The green proteome: challenges in plant proteomics.
作者信息
Heazlewood Joshua L
机构信息
Joint BioEnergy Institute and Physical Biosciences Division, Lawrence Berkeley National Laboratory Berkeley, CA, USA.
出版信息
Front Plant Sci. 2011 Mar 29;2:6. doi: 10.3389/fpls.2011.00006. eCollection 2011.
Abstract
摘要
相似文献
1
The green proteome: challenges in plant proteomics.绿色蛋白质组：植物蛋白质组学面临的挑战
Front Plant Sci. 2011 Mar 29;2:6. doi: 10.3389/fpls.2011.00006. eCollection 2011.
2
Plant proteome analysis: a 2006 update.植物蛋白质组分析：2006年最新进展
Proteomics. 2007 Aug;7(16):2947-62. doi: 10.1002/pmic.200700135.
3
Plant Structure and Specificity - Challenges and Sample Preparation Considerations for Proteomics.植物结构与特异性 - 蛋白质组学的挑战及样品制备考量
Adv Exp Med Biol. 2016;919:63-81. doi: 10.1007/978-3-319-41448-5_4.
4
Plant proteome analysis: a 2004-2006 update.植物蛋白质组分析：2004 - 2006年最新进展
Proteomics. 2006 Oct;6(20):5529-48. doi: 10.1002/pmic.200600260.
5
[Advances in plant proteomics--I. Key techniques of proteome].植物蛋白质组学进展——I.蛋白质组的关键技术
Yi Chuan. 2006 Nov;28(11):1472-86. doi: 10.1360/yc-006-1472.
6
Chloroplast proteomics: potentials and challenges.叶绿体蛋白质组学：潜力与挑战
J Exp Bot. 2004 May;55(400):1213-20. doi: 10.1093/jxb/erh104. Epub 2004 Mar 12.
7
Plant proteomics update (2007-2008): Second-generation proteomic techniques, an appropriate experimental design, and data analysis to fulfill MIAPE standards, increase plant proteome coverage and expand biological knowledge.植物蛋白质组学进展（2007 - 2008年）：第二代蛋白质组学技术、合适的实验设计以及满足MIAPE标准的数据分析，可提高植物蛋白质组覆盖率并拓展生物学知识。
J Proteomics. 2009 Apr 13;72(3):285-314. doi: 10.1016/j.jprot.2009.01.026.
8
PlantPReS: A database for plant proteome response to stress.植物蛋白质组应激反应数据库（PlantPReS）
J Proteomics. 2016 Jun 30;143:69-72. doi: 10.1016/j.jprot.2016.03.009. Epub 2016 Mar 3.
9
Rejuvenating rice proteomics: facts, challenges, and visions.再生稻蛋白质组学：事实、挑战与展望。
Proteomics. 2006 Oct;6(20):5549-76. doi: 10.1002/pmic.200600233.
10
Identification of the proteins in green cotton fiber using a proteomics-based approach.利用基于蛋白质组学的方法鉴定绿色棉纤维中的蛋白质。
Biotechnol Lett. 2013 Sep;35(9):1519-23. doi: 10.1007/s10529-013-1227-1. Epub 2013 May 21.
引用本文的文献
1
Integrated proteomic analysis reveals interactions between phosphorylation and ubiquitination in rose response to infection.综合蛋白质组学分析揭示了玫瑰对感染反应中磷酸化和泛素化之间的相互作用。
Hortic Res. 2023 Nov 14;11(1):uhad238. doi: 10.1093/hr/uhad238. eCollection 2024 Jan.
2
The TriMet_DB: A Manually Curated Database of the Metabolic Proteins of .TriMet_DB：一个手动整理的. 代谢蛋白数据库
Nutrients. 2022 Dec 18;14(24):5377. doi: 10.3390/nu14245377.
3
Label-free quantitative proteomic analysis of alfalfa in response to microRNA156 under high temperature.高温下紫花苜蓿响应微小RNA156的无标记定量蛋白质组学分析
BMC Genomics. 2020 Nov 2;21(1):758. doi: 10.1186/s12864-020-07161-1.
4
Computational systems biology of cellular processes in Arabidopsis thaliana: an overview.拟南芥细胞过程的计算系统生物学：概述。
Cell Mol Life Sci. 2020 Feb;77(3):433-440. doi: 10.1007/s00018-019-03379-9. Epub 2019 Nov 25.
5
In planta proximity dependent biotin identification (BioID).在体邻近依赖生物素鉴定（BioID）。
Sci Rep. 2018 Jun 15;8(1):9212. doi: 10.1038/s41598-018-27500-3.
6
A curated gluten protein sequence database to support development of proteomics methods for determination of gluten in gluten-free foods.一个经过整理的麸质蛋白序列数据库，以支持用于测定无麸质食品中麸质的蛋白质组学方法的开发。
J Proteomics. 2017 Jun 23;163:67-75. doi: 10.1016/j.jprot.2017.03.026. Epub 2017 Apr 4.
7
PAPE (Prefractionation-Assisted Phosphoprotein Enrichment): A Novel Approach for Phosphoproteomic Analysis of Green Tissues from Plants.PAPE（预分级辅助磷蛋白富集）：一种用于植物绿色组织磷酸化蛋白质组分析的新方法。
Proteomes. 2013 Dec 5;1(3):254-274. doi: 10.3390/proteomes1030254.
8
Editorial: International Plant Proteomics Organization (INPPO) World Congress 2014.社论：2014年国际植物蛋白质组学组织（INPPO）世界大会
Front Plant Sci. 2016 Aug 5;7:1190. doi: 10.3389/fpls.2016.01190. eCollection 2016.
9
Characterization of protein N-glycosylation by tandem mass spectrometry using complementary fragmentation techniques.使用互补碎裂技术通过串联质谱对蛋白质N-糖基化进行表征。
Front Plant Sci. 2015 Aug 28;6:674. doi: 10.3389/fpls.2015.00674. eCollection 2015.
10
Proteomic analysis of crop plants under abiotic stress conditions: where to focus our research?非生物胁迫条件下作物的蛋白质组学分析：我们的研究重点应放在哪里？
Front Plant Sci. 2015 Jun 5;6:418. doi: 10.3389/fpls.2015.00418. eCollection 2015.
本文引用的文献
1
The Arabidopsis thaliana 2-D gel mitochondrial proteome: Refining the value of reference maps for assessing protein abundance, contaminants and post-translational modifications.拟南芥 2-D 凝胶线粒体蛋白质组：完善参考图谱在评估蛋白丰度、污染物和翻译后修饰中的价值。
Proteomics. 2011 May;11(9):1720-33. doi: 10.1002/pmic.201000620. Epub 2011 Apr 7.
2
A membrane protein/signaling protein interaction network for Arabidopsis version AMPv2.拟南芥版本 AMPv2 的膜蛋白/信号蛋白相互作用网络。
Front Physiol. 2010 Sep 22;1:24. doi: 10.3389/fphys.2010.00024. eCollection 2010.
3
A first step towards practical single cell proteomics: a microfluidic antibody capture chip with TIRF detection.迈向实用单细胞蛋白质组学的第一步：具有 TIRF 检测的微流控抗体捕获芯片。
Lab Chip. 2011 Apr 7;11(7):1256-61. doi: 10.1039/c0lc00613k. Epub 2011 Feb 23.
4
MASCP Gator: an aggregation portal for the visualization of Arabidopsis proteomics data.MASCP Gator：一个用于可视化拟南芥蛋白质组学数据的聚合门户。
Plant Physiol. 2011 Jan;155(1):259-70. doi: 10.1104/pp.110.168195. Epub 2010 Nov 12.
5
Large-scale comparative phosphoproteomics identifies conserved phosphorylation sites in plants.大规模比较磷酸化蛋白质组学鉴定植物中保守的磷酸化位点。
Plant Physiol. 2010 Jul;153(3):1161-74. doi: 10.1104/pp.110.157347. Epub 2010 May 13.
6
Quantitation in mass-spectrometry-based proteomics.基于质谱的蛋白质组学中的定量。
Annu Rev Plant Biol. 2010;61:491-516. doi: 10.1146/annurev-arplant-042809-112132.
7
AT_CHLORO, a comprehensive chloroplast proteome database with subplastidial localization and curated information on envelope proteins.AT_CHLORO，一个综合性的叶绿体蛋白质组数据库，具有亚质体定位和对包膜蛋白的精选信息。
Mol Cell Proteomics. 2010 Jun;9(6):1063-84. doi: 10.1074/mcp.M900325-MCP200. Epub 2010 Jan 10.
8
Proteomics data mining.蛋白质组学数据挖掘。
Expert Rev Proteomics. 2009 Dec;6(6):599-603. doi: 10.1586/epr.09.81.
9
Full dynamic range proteome analysis of S. cerevisiae by targeted proteomics.通过靶向蛋白质组学对酿酒酵母进行全动态范围蛋白质组分析。
Cell. 2009 Aug 21;138(4):795-806. doi: 10.1016/j.cell.2009.05.051. Epub 2009 Aug 6.
10
A guide to the Proteomics Identifications Database proteomics data repository.蛋白质组学鉴定数据库蛋白质组学数据储存库指南。
Proteomics. 2009 Sep;9(18):4276-83. doi: 10.1002/pmic.200900402.
Zotero 插件