• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

丙型肝炎病毒 NS3 解旋酶诱导的单碱基对解旋和非同步 RNA 释放。

Single-base pair unwinding and asynchronous RNA release by the hepatitis C virus NS3 helicase.

机构信息

Department of Pharmaceutical Sciences, College of Pharmacy, University of Michigan, Ann Arbor, MI 48109, USA.

出版信息

Science. 2011 Sep 23;333(6050):1746-9. doi: 10.1126/science.1206023.

DOI:10.1126/science.1206023
PMID:21940894
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC4172460/
Abstract

Nonhexameric helicases use adenosine triphosphate (ATP) to unzip base pairs in double-stranded nucleic acids (dsNAs). Studies have suggested that these helicases unzip dsNAs in single-base pair increments, consuming one ATP molecule per base pair, but direct evidence for this mechanism is lacking. We used optical tweezers to follow the unwinding of double-stranded RNA by the hepatitis C virus NS3 helicase. Single-base pair steps by NS3 were observed, along with nascent nucleotide release that was asynchronous with base pair opening. Asynchronous release of nascent nucleotides rationalizes various observations of its dsNA unwinding and may be used to coordinate the translocation speed of NS3 along the RNA during viral replication.

摘要

非六聚体解旋酶利用三磷酸腺苷(ATP)将双链核酸(dsNAs)中的碱基对解开。研究表明,这些解旋酶以单碱基对的增量解开 dsNAs,每解开一个碱基对消耗一个 ATP 分子,但这种机制的直接证据尚缺乏。我们使用光学镊子跟踪丙型肝炎病毒 NS3 解旋酶解开双链 RNA 的过程。观察到 NS3 以单碱基对的步幅移动,同时伴随着与碱基对打开不同步的新生核苷酸释放。新生核苷酸的异步释放解释了其 dsNA 解旋的各种观察结果,并且可能用于协调病毒复制过程中 NS3 沿 RNA 的易位速度。

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/826f/4172460/10cd28014531/nihms627905f4.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/826f/4172460/fa06edae5045/nihms627905f1.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/826f/4172460/d31307cf675d/nihms627905f2.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/826f/4172460/d5c09fe913f3/nihms627905f3.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/826f/4172460/10cd28014531/nihms627905f4.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/826f/4172460/fa06edae5045/nihms627905f1.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/826f/4172460/d31307cf675d/nihms627905f2.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/826f/4172460/d5c09fe913f3/nihms627905f3.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/826f/4172460/10cd28014531/nihms627905f4.jpg

相似文献

1
Single-base pair unwinding and asynchronous RNA release by the hepatitis C virus NS3 helicase.丙型肝炎病毒 NS3 解旋酶诱导的单碱基对解旋和非同步 RNA 释放。
Science. 2011 Sep 23;333(6050):1746-9. doi: 10.1126/science.1206023.
2
Zika virus NS3 is a canonical RNA helicase stimulated by NS5 RNA polymerase. Zika 病毒 NS3 是一种被 NS5 RNA 聚合酶激活的经典 RNA 解旋酶。
Nucleic Acids Res. 2019 Sep 19;47(16):8693-8707. doi: 10.1093/nar/gkz650.
3
Enzymatic properties of hepatitis C virus NS3-associated helicase.丙型肝炎病毒NS3相关解旋酶的酶学特性
J Gen Virol. 2000 May;81(Pt 5):1335-45. doi: 10.1099/0022-1317-81-5-1335.
4
RNA translocation and unwinding mechanism of HCV NS3 helicase and its coordination by ATP.丙型肝炎病毒NS3解旋酶的RNA易位与解旋机制及其与ATP的协同作用
Nature. 2006 Jan 5;439(7072):105-8. doi: 10.1038/nature04331.
5
RNA unwinding by NS3 helicase: a statistical approach.NS3 解旋酶的 RNA 解旋:一种统计方法。
PLoS One. 2009 Sep 22;4(9):e6937. doi: 10.1371/journal.pone.0006937.
6
Coupling translocation with nucleic acid unwinding by NS3 helicase.通过 NS3 解旋酶将易位与核酸解旋偶联。
J Mol Biol. 2010 Dec 3;404(3):439-55. doi: 10.1016/j.jmb.2010.09.047. Epub 2010 Sep 29.
7
The macroscopic rate of nucleic acid translocation by hepatitis C virus helicase NS3h is dependent on both sugar and base moieties.丙型肝炎病毒 NS3h 解旋酶的核酸转位宏观速率既依赖于糖部分也依赖于碱基部分。
J Mol Biol. 2010 Jul 16;400(3):354-78. doi: 10.1016/j.jmb.2010.04.065. Epub 2010 May 6.
8
Robust translocation along a molecular monorail: the NS3 helicase from hepatitis C virus traverses unusually large disruptions in its track.沿分子单轨的稳健易位:丙型肝炎病毒的NS3解旋酶在其轨道上穿越异常大的干扰。
J Mol Biol. 2006 May 12;358(4):974-82. doi: 10.1016/j.jmb.2006.02.078. Epub 2006 Mar 20.
9
Spring-loaded mechanism of DNA unwinding by hepatitis C virus NS3 helicase.丙型肝炎病毒NS3解旋酶解开DNA的弹簧加载机制。
Science. 2007 Jul 27;317(5837):513-6. doi: 10.1126/science.1144130.
10
Structure-based mutational analysis of the hepatitis C virus NS3 helicase.丙型肝炎病毒NS3解旋酶的基于结构的突变分析。
J Virol. 2001 Sep;75(17):8289-97. doi: 10.1128/jvi.75.17.8289-8297.2001.

引用本文的文献

1
Duplex Unwinding Mechanism of Coronavirus MERS-CoV nsp13 Helicase.中东呼吸综合征冠状病毒(MERS-CoV)非结构蛋白13(nsp13)解旋酶的双链解旋机制
Chem Biomed Imaging. 2024 Dec 19;3(2):111-122. doi: 10.1021/cbmi.4c00077. eCollection 2025 Feb 24.
2
High-resolution fleezers reveal duplex opening and stepwise assembly by an oligomer of the DEAD-box helicase Ded1p.高分辨率荧光显微镜揭示了DEAD盒解旋酶Ded1p的寡聚体介导的双链打开和逐步组装过程。
Nat Commun. 2025 Jan 25;16(1):1015. doi: 10.1038/s41467-024-54955-y.
3
Single-molecule dynamic structural biology with vertically arranged DNA on a fluorescence microscope.

本文引用的文献

1
Visualizing ATP-dependent RNA translocation by the NS3 helicase from HCV.可视化 HCV 中 NS3 解旋酶依赖 ATP 的 RNA 易位。
J Mol Biol. 2011 Feb 4;405(5):1139-53. doi: 10.1016/j.jmb.2010.11.034. Epub 2010 Dec 9.
2
RNA helicases at work: binding and rearranging.RNA 解旋酶的工作原理:结合与重排。
Trends Biochem Sci. 2011 Jan;36(1):19-29. doi: 10.1016/j.tibs.2010.07.008.
3
Use of tapered amplifier diode laser for biological-friendly high-resolution optical trapping.锥形放大器二极管激光在生物亲和型高分辨率光阱中的应用。
在荧光显微镜上利用垂直排列的DNA进行单分子动态结构生物学研究。
Nat Methods. 2025 Jan;22(1):135-144. doi: 10.1038/s41592-024-02498-x. Epub 2024 Nov 8.
4
Mechanical regulation of the helicase activity of Zika virus NS3.机械调节寨卡病毒 NS3 解旋酶的活性。
Biophys J. 2022 Dec 20;121(24):4900-4908. doi: 10.1016/j.bpj.2022.07.030. Epub 2022 Aug 2.
5
Insight into the biochemical mechanism of DNA helicases provided by bulk-phase and single-molecule assays.从体相和单分子检测中对 DNA 解旋酶生化机制的深入了解。
Methods. 2022 Aug;204:348-360. doi: 10.1016/j.ymeth.2021.12.002. Epub 2021 Dec 8.
6
Kinetic and structural mechanism for DNA unwinding by a non-hexameric helicase.非六聚体解旋酶解旋 DNA 的动力学和结构机制。
Nat Commun. 2021 Dec 1;12(1):7015. doi: 10.1038/s41467-021-27304-6.
7
Optical tweezers in single-molecule biophysics.单分子生物物理学中的光镊
Nat Rev Methods Primers. 2021;1. doi: 10.1038/s43586-021-00021-6. Epub 2021 Mar 25.
8
The NEOtrap - en route with a new single-molecule technique.NEOtrap——借助一种新的单分子技术正在发展中。
iScience. 2021 Sep 25;24(10):103007. doi: 10.1016/j.isci.2021.103007. eCollection 2021 Oct 22.
9
Anisotropy in mechanical unfolding of protein upon partner-assisted pulling and handle-assisted pulling.在伴侣辅助牵拉和手柄辅助牵拉下蛋白质机械展开的各向异性。
Commun Biol. 2021 Jul 29;4(1):925. doi: 10.1038/s42003-021-02445-y.
10
DNA replication: single-molecule manipulation data analysis and models.DNA复制:单分子操作数据分析与模型
Comput Struct Biotechnol J. 2021 Jun 24;19:3765-3778. doi: 10.1016/j.csbj.2021.06.032. eCollection 2021.
Opt Lett. 2010 Sep 1;35(17):2988-90. doi: 10.1364/OL.35.002988.
4
Hepatitis C virus non-structural protein 3 (HCV NS3): a multifunctional antiviral target.丙型肝炎病毒非结构蛋白 3(HCV NS3):一种多功能抗病毒靶标。
J Biol Chem. 2010 Jul 23;285(30):22725-31. doi: 10.1074/jbc.R110.125294. Epub 2010 May 10.
5
The protease domain increases the translocation stepping efficiency of the hepatitis C virus NS3-4A helicase.蛋白酶结构域提高丙型肝炎病毒 NS3-4A 解旋酶的转位效率。
J Biol Chem. 2010 Jun 4;285(23):17821-32. doi: 10.1074/jbc.M110.114785. Epub 2010 Apr 2.
6
Three conformational snapshots of the hepatitis C virus NS3 helicase reveal a ratchet translocation mechanism.丙型肝炎病毒 NS3 解旋酶的三个构象快照揭示了一种棘轮式移位机制。
Proc Natl Acad Sci U S A. 2010 Jan 12;107(2):521-8. doi: 10.1073/pnas.0913380107. Epub 2009 Dec 31.
7
A point process driven multiple change point model: a robust resistant approach.一个由点过程驱动的多重变化点模型:一种稳健抗干扰方法。
Math Biosci. 2009 Jul;220(1):57-71. doi: 10.1016/j.mbs.2009.04.003. Epub 2009 May 3.
8
NS3 helicase from the hepatitis C virus can function as a monomer or oligomer depending on enzyme and substrate concentrations.丙型肝炎病毒的NS3解旋酶可根据酶和底物浓度以单体或寡聚体的形式发挥作用。
J Biol Chem. 2009 Feb 20;284(8):4806-14. doi: 10.1074/jbc.M805540200. Epub 2008 Dec 16.
9
Dynamics of DNA replication loops reveal temporal control of lagging-strand synthesis.DNA复制环的动力学揭示了滞后链合成的时间控制。
Nature. 2009 Jan 15;457(7227):336-9. doi: 10.1038/nature07512. Epub 2008 Nov 23.
10
Establishing a mechanistic basis for the large kinetic steps of the NS3 helicase.建立NS3解旋酶大动力学步骤的机制基础。
J Biol Chem. 2009 Jan 23;284(4):2512-21. doi: 10.1074/jbc.M805460200. Epub 2008 Nov 14.