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镧系元素辅助的 NMR 评估寡糖构象的动态集合体。

Lanthanide-assisted NMR evaluation of a dynamic ensemble of oligosaccharide conformations.

机构信息

Graduate School of Pharmaceutical Sciences, Nagoya City University, 3-1 Tanabe-dori, Nagoya, Japan.

出版信息

Chem Commun (Camb). 2012 May 16;48(39):4752-4. doi: 10.1039/c2cc30353a. Epub 2012 Apr 4.

DOI:10.1039/c2cc30353a
PMID:22472911
Abstract

A novel methodology is presented for evaluating a dynamic ensemble of oligosaccharide conformations by lanthanide-assisted NMR spectroscopy combined with molecular dynamics (MD) simulations. The results obtained using the GM3 trisaccharide demonstrated that pseudocontact shift measurements offer a valuable experimental tool for the validation of MD simulations of highly flexible biomolecules.

摘要

本文提出了一种新的方法,通过镧系元素辅助 NMR 光谱学结合分子动力学(MD)模拟来评估寡糖构象的动态集合。使用 GM3 三糖获得的结果表明,伪接触位移测量为高度灵活的生物分子的 MD 模拟验证提供了一种有价值的实验工具。

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