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RxnFinder:基于分子结构、分子片段和反应相似性的生化反应搜索引擎。

RxnFinder: biochemical reaction search engines using molecular structures, molecular fragments and reaction similarity.

机构信息

Key Laboratory of Combinatorial Biosynthesis and Drug Discovery (Wuhan University), Ministry of Education, Wuhan University School of Pharmaceutical Sciences, Wuhan 430071, PR China.

出版信息

Bioinformatics. 2011 Sep 1;27(17):2465-7. doi: 10.1093/bioinformatics/btr413. Epub 2011 Jul 12.

DOI:10.1093/bioinformatics/btr413
PMID:21752802
Abstract

SUMMARY

Biochemical reactions play a key role to help sustain life and allow cells to grow. RxnFinder was developed to search biochemical reactions from KEGG reaction database using three search criteria: molecular structures, molecular fragments and reaction similarity. RxnFinder is helpful to get reference reactions for biosynthesis and xenobiotics metabolism.

AVAILABILITY

RxnFinder is freely available via: http://sdd.whu.edu.cn/rxnfinder.

CONTACT

qnhu@whu.edu.cn.

摘要

摘要

生化反应在维持生命和促进细胞生长方面起着关键作用。RxnFinder 是为了使用三种搜索标准(分子结构、分子片段和反应相似度)从 KEGG 反应数据库中搜索生化反应而开发的。RxnFinder 有助于获取生物合成和外来化合物代谢的参考反应。

可用性

RxnFinder 可通过以下网址免费获取:http://sdd.whu.edu.cn/rxnfinder。

联系方式

qnhu@whu.edu.cn。

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