecture of the DRpp29 protein and its interaction with the RNA subunit of Dictyostelium discoideum RNase P.DRpp29 蛋白的结构域结构及其与盘基网柄菌 RNase P 的 RNA 亚基的相互作用。
Biochemistry. 2010 Dec 21;49(50):10714-27. doi: 10.1021/bi101297z. Epub 2010 Nov 29.
3
Structure of a bacterial ribonuclease P holoenzyme in complex with tRNA.
人 RNase P:相关分子网络和基因靶向系统的核糖核酸酶概述。
RNA. 2023 Mar;29(3):300-307. doi: 10.1261/rna.079475.122. Epub 2022 Dec 22.
4
Prediction of tumor location in prostate cancer tissue using a machine learning system on gene expression data.基于基因表达数据的机器学习系统预测前列腺癌组织中的肿瘤位置。
BMC Bioinformatics. 2020 Mar 11;21(Suppl 2):78. doi: 10.1186/s12859-020-3345-9.
5
In vitro reconstitution and analysis of eukaryotic RNase P RNPs.体外重建和分析真核 RNA 酶 P RNP。
Nucleic Acids Res. 2018 Jul 27;46(13):6857-6868. doi: 10.1093/nar/gky333.
6
Crystal Structure of Human Rpp20/Rpp25 Reveals Quaternary Level Adaptation of the Alba Scaffold as Structural Basis for Single-stranded RNA Binding.人源 Rpp20/Rpp25 复合物的晶体结构揭示了 Alba 支架的四级结构适应作为单链 RNA 结合的结构基础。
J Mol Biol. 2018 May 11;430(10):1403-1416. doi: 10.1016/j.jmb.2018.03.029. Epub 2018 Apr 4.
7
A role of human RNase P subunits, Rpp29 and Rpp21, in homology directed-repair of double-strand breaks.人 RNase P 亚基 Rpp29 和 Rpp21 在双链断裂同源定向修复中的作用。
Sci Rep. 2017 Apr 21;7(1):1002. doi: 10.1038/s41598-017-01185-6.
8
RNase P protein subunit Rpp29 represses histone H3.3 nucleosome deposition.核糖核酸酶P蛋白亚基Rpp29抑制组蛋白H3.3核小体沉积。
Mol Biol Cell. 2016 Apr 1;27(7):1154-69. doi: 10.1091/mbc.E15-02-0099. Epub 2016 Feb 3.
9
Mitochondrial ribonuclease P structure provides insight into the evolution of catalytic strategies for precursor-tRNA 5' processing.线粒体核糖核酸酶 P 结构为前体 tRNA 5'加工的催化策略进化提供了线索。
Proc Natl Acad Sci U S A. 2012 Oct 2;109(40):16149-54. doi: 10.1073/pnas.1209062109. Epub 2012 Sep 18.
10
Structural organizations of yeast RNase P and RNase MRP holoenzymes as revealed by UV-crosslinking studies of RNA-protein interactions.酵母 RNase P 和 RNase MRP 全酶的结构组织,通过 RNA-蛋白质相互作用的 UV 交联研究揭示。
RNA. 2012 Apr;18(4):720-8. doi: 10.1261/rna.030874.111. Epub 2012 Feb 13.
细菌核糖核酸酶 P 全酶与 tRNA 复合物的结构。
Nature. 2010 Dec 9;468(7325):784-9. doi: 10.1038/nature09516. Epub 2010 Nov 14.
4
Cleavage of model substrates by archaeal RNase P: role of protein cofactors in cleavage-site selection.古菌 RNase P 对模型底物的切割:蛋白质辅因子在切割位点选择中的作用。
Nucleic Acids Res. 2011 Feb;39(3):1105-16. doi: 10.1093/nar/gkq732. Epub 2010 Oct 8.
5
Archaeal/eukaryal RNase P: subunits, functions and RNA diversification.古菌/真核生物 RNase P:亚基、功能和 RNA 多样化。
Nucleic Acids Res. 2010 Dec;38(22):7885-94. doi: 10.1093/nar/gkq701. Epub 2010 Aug 16.
6
Ribosomal protein L7Ae is a subunit of archaeal RNase P.核糖体蛋白 L7Ae 是古菌 RNase P 的一个亚基。
Proc Natl Acad Sci U S A. 2010 Aug 17;107(33):14573-8. doi: 10.1073/pnas.1005556107. Epub 2010 Jul 30.
7
Heterodimerization of the human RNase P/MRP subunits Rpp20 and Rpp25 is a prerequisite for interaction with the P3 arm of RNase MRP RNA.人 RNase P/MRP 亚基 Rpp20 和 Rpp25 的异二聚化是与 RNase MRP RNA 的 P3 臂相互作用的前提。
Nucleic Acids Res. 2010 Jul;38(12):4052-66. doi: 10.1093/nar/gkq141. Epub 2010 Mar 9.
8
Archaeal homologs of human RNase P protein pairs Pop5 with Rpp30 and Rpp21 with Rpp29 work on distinct functional domains of the RNA subunit.人类核糖核酸酶P蛋白的古菌同源物中,Pop5与Rpp30配对,Rpp21与Rpp29配对,它们作用于RNA亚基的不同功能结构域。
Biosci Biotechnol Biochem. 2010;74(2):266-73. doi: 10.1271/bbb.90550. Epub 2010 Feb 7.
9
Eukaryotic ribonucleases P/MRP: the crystal structure of the P3 domain.真核生物核糖核酸酶 P/MRP:P3 结构域的晶体结构。
EMBO J. 2010 Feb 17;29(4):761-9. doi: 10.1038/emboj.2009.396. Epub 2010 Jan 14.
10
Protein-precursor tRNA contact leads to sequence-specific recognition of 5' leaders by bacterial ribonuclease P.蛋白质前体 tRNA 接触导致细菌核糖核酸酶 P 对 5' 先导序列的特异性识别。
J Mol Biol. 2010 Feb 12;396(1):195-208. doi: 10.1016/j.jmb.2009.11.039. Epub 2009 Nov 28.