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基于质谱的蛋白质组学结果的 mzIdentML 数据标准。

The mzIdentML data standard for mass spectrometry-based proteomics results.

机构信息

Institute of Integrative Biology, University of Liverpool, Liverpool L69 7ZJ, UK.

出版信息

Mol Cell Proteomics. 2012 Jul;11(7):M111.014381. doi: 10.1074/mcp.M111.014381. Epub 2012 Feb 27.

DOI:10.1074/mcp.M111.014381
PMID:22375074
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC3394945/
Abstract

We report the release of mzIdentML, an exchange standard for peptide and protein identification data, designed by the Proteomics Standards Initiative. The format was developed by the Proteomics Standards Initiative in collaboration with instrument and software vendors, and the developers of the major open-source projects in proteomics. Software implementations have been developed to enable conversion from most popular proprietary and open-source formats, and mzIdentML will soon be supported by the major public repositories. These developments enable proteomics scientists to start working with the standard for exchanging and publishing data sets in support of publications and they provide a stable platform for bioinformatics groups and commercial software vendors to work with a single file format for identification data.

摘要

我们发布了 mzIdentML,这是由蛋白质组学标准倡议组织设计的肽和蛋白质鉴定数据交换标准。该格式由蛋白质组学标准倡议组织与仪器和软件供应商以及蛋白质组学领域的主要开源项目的开发者合作开发。已经开发了软件实现,以支持从大多数流行的专有和开源格式进行转换,并且 mzIdentML 很快将得到主要公共存储库的支持。这些发展使蛋白质组学科学家能够开始使用该标准来交换和发布数据集,以支持出版物,并且为生物信息学组和商业软件供应商提供了一个稳定的平台,以便使用单一的文件格式来处理鉴定数据。

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