• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

SimuCell: a flexible framework for creating synthetic microscopy images.

作者信息

Rajaram Satwik, Pavie Benjamin, Hac Nicholas E F, Altschuler Steven J, Wu Lani F

出版信息

Nat Methods. 2012 Jun 28;9(7):634-5. doi: 10.1038/nmeth.2096.

DOI:10.1038/nmeth.2096
PMID:22743763
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC3842427/
Abstract
摘要

相似文献

1
SimuCell: a flexible framework for creating synthetic microscopy images.SimuCell:一个用于创建合成显微镜图像的灵活框架。
Nat Methods. 2012 Jun 28;9(7):634-5. doi: 10.1038/nmeth.2096.
2
PhenoRipper: software for rapidly profiling microscopy images.PhenoRipper:用于快速分析显微镜图像的软件。
Nat Methods. 2012 Jun 28;9(7):635-7. doi: 10.1038/nmeth.2097.
3
Digital autofocus methods for automated microscopy.用于自动显微镜检查的数字自动对焦方法。
Methods Enzymol. 2006;414:620-32. doi: 10.1016/S0076-6879(06)14032-X.
4
OMERO.searcher: content-based image search for microscope images.OMERO搜索器:用于显微镜图像的基于内容的图像搜索。
Nat Methods. 2012 Jun 28;9(7):633-4. doi: 10.1038/nmeth.2086.
5
sCMOS noise-correction algorithm for microscopy images.用于显微镜图像的sCMOS噪声校正算法。
Nat Methods. 2017 Jul 28;14(8):760-761. doi: 10.1038/nmeth.4379.
6
Fluorescence lifetime imaging microscopy.荧光寿命成像显微镜术
Methods Cell Biol. 2007;81:495-524. doi: 10.1016/S0091-679X(06)81024-1.
7
Computational restoration of fluorescence images: noise reduction, deconvolution, and pattern recognition.荧光图像的计算恢复:降噪、去卷积和模式识别。
Methods Cell Biol. 2003;72:337-48. doi: 10.1016/s0091-679x(03)72016-0.
8
Quantitative fluorescence microscopy and image deconvolution.定量荧光显微镜术与图像去卷积
Methods Cell Biol. 2003;72:349-67. doi: 10.1016/s0091-679x(03)72017-2.
9
3D restoration with multiple images acquired by a modified conventional microscope.使用改良传统显微镜采集的多幅图像进行三维重建。
Microsc Res Tech. 2004 Jun 1;64(2):113-25. doi: 10.1002/jemt.20072.
10
Application of the IMM-JPDA filter to multiple target tracking in total internal reflection fluorescence microscopy images.IMM-JPDA滤波器在全内反射荧光显微镜图像多目标跟踪中的应用。
Med Image Comput Comput Assist Interv. 2012;15(Pt 1):357-64. doi: 10.1007/978-3-642-33415-3_44.

引用本文的文献

1
Methods in quantitative biology-from analysis of single-cell microscopy images to inference of predictive models for stochastic gene expression.定量生物学方法——从单细胞显微镜图像分析到随机基因表达预测模型的推断
Phys Biol. 2025 Jun 10;22(4):042001. doi: 10.1088/1478-3975/adda85.
2
Orientation-invariant autoencoders learn robust representations for shape profiling of cells and organelles.不变性自编码器学习用于细胞和细胞器形状分析的鲁棒表示。
Nat Commun. 2024 Feb 3;15(1):1022. doi: 10.1038/s41467-024-45362-4.
3
Machine learning-enabled multiplexed microfluidic sensors.

本文引用的文献

1
Ground-truth data cannot do it alone.真实数据本身无法做到这一点。
Nat Methods. 2011 Nov;8(11):885. doi: 10.1038/nmeth.1767.
2
Workflow and metrics for image quality control in large-scale high-content screens.大规模高内涵筛选中图像质量控制的工作流程和指标
J Biomol Screen. 2012 Feb;17(2):266-74. doi: 10.1177/1087057111420292. Epub 2011 Sep 28.
3
Population context determines cell-to-cell variability in endocytosis and virus infection.群体环境决定了内吞作用和病毒感染中细胞间的变异性。
基于机器学习的多重微流控传感器。
Biomicrofluidics. 2020 Dec 11;14(6):061506. doi: 10.1063/5.0025462. eCollection 2020 Nov.
4
ALICE: a hybrid AI paradigm with enhanced connectivity and cybersecurity for a serendipitous encounter with circulating hybrid cells.爱丽丝:一种具有增强连接性和网络安全性的混合人工智能范式,旨在与循环混合细胞进行偶然相遇。
Theranostics. 2020 Sep 2;10(24):11026-11048. doi: 10.7150/thno.44053. eCollection 2020.
5
Nessys: A new set of tools for the automated detection of nuclei within intact tissues and dense 3D cultures.Nessys:一套用于自动检测完整组织和密集 3D 培养物内细胞核的新工具。
PLoS Biol. 2019 Aug 9;17(8):e3000388. doi: 10.1371/journal.pbio.3000388. eCollection 2019 Aug.
6
Cell Membrane Tracking in Living Brain Tissue Using Differential Interference Contrast Microscopy.利用微分干涉差显微镜对活脑组织中的细胞膜进行跟踪。
IEEE Trans Image Process. 2018 Apr;27(4):1847-1861. doi: 10.1109/TIP.2017.2787625.
7
Using simulated fluorescence cell micrographs for the evaluation of cell image segmentation algorithms.使用模拟荧光细胞显微照片评估细胞图像分割算法。
BMC Bioinformatics. 2017 Mar 18;18(1):176. doi: 10.1186/s12859-017-1591-2.
8
Subcellular protein expression models for microsatellite instability in colorectal adenocarcinoma tissue images.用于结直肠癌组织图像微卫星不稳定性的亚细胞蛋白质表达模型
BMC Bioinformatics. 2016 Oct 22;17(1):430. doi: 10.1186/s12859-016-1243-y.
9
A model of the spatial tumour heterogeneity in colorectal adenocarcinoma tissue.结直肠癌组织中空间肿瘤异质性模型。
BMC Bioinformatics. 2016 Jun 24;17:255. doi: 10.1186/s12859-016-1126-2.
10
Visualizing quantitative microscopy data: History and challenges.可视化定量显微镜数据:历史与挑战。
Crit Rev Biochem Mol Biol. 2016;51(2):96-101. doi: 10.3109/10409238.2016.1146222. Epub 2016 Feb 24.
Nature. 2009 Sep 24;461(7263):520-3. doi: 10.1038/nature08282. Epub 2009 Aug 26.
4
Generation of digital phantoms of cell nuclei and simulation of image formation in 3D image cytometry.细胞核数字模型的生成及三维图像细胞术成像模拟
Cytometry A. 2009 Jun;75(6):494-509. doi: 10.1002/cyto.a.20714.
5
Automated learning of generative models for subcellular location: building blocks for systems biology.亚细胞定位生成模型的自动学习:系统生物学的基石
Cytometry A. 2007 Dec;71(12):978-90. doi: 10.1002/cyto.a.20487.
6
Computational framework for simulating fluorescence microscope images with cell populations.用于模拟具有细胞群体的荧光显微镜图像的计算框架。
IEEE Trans Med Imaging. 2007 Jul;26(7):1010-6. doi: 10.1109/TMI.2007.896925.