• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

在斑马鱼(Danio rerio)模型中通过吗啉代修饰的寡核苷酸进行基因敲低:在发育毒理学中的应用

Gene knockdown by morpholino-modified oligonucleotides in the zebrafish (Danio rerio) model: applications for developmental toxicology.

作者信息

Timme-Laragy Alicia R, Karchner Sibel I, Hahn Mark E

机构信息

Biology Department, Woods Hole Oceanographic Institution, Woods Hole, MA, USA.

出版信息

Methods Mol Biol. 2012;889:51-71. doi: 10.1007/978-1-61779-867-2_5.

DOI:10.1007/978-1-61779-867-2_5
PMID:22669659
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC4218736/
Abstract

The zebrafish (Danio rerio) has long been used as a model for developmental biology, making it an excellent model to use also in developmental toxicology. The many advantages of zebrafish include their small size, prolific spawning, rapid development, and transparent embryos. They can be easily manipulated genetically through the use of transgenic technology and gene knockdown via morpholino-modified antisense oligonucleotides (MOs). Knocking down specific genes to assess their role in the response to toxicant exposure provides a way to further our knowledge of how developmental toxicants work on a molecular and mechanistic level while establishing a relationship between these molecular events and morphological, behavioral, and/or physiological effects (i.e., phenotypic anchoring). In this chapter, we address important considerations for using MOs to study developmental toxicology in zebrafish embryos and provide a protocol for their use.

摘要

斑马鱼(Danio rerio)长期以来一直被用作发育生物学的模型,这使其成为发育毒理学中一个非常出色的模型。斑马鱼的诸多优点包括体型小、产卵多、发育迅速以及胚胎透明。通过使用转基因技术和经由吗啉代修饰的反义寡核苷酸(MOs)进行基因敲低,它们能够很容易地在基因层面进行操作。敲低特定基因以评估其在对毒物暴露反应中的作用,为我们进一步了解发育毒物在分子和机制层面如何发挥作用提供了一种途径,同时也能建立起这些分子事件与形态、行为和/或生理效应(即表型锚定)之间的关系。在本章中,我们阐述了使用MOs研究斑马鱼胚胎发育毒理学的重要注意事项,并提供了其使用方案。

相似文献

1
Gene knockdown by morpholino-modified oligonucleotides in the zebrafish (Danio rerio) model: applications for developmental toxicology.在斑马鱼(Danio rerio)模型中通过吗啉代修饰的寡核苷酸进行基因敲低:在发育毒理学中的应用
Methods Mol Biol. 2012;889:51-71. doi: 10.1007/978-1-61779-867-2_5.
2
Zebrafish as a model system to study heritable skin diseases.斑马鱼作为研究遗传性皮肤病的模型系统。
Methods Mol Biol. 2013;961:411-24. doi: 10.1007/978-1-62703-227-8_28.
3
Microinjection of Antisense Morpholinos, CRISPR/Cas9 RNP, and RNA/DNA into Zebrafish Embryos.将反义吗啉代寡核苷酸、CRISPR/Cas9核糖核蛋白以及RNA/DNA显微注射到斑马鱼胚胎中。
Methods Mol Biol. 2018;1742:205-211. doi: 10.1007/978-1-4939-7665-2_18.
4
Morphology and Gene Expression Screening with Morpholinos in Zebrafish Embryos.利用吗啉代寡核苷酸对斑马鱼胚胎进行形态学和基因表达筛选。
Methods Mol Biol. 2016;1470:213-24. doi: 10.1007/978-1-4939-6337-9_17.
5
Antisense Oligonucleotide-Mediated Transcript Knockdown in Zebrafish.反义寡核苷酸介导的斑马鱼转录本敲低
PLoS One. 2015 Oct 5;10(10):e0139504. doi: 10.1371/journal.pone.0139504. eCollection 2015.
6
Manipulation of gene expression during zebrafish embryonic development using transient approaches.利用瞬时方法在斑马鱼胚胎发育过程中操纵基因表达。
Methods Mol Biol. 2008;469:273-300. doi: 10.1007/978-1-60327-469-2_19.
7
Studying apoptosis in the Zebrafish.研究斑马鱼中的细胞凋亡。
Methods Enzymol. 2014;544:395-431. doi: 10.1016/B978-0-12-417158-9.00016-9.
8
Knockdown of AHR1A but not AHR1B exacerbates PAH and PCB-126 toxicity in zebrafish (Danio rerio) embryos.AHR1A 的敲低而非 AHR1B 的敲低会加剧斑马鱼(Danio rerio)胚胎中的 PAH 和 PCB-126 毒性。
Aquat Toxicol. 2013 Oct 15;142-143:336-46. doi: 10.1016/j.aquatox.2013.09.007. Epub 2013 Sep 16.
9
Microinjection of mRNA and morpholino antisense oligonucleotides in zebrafish embryos.在斑马鱼胚胎中显微注射信使核糖核酸(mRNA)和吗啉代反义寡核苷酸。
J Vis Exp. 2009 May 7(27):1113. doi: 10.3791/1113.
10
Design and Microinjection of Morpholino Antisense Oligonucleotides and mRNA into Zebrafish Embryos to Elucidate Specific Gene Function in Heart Development.斑马鱼胚胎中 Morpholino 反义寡核苷酸和 mRNA 的设计与显微注射,以阐明心脏发育中特定基因的功能。
J Vis Exp. 2022 Aug 9(186). doi: 10.3791/63324.

引用本文的文献

1
Clearing the Air on Pollutant Disruptions of the Gut-Brain Axis: Developmental Exposure to Benzo[a]pyrene Disturbs Zebrafish Behavior and the Gut Microbiome in Adults and Subsequent Generations.澄清关于污染物对肠-脑轴干扰的问题:发育过程中接触苯并[a]芘会扰乱成年斑马鱼及其后代的行为和肠道微生物群。
Toxics. 2024 Dec 25;13(1):10. doi: 10.3390/toxics13010010.
2
Knockdown Induces Obesity and AHO Features in Early Zebrafish Larvae.基因敲低在早期斑马鱼幼体中诱导肥胖和Albright遗传性骨营养不良特征。
Int J Mol Sci. 2024 Nov 26;25(23):12674. doi: 10.3390/ijms252312674.
3
Direct Activation of Nucleobases with Small Molecules for the Conditional Control of Antisense Function.小分子直接激活核碱基用于反义功能的条件控制
Angew Chem Int Ed Engl. 2024 Apr 22;63(17):e202318773. doi: 10.1002/anie.202318773. Epub 2024 Mar 15.
4
Zebrafish in Lung Cancer Research.斑马鱼在肺癌研究中的应用
Cancers (Basel). 2023 Sep 26;15(19):4721. doi: 10.3390/cancers15194721.
5
Integrating 4-D light-sheet fluorescence microscopy and genetic zebrafish system to investigate ambient pollutants-mediated toxicity.整合 4-D 光片荧光显微镜和遗传斑马鱼系统研究环境污染物介导的毒性。
Sci Total Environ. 2023 Dec 1;902:165947. doi: 10.1016/j.scitotenv.2023.165947. Epub 2023 Aug 3.
6
Antisense Oligonucleotide Activation via Enzymatic Antibiotic Resistance Mechanism.通过酶抗生素耐药机制激活反义寡核苷酸。
ACS Chem Biol. 2023 Oct 20;18(10):2176-2182. doi: 10.1021/acschembio.3c00027. Epub 2023 Jun 16.
7
Research Progress on the Construction and Application of a Diabetic Zebrafish Model.糖尿病斑马鱼模型的构建与应用研究进展。
Int J Mol Sci. 2023 Mar 8;24(6):5195. doi: 10.3390/ijms24065195.
8
Optical Control of MicroRNA Function in Zebrafish Embryos.光控斑马鱼胚胎中的 microRNA 功能。
J Am Chem Soc. 2022 Sep 21;144(37):16819-16826. doi: 10.1021/jacs.2c04479. Epub 2022 Sep 8.
9
Translational control of gene function through optically regulated nucleic acids.通过光调控核酸实现基因功能的翻译调控。
Chem Soc Rev. 2021 Nov 29;50(23):13253-13267. doi: 10.1039/d1cs00257k.
10
Small Molecule Control of Morpholino Antisense Oligonucleotide Function through Staudinger Reduction.通过施蒂德反应控制小分子修饰的吗啉代反义寡核苷酸的功能。
J Am Chem Soc. 2021 Nov 10;143(44):18665-18671. doi: 10.1021/jacs.1c08723. Epub 2021 Oct 27.

本文引用的文献

1
Dopaminergic cell damage and vulnerability to MPTP in Pink1 knockdown zebrafish.Pink1 knockdown 斑马鱼中的多巴胺能细胞损伤和对 MPTP 的易感性。
Neurobiol Dis. 2010 Oct;40(1):93-101. doi: 10.1016/j.nbd.2010.06.001. Epub 2010 Jun 18.
2
Identification of a primary target of thalidomide teratogenicity.确定沙利度胺致畸性的主要靶点。
Science. 2010 Mar 12;327(5971):1345-50. doi: 10.1126/science.1177319.
3
The role of Nrf2 and MAPK pathways in PFOS-induced oxidative stress in zebrafish embryos.Nrf2 和 MAPK 通路在全氟辛烷磺酸诱导斑马鱼胚胎氧化应激中的作用。
Toxicol Sci. 2010 Jun;115(2):391-400. doi: 10.1093/toxsci/kfq066. Epub 2010 Mar 3.
4
Versatile synthesis and rational design of caged morpholinos.笼状吗啉代寡聚物的通用合成与合理设计。
J Am Chem Soc. 2009 Sep 23;131(37):13255-69. doi: 10.1021/ja809933h.
5
The tryptophan photoproduct 6-formylindolo[3,2-b]carbazole (FICZ) binds multiple AHRs and induces multiple CYP1 genes via AHR2 in zebrafish.色氨酸光产物6-甲酰基吲哚并[3,2-b]咔唑(FICZ)在斑马鱼中可结合多个芳烃受体(AHRs),并通过AHR2诱导多个细胞色素P450 1(CYP1)基因。
Chem Biol Interact. 2009 Oct 30;181(3):447-54. doi: 10.1016/j.cbi.2009.07.003. Epub 2009 Jul 15.
6
Distinct roles of two zebrafish AHR repressors (AHRRa and AHRRb) in embryonic development and regulating the response to 2,3,7,8-tetrachlorodibenzo-p-dioxin.两种斑马鱼芳烃受体阻遏物(AHRRa和AHRRb)在胚胎发育及调节对2,3,7,8-四氯二苯并对二恶英的反应中的不同作用。
Toxicol Sci. 2009 Aug;110(2):426-41. doi: 10.1093/toxsci/kfp116. Epub 2009 Jun 3.
7
Validating microRNA Target Transcripts Using Zebrafish Assays.使用斑马鱼实验验证微小RNA靶转录本
Methods Mol Biol. 2009;546:227-40. doi: 10.1007/978-1-60327-977-2_14.
8
A primer for morpholino use in zebrafish.斑马鱼中吗啉代使用入门指南。
Zebrafish. 2009 Mar;6(1):69-77. doi: 10.1089/zeb.2008.0555.
9
Antioxidant responses and NRF2 in synergistic developmental toxicity of PAHs in zebrafish.多环芳烃对斑马鱼协同发育毒性中的抗氧化反应与核因子E2相关因子2
Toxicol Sci. 2009 Jun;109(2):217-27. doi: 10.1093/toxsci/kfp038. Epub 2009 Feb 20.
10
Role of the cyclooxygenase 2-thromboxane pathway in 2,3,7,8-tetrachlorodibenzo-p-dioxin-induced decrease in mesencephalic vein blood flow in the zebrafish embryo.环氧化酶2-血栓素途径在2,3,7,8-四氯二苯并-对-二恶英诱导斑马鱼胚胎中脑静脉血流减少中的作用
Toxicol Appl Pharmacol. 2009 Jan 1;234(1):33-40. doi: 10.1016/j.taap.2008.09.021. Epub 2008 Oct 8.