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SiteComp：用于蛋白质结构中配体结合位点分析的服务器。

SiteComp: a server for ligand binding site analysis in protein structures.

机构信息

Department of Structural and Chemical Biology, Mount Sinai School of Medicine, New York, NY 10029, USA.

出版信息

Bioinformatics. 2012 Apr 15;28(8):1172-3. doi: 10.1093/bioinformatics/bts095. Epub 2012 Feb 24.

DOI:10.1093/bioinformatics/bts095
PMID:22368247
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC3324516/
Abstract

MOTIVATION

Computational characterization of ligand-binding sites in proteins provides preliminary information for functional annotation, protein design and ligand optimization. SiteComp implements binding site analysis for comparison of binding sites, evaluation of residue contribution to binding sites and identification of sub-sites with distinct molecular interaction properties.

AVAILABILITY AND IMPLEMENTATION

The SiteComp server and tutorials are freely available at http://sitecomp.sanchezlab.org.

摘要

动机

蛋白质中配体结合位点的计算特征提供了功能注释、蛋白质设计和配体优化的初步信息。SiteComp 实现了结合位点分析，用于比较结合位点、评估残基对结合位点的贡献以及识别具有不同分子相互作用特性的亚位点。

可用性和实现

SiteComp 服务器和教程可在 http://sitecomp.sanchezlab.org 免费获得。

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