• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

利用 sortase 在活细胞中进行蛋白质连接。

Protein ligation in living cells using sortase.

机构信息

Whitehead Institute for Biomedical Research, 9 Cambridge Center, Cambridge, MA 02142, USA.

出版信息

Traffic. 2012 Jun;13(6):780-9. doi: 10.1111/j.1600-0854.2012.01345.x. Epub 2012 Mar 23.

DOI:10.1111/j.1600-0854.2012.01345.x
PMID:22348280
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC3490390/
Abstract

Sortagging is a versatile method for site-specific modification of proteins as applied to a variety of in vitro reactions. Here, we explore possibilities of adapting the sortase method for use in living cells. For intracellular sortagging, we employ the Ca²⁺-independent sortase A transpeptidase (SrtA) from Streptococcus pyogenes. Substrate proteins were equipped with the C-terminal sortase-recognition motif (LPXTG); we used proteins with an N-terminal (oligo)glycine as nucleophiles. We show that sortase-dependent protein ligation can be achieved in Saccharomyces cerevisiae and in mammalian HEK293T cells, both in the cytosol and in the lumen of the endoplasmic reticulum (ER). ER luminal sortagging enables secretion of the reaction products, among which circular polypeptides. Protein ligation of substrate and nucleophile occurs within 30 min of translation. The versatility of the method is shown by protein ligation of multiple substrates with green fluorescent protein-based nucleophiles in different intracellular compartments.

摘要

分拣标签是一种用于各种体外反应的蛋白质定点修饰的多功能方法。在这里,我们探索了将分拣标签方法适应于活细胞的可能性。对于细胞内分拣标签,我们使用来自酿脓链球菌的无钙依赖性分拣标签 A 转肽酶(SrtA)。底物蛋白被装备有 C 末端分拣标签识别基序(LPXTG);我们使用具有 N 末端(寡)甘氨酸的蛋白作为亲核试剂。我们表明,依赖于分拣标签的蛋白连接可以在酿酒酵母和哺乳动物 HEK293T 细胞中实现,无论是在细胞质中还是在内质网(ER)的腔中。ER 腔分拣标签使反应产物(包括环状多肽)能够分泌。底物和亲核试剂的蛋白连接在翻译后 30 分钟内发生。该方法的多功能性通过使用基于绿色荧光蛋白的亲核试剂在不同的细胞内隔室中对多个底物进行蛋白连接来展示。

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/89e8/3490390/365f2e0e9258/tra0013-0780-f6.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/89e8/3490390/14e15d681708/tra0013-0780-f1.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/89e8/3490390/bb580966329a/tra0013-0780-f2.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/89e8/3490390/697ae959d649/tra0013-0780-f3.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/89e8/3490390/2b01ef01ed75/tra0013-0780-f4.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/89e8/3490390/5b4d815794b3/tra0013-0780-f5.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/89e8/3490390/365f2e0e9258/tra0013-0780-f6.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/89e8/3490390/14e15d681708/tra0013-0780-f1.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/89e8/3490390/bb580966329a/tra0013-0780-f2.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/89e8/3490390/697ae959d649/tra0013-0780-f3.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/89e8/3490390/2b01ef01ed75/tra0013-0780-f4.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/89e8/3490390/5b4d815794b3/tra0013-0780-f5.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/89e8/3490390/365f2e0e9258/tra0013-0780-f6.jpg

相似文献

1
Protein ligation in living cells using sortase.利用 sortase 在活细胞中进行蛋白质连接。
Traffic. 2012 Jun;13(6):780-9. doi: 10.1111/j.1600-0854.2012.01345.x. Epub 2012 Mar 23.
2
Designed Sortase A Accepts Branched Amines as Nucleophiles in Sortagging.设计的 Sortase A 在 Sortagging 中接受支链胺作为亲核试剂。
Bioconjug Chem. 2020 Nov 18;31(11):2476-2481. doi: 10.1021/acs.bioconjchem.0c00486. Epub 2020 Oct 14.
3
Sortase-mediated protein ligation: a new method for protein engineering.分选酶介导的蛋白质连接:一种蛋白质工程的新方法。
J Am Chem Soc. 2004 Mar 10;126(9):2670-1. doi: 10.1021/ja039915e.
4
Functionality of sortase A in Lactococcus lactis.在乳酸乳球菌中 sortase A 的功能。
Appl Environ Microbiol. 2010 Nov;76(21):7332-7. doi: 10.1128/AEM.00928-10. Epub 2010 Sep 17.
5
Flow-based enzymatic ligation by sortase A.基于 sortase A 的流式酶连接。
Angew Chem Int Ed Engl. 2014 Aug 25;53(35):9203-8. doi: 10.1002/anie.201403582. Epub 2014 Jul 2.
6
Site-specific N- and C-terminal labeling of a single polypeptide using sortases of different specificity.使用不同特异性的分选酶对单个多肽进行位点特异性的N端和C端标记。
J Am Chem Soc. 2009 Aug 12;131(31):10800-1. doi: 10.1021/ja902681k.
7
Structure and specificity of a new class of Ca-independent housekeeping sortase from provide insights into its non-canonical substrate preference.来自[具体来源未提及]的一类新型不依赖钙的管家分选酶的结构与特异性,为其非经典底物偏好提供了见解。
J Biol Chem. 2017 Apr 28;292(17):7244-7257. doi: 10.1074/jbc.M117.782037. Epub 2017 Mar 7.
8
The M Protein of Streptococcus pyogenes Strain AP53 Retains Cell Surface Functional Plasminogen Binding after Inactivation of the Sortase A Gene.化脓性链球菌 AP53 株 M 蛋白在 sortase A 基因失活后保留细胞表面功能的纤溶酶原结合。
J Bacteriol. 2020 Apr 27;202(10). doi: 10.1128/JB.00096-20.
9
Comparison of alternative nucleophiles for Sortase A-mediated bioconjugation and application in neuronal cell labelling.用于分选酶A介导的生物共轭的替代亲核试剂的比较及其在神经元细胞标记中的应用。
Org Biomol Chem. 2014 May 7;12(17):2675-85. doi: 10.1039/c3ob42325e.
10
Proximity-Based Sortase-Mediated Ligation.基于邻近性的 Sortase 介导连接。
Angew Chem Int Ed Engl. 2017 May 2;56(19):5349-5352. doi: 10.1002/anie.201701419. Epub 2017 Apr 4.

引用本文的文献

1
Intracellular Application of an Asparaginyl Endopeptidase for Producing Recombinant Head-to-Tail Cyclic Proteins.用于生产重组头对尾环化蛋白的天冬酰胺内肽酶的细胞内应用
JACS Au. 2023 Nov 20;3(12):3290-3296. doi: 10.1021/jacsau.3c00591. eCollection 2023 Dec 25.
2
Nature-inspired protein ligation and its applications.受自然启发的蛋白质连接及其应用。
Nat Rev Chem. 2023 Apr;7(4):234-255. doi: 10.1038/s41570-023-00468-z. Epub 2023 Feb 21.
3
Peptide/protein-based macrocycles: from biological synthesis to biomedical applications.

本文引用的文献

1
SignalP 4.0: discriminating signal peptides from transmembrane regions.信号肽预测工具SignalP 4.0:区分信号肽与跨膜区域。
Nat Methods. 2011 Sep 29;8(10):785-6. doi: 10.1038/nmeth.1701.
2
Fungal recognition is mediated by the association of dectin-1 and galectin-3 in macrophages.真菌识别是由巨噬细胞中 dectin-1 和半乳糖凝集素-3 的结合介导的。
Proc Natl Acad Sci U S A. 2011 Aug 23;108(34):14270-5. doi: 10.1073/pnas.1111415108. Epub 2011 Aug 8.
3
In vitro sortagging of an antibody fab fragment: overcoming unproductive reactions of sortase with water and lysine side chains.
基于肽/蛋白质的大环化合物:从生物合成到生物医学应用
RSC Chem Biol. 2022 Jun 9;3(7):815-829. doi: 10.1039/d1cb00246e. eCollection 2022 Jul 6.
4
Challenges in the use of sortase and other peptide ligases for site-specific protein modification.用于定点蛋白质修饰的 Sortase 和其他肽连接酶的应用挑战。
Chem Soc Rev. 2022 May 23;51(10):4121-4145. doi: 10.1039/d0cs01148g.
5
Bivalent EGFR-Targeting DARPin-MMAE Conjugates.双价 EGFR 靶向 DARPin-MMAE 偶联物。
Int J Mol Sci. 2022 Feb 23;23(5):2468. doi: 10.3390/ijms23052468.
6
Stability Enhancement of a Dimeric HER2-Specific Affibody Molecule through Sortase A-Catalyzed Head-to-Tail Cyclization.通过 Sortase A 催化的从头至尾环化增强二聚体 HER2 特异性亲和体分子的稳定性。
Molecules. 2021 May 12;26(10):2874. doi: 10.3390/molecules26102874.
7
Bifunctional Reagents for Formylglycine Conjugation: Pitfalls and Breakthroughs.用于甲酰甘氨酸结合的双功能试剂:陷阱与突破。
Chembiochem. 2020 Dec 11;21(24):3580-3593. doi: 10.1002/cbic.202000416. Epub 2020 Sep 18.
8
Engineered peptide ligases for cell signaling and bioconjugation.用于细胞信号转导和生物偶联的工程化肽连接酶。
Biochem Soc Trans. 2020 Jun 30;48(3):1153-1165. doi: 10.1042/BST20200001.
9
Chemoenzymatic Semisynthesis of Proteins.酶促化学法半合成蛋白质。
Chem Rev. 2020 Mar 25;120(6):3051-3126. doi: 10.1021/acs.chemrev.9b00450. Epub 2019 Nov 27.
10
Conversion of an amide to a high-energy thioester by Staphylococcus aureus sortase A is powered by variable binding affinity for calcium.金黄色葡萄球菌 Sortase A 将酰胺转化为高能硫酯是由对钙的可变结合亲和力驱动的。
Sci Rep. 2018 Nov 6;8(1):16371. doi: 10.1038/s41598-018-34752-6.
体外分拣抗体 Fab 片段:克服与水和赖氨酸侧链的无效反应的 sortase。
Chembiochem. 2011 Jul 25;12(11):1774-80. doi: 10.1002/cbic.201100002. Epub 2011 Jun 7.
4
Isopeptide ligation catalyzed by quintessential sortase A: mechanistic cues from cyclic and branched oligomers of indolicidin.典型 sortase A 催化的同肽连接:来自抑菌肽环状和支链寡聚物的机制线索。
J Biol Chem. 2011 Jul 8;286(27):23996-4006. doi: 10.1074/jbc.M111.247650. Epub 2011 May 12.
5
Making and breaking peptide bonds: protein engineering using sortase.形成和断裂肽键:使用 sortase 的蛋白质工程。
Angew Chem Int Ed Engl. 2011 May 23;50(22):5024-32. doi: 10.1002/anie.201008267. Epub 2011 Apr 27.
6
Sortase A as a tool for high-yield histatin cyclization.Sortase A 作为一种用于高产量组氨酸环化的工具。
FASEB J. 2011 Aug;25(8):2650-8. doi: 10.1096/fj.11-182212. Epub 2011 Apr 27.
7
Enhancement of sortase A-mediated protein ligation by inducing a β-hairpin structure around the ligation site.通过在连接点周围诱导 β 发夹结构增强 sortase A 介导的蛋白质连接。
Chem Commun (Camb). 2011 Apr 28;47(16):4742-4. doi: 10.1039/c0cc05334a. Epub 2011 Mar 15.
8
Sortase-catalyzed transformations that improve the properties of cytokines.Sortase 催化的改造可改善细胞因子的特性。
Proc Natl Acad Sci U S A. 2011 Feb 22;108(8):3169-74. doi: 10.1073/pnas.1016863108. Epub 2011 Feb 4.
9
Amino acid residues critical for endoplasmic reticulum export and trafficking of platelet-activating factor receptor.对血小板激活因子受体内质网输出和运输至关重要的氨基酸残基。
J Biol Chem. 2010 Feb 19;285(8):5931-40. doi: 10.1074/jbc.M109.066282. Epub 2009 Dec 10.
10
Sortase-catalyzed peptide-glycosylphosphatidylinositol analogue ligation.分选酶催化的肽-糖基磷脂酰肌醇类似物连接反应。
J Am Chem Soc. 2009 Jul 29;131(29):9878-9. doi: 10.1021/ja903231v.