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相似文献

1
A systematic analysis of Drosophila TUDOR domain-containing proteins identifies Vreteno and the Tdrd12 family as essential primary piRNA pathway factors.对果蝇 TUDOR 结构域蛋白的系统分析鉴定了 Vreteno 和 Tdrd12 家族作为必需的初级 piRNA 通路因子。
EMBO J. 2011 Aug 23;30(19):3977-93. doi: 10.1038/emboj.2011.308.
2
An in vivo RNAi assay identifies major genetic and cellular requirements for primary piRNA biogenesis in Drosophila.体内 RNAi 分析鉴定果蝇初级 piRNA 生物发生的主要遗传和细胞需求。
EMBO J. 2010 Oct 6;29(19):3301-17. doi: 10.1038/emboj.2010.212. Epub 2010 Sep 3.
3
Vreteno, a gonad-specific protein, is essential for germline development and primary piRNA biogenesis in Drosophila.Vreteno 是一种性腺特异性蛋白,对果蝇生殖细胞的发育和初级 piRNA 的生物发生至关重要。
Development. 2011 Sep;138(18):4039-50. doi: 10.1242/dev.069187. Epub 2011 Aug 10.
4
The Tudor domain protein Tapas, a homolog of the vertebrate Tdrd7, functions in the piRNA pathway to regulate retrotransposons in germline of Drosophila melanogaster.都铎结构域蛋白塔帕斯(Tapas)是脊椎动物Tdrd7的同源物,在果蝇生殖系的piRNA途径中发挥作用,以调控逆转录转座子。
BMC Biol. 2014 Oct 6;12:61. doi: 10.1186/s12915-014-0061-9.
5
The Tudor protein Veneno assembles the ping-pong amplification complex that produces viral piRNAs in Aedes mosquitoes.Tudor 蛋白 Veneno 组装了乒乓扩增复合物,该复合物在埃及伊蚊中产生病毒 piRNA。
Nucleic Acids Res. 2019 Mar 18;47(5):2546-2559. doi: 10.1093/nar/gky1266.
6
Mitochondrial protein BmPAPI modulates the length of mature piRNAs.线粒体蛋白 BmPAPI 调节成熟 piRNA 的长度。
RNA. 2013 Oct;19(10):1405-18. doi: 10.1261/rna.040428.113. Epub 2013 Aug 22.
7
Roles for the Yb body components Armitage and Yb in primary piRNA biogenesis in Drosophila.在果蝇初级 piRNA 生物发生中,Yb 体成分 Armitage 和 Yb 的作用。
Genes Dev. 2010 Nov 15;24(22):2493-8. doi: 10.1101/gad.1989510. Epub 2010 Oct 21.
8
Recruitment of Armitage and Yb to a transcript triggers its phased processing into primary piRNAs in Drosophila ovaries.在果蝇卵巢中,Armitage和Yb被招募到转录本上会引发其阶段性加工成初级piRNA。
PLoS Genet. 2017 Aug 21;13(8):e1006956. doi: 10.1371/journal.pgen.1006956. eCollection 2017 Aug.
9
Tudor domain containing 12 (TDRD12) is essential for secondary PIWI interacting RNA biogenesis in mice.Tudor 结构域包含蛋白 12(TDRD12)是小鼠次级 Piwi 相互作用 RNA 生成所必需的。
Proc Natl Acad Sci U S A. 2013 Oct 8;110(41):16492-7. doi: 10.1073/pnas.1316316110. Epub 2013 Sep 25.
10
Distinct and Collaborative Functions of Yb and Armitage in Transposon-Targeting piRNA Biogenesis.Yb 和 Armitage 在转座子靶向 piRNA 生物发生中的独特和协作功能。
Cell Rep. 2019 May 7;27(6):1822-1835.e8. doi: 10.1016/j.celrep.2019.04.029.

引用本文的文献

1
In vivo Dicer-2 interactome during viral infection reveals novel pro and antiviral factors in Drosophila melanogaster.病毒感染期间果蝇体内的Dicer-2相互作用组揭示了新的促病毒和抗病毒因子。
PLoS Pathog. 2025 May 7;21(5):e1013093. doi: 10.1371/journal.ppat.1013093. eCollection 2025 May.
2
In silico screening by AlphaFold2 program revealed the potential binding partners of nuage-localizing proteins and piRNA-related proteins.通过AlphaFold2程序进行的计算机模拟筛选揭示了与核仁定位蛋白和piRNA相关蛋白潜在的结合伴侣。
Elife. 2025 Apr 22;13:RP101967. doi: 10.7554/eLife.101967.
3
Topoisomerase 3b facilitates piRNA biogenesis to promote transposon silencing and germ cell development.拓扑异构酶3b促进piRNA生物合成,以促进转座子沉默和生殖细胞发育。
Cell Rep. 2025 Apr 22;44(4):115495. doi: 10.1016/j.celrep.2025.115495. Epub 2025 Apr 3.
4
Direct cell-to-cell transmission of retrotransposons.逆转座子的直接细胞间传播。
bioRxiv. 2025 Mar 16:2025.03.14.642691. doi: 10.1101/2025.03.14.642691.
5
A model that integrates the different piRNA biogenesis pathways based on studies in silkworm N4 cells.一个基于家蚕N4细胞研究整合不同piRNA生物发生途径的模型。
Curr Res Insect Sci. 2025 Feb 11;7:100108. doi: 10.1016/j.cris.2025.100108. eCollection 2025.
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Tudor domain containing protein 5-like identifies a novel germline body and regulates maternal RNAs during oogenesis in Drosophila.含 Tudor 结构域蛋白 5 样蛋白鉴定出一种新型生殖系小体并在果蝇卵子发生过程中调控母体 RNA。
Genetics. 2025 Apr 17;229(4). doi: 10.1093/genetics/iyaf024.
7
piRNA processing within non-membrane structures is governed by constituent proteins and their functional motifs.非膜结构内的piRNA加工受组成蛋白及其功能基序的调控。
FEBS J. 2025 Jun;292(11):2715-2736. doi: 10.1111/febs.17360. Epub 2024 Dec 30.
8
High-Dose Vitamin D Supplementation Significantly Affects the Placental Transcriptome.高剂量维生素 D 补充显著影响胎盘转录组。
Nutrients. 2023 Dec 7;15(24):5032. doi: 10.3390/nu15245032.
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An extended Tudor domain within Vreteno interconnects Gtsf1L and Ago3 for piRNA biogenesis in Bombyx mori.Vreteno 中的一个扩展的都铎域将 Gtsf1L 和 Ago3 连接起来,用于在家蚕中产生 piRNA。
EMBO J. 2023 Dec 11;42(24):e114072. doi: 10.15252/embj.2023114072. Epub 2023 Nov 20.
10
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Genome Biol Evol. 2023 Nov 1;15(11). doi: 10.1093/gbe/evad189.

本文引用的文献

1
Tdrd1 acts as a molecular scaffold for Piwi proteins and piRNA targets in zebrafish.Tdrd1 在斑马鱼中作为 Piwi 蛋白和 piRNA 靶标的分子支架发挥作用。
EMBO J. 2011 Jul 8;30(16):3298-308. doi: 10.1038/emboj.2011.228.
2
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Genetics. 2011 Jul;188(3):749-52. doi: 10.1534/genetics.111.129825. Epub 2011 Apr 28.
3
A genome-scale shRNA resource for transgenic RNAi in Drosophila.用于果蝇中转基因 RNAi 的全基因组规模 shRNA 资源。
Nat Methods. 2011 May;8(5):405-7. doi: 10.1038/nmeth.1592. Epub 2011 Apr 3.
4
PAPI, a novel TUDOR-domain protein, complexes with AGO3, ME31B and TRAL in the nuage to silence transposition.PAPI,一种新型 TUDOR 结构域蛋白,与 AGO3、ME31B 和 TRAL 在核仁中形成复合物沉默转座。
Development. 2011 May;138(9):1863-73. doi: 10.1242/dev.059287. Epub 2011 Mar 29.
5
piRNA-associated germline nuage formation and spermatogenesis require MitoPLD profusogenic mitochondrial-surface lipid signaling.piRNA 相关的生殖细胞核质形成和精子发生需要 MitoPLD 促生成的线粒体表面脂质信号。
Dev Cell. 2011 Mar 15;20(3):376-87. doi: 10.1016/j.devcel.2011.01.004.
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MITOPLD is a mitochondrial protein essential for nuage formation and piRNA biogenesis in the mouse germline.MITOPLD 是一种线粒体蛋白,对于小鼠生殖细胞中核仁的形成和 piRNA 的生物发生是必需的。
Dev Cell. 2011 Mar 15;20(3):364-75. doi: 10.1016/j.devcel.2011.01.005.
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piRNAs, transposon silencing, and Drosophila germline development.piRNAs、转座子沉默和果蝇生殖细胞发育。
J Cell Biol. 2010 Nov 29;191(5):905-13. doi: 10.1083/jcb.201006034.
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The Yb body, a major site for Piwi-associated RNA biogenesis and a gateway for Piwi expression and transport to the nucleus in somatic cells.Yb 体是 Piwi 相关 RNA 发生的主要部位,也是 Piwi 在体细胞中表达和运输到细胞核的门户。
J Biol Chem. 2011 Feb 4;286(5):3789-97. doi: 10.1074/jbc.M110.193888. Epub 2010 Nov 24.
9
Probing the initiation and effector phases of the somatic piRNA pathway in Drosophila.在果蝇中探究体 piRNA 通路的起始和效应阶段。
Genes Dev. 2010 Nov 15;24(22):2499-504. doi: 10.1101/gad.1968110. Epub 2010 Oct 21.
10
Roles for the Yb body components Armitage and Yb in primary piRNA biogenesis in Drosophila.在果蝇初级 piRNA 生物发生中,Yb 体成分 Armitage 和 Yb 的作用。
Genes Dev. 2010 Nov 15;24(22):2493-8. doi: 10.1101/gad.1989510. Epub 2010 Oct 21.

对果蝇 TUDOR 结构域蛋白的系统分析鉴定了 Vreteno 和 Tdrd12 家族作为必需的初级 piRNA 通路因子。

A systematic analysis of Drosophila TUDOR domain-containing proteins identifies Vreteno and the Tdrd12 family as essential primary piRNA pathway factors.

机构信息

Institute of Molecular Biotechnology of the Austrian Academy of Sciences (IMBA), Vienna, Austria.

出版信息

EMBO J. 2011 Aug 23;30(19):3977-93. doi: 10.1038/emboj.2011.308.

DOI:10.1038/emboj.2011.308
PMID:21863019
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC3209783/
Abstract

PIWI proteins and their bound PIWI-interacting RNAs (piRNAs) form the core of a gonad-specific small RNA silencing pathway that protects the animal genome against the deleterious activity of transposable elements. Recent studies linked the piRNA pathway to TUDOR biology as TUDOR domains of various proteins bind symmetrically methylated Arginine residues in PIWI proteins. We systematically analysed the Drosophila TUDOR protein family and identified four previously not characterized TUDOR domain-containing proteins (CG4771, CG14303, CG11133 and CG31755) as essential piRNA pathway factors. We characterized CG4771 (Vreteno) in detail and demonstrate a critical role for this protein in primary piRNA biogenesis. Vreteno physically and/or genetically interacts with the primary pathway components Piwi, Armitage, Yb and Zucchini. Vreteno also interacts with the Tdrd12 orthologues CG11133 (Brother of Yb) and CG31755 (Sister of Yb), which are essential for the primary piRNA pathway in the germline and probably replace the function of the related but soma-specific factor Yb.

摘要

PIWI 蛋白及其结合的 PIWI 相互作用 RNA(piRNA)构成了一个性腺特异性小 RNA 沉默途径的核心,该途径保护动物基因组免受转座元件的有害活性的影响。最近的研究将 piRNA 途径与 Tudor 生物学联系起来,因为各种蛋白质的 Tudor 结构域结合 PIWI 蛋白中对称甲基化的精氨酸残基。我们系统地分析了果蝇的 Tudor 蛋白家族,并鉴定了四个以前未被描述的含有 Tudor 结构域的蛋白质(CG4771、CG14303、CG11133 和 CG31755)作为必需的 piRNA 途径因子。我们详细地对 CG4771(Vreteno)进行了表征,并证明了该蛋白在初级 piRNA 生物发生中的关键作用。Vreteno 与初级途径成分 Piwi、Armitage、Yb 和 Zucchini 物理和/或遗传相互作用。Vreteno 还与 Tdrd12 同源物 CG11133(Yb 的兄弟)和 CG31755(Yb 的姐妹)相互作用,这些同源物对于生殖细胞中的初级 piRNA 途径是必需的,并且可能取代相关但在体细胞中特异性的因子 Yb 的功能。