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利用协作靶向最大似然学习法寻找数量性状位点基因。

Finding Quantitative Trait Loci Genes with Collaborative Targeted Maximum Likelihood Learning.

作者信息

Wang Hui, Rose Sherri, van der Laan Mark J

机构信息

University of California, Berkeley, School of Public Health, Division of Biostatistics, 101 Haviland Hall, #7358, Berkeley, CA 94720, USA.

出版信息

Stat Probab Lett. 2011 Jul 1;81(7):792-796. doi: 10.1016/j.spl.2010.11.001.

DOI:10.1016/j.spl.2010.11.001
PMID:21572586
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC3090625/
Abstract

Quantitative trait loci mapping is focused on identifying the positions and effect of genes underlying an an observed trait. We present a collaborative targeted maximum likelihood estimator in a semi-parametric model using a newly proposed 2-part super learning algorithm to find quantitative trait loci genes in listeria data. Results are compared to the parametric composite interval mapping approach.

摘要

数量性状基因座定位专注于识别潜在观察性状的基因的位置和效应。我们在半参数模型中提出了一种协作式靶向最大似然估计器,使用新提出的两部分超级学习算法在李斯特菌数据中寻找数量性状基因座基因。将结果与参数复合区间定位方法进行比较。

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Finding Quantitative Trait Loci Genes with Collaborative Targeted Maximum Likelihood Learning.利用协作靶向最大似然学习法寻找数量性状位点基因。
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Evaluating the robustness of targeted maximum likelihood estimators via realistic simulations in nutrition intervention trials.通过营养干预试验中的现实模拟评估靶向极大似然估计量的稳健性。
Stat Med. 2022 May 30;41(12):2132-2165. doi: 10.1002/sim.9348. Epub 2022 Feb 16.
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Health Serv Res. 2018 Oct;53(5):3836-3854. doi: 10.1111/1475-6773.12848. Epub 2018 Mar 11.
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Environ Health Perspect. 2017 Apr;125(4):511-526. doi: 10.1289/EHP595. Epub 2017 Mar 31.
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