• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

蛋白质-蛋白质相互作用网络的分析策略

Analysis strategy of protein-protein interaction networks.

作者信息

Hu Zhenjun

机构信息

Bioinformatics Program, Boston University, Boston, MA, USA.

出版信息

Methods Mol Biol. 2013;939:141-81. doi: 10.1007/978-1-62703-107-3_11.

DOI:10.1007/978-1-62703-107-3_11
PMID:23192546
Abstract

Protein interactions, as well as the networks they formed, play a key role in many cellular processes and the distortion of the protein interacting interfaces may lead to the development of many diseases. In this chapter, we will briefly introduce the background knowledge of the protein-protein interaction, followed by the detailed explanation of varied analysis-from basic to advanced, as well as related tools and databases. VisANT (http://visant.bu.edu)-a free Web-based software platform for the integrative visualization, mining, analysis, and modeling of the biological networks-will be used as a main tool for all examples used in this section.

摘要

蛋白质相互作用及其形成的网络在许多细胞过程中起着关键作用,蛋白质相互作用界面的扭曲可能导致多种疾病的发生。在本章中,我们将简要介绍蛋白质-蛋白质相互作用的背景知识,随后详细解释从基础到高级的各种分析方法,以及相关工具和数据库。VisANT(http://visant.bu.edu)——一个基于网络的免费软件平台,用于生物网络的综合可视化、挖掘、分析和建模——将作为本节所有示例的主要工具。

相似文献

1
Analysis strategy of protein-protein interaction networks.蛋白质-蛋白质相互作用网络的分析策略
Methods Mol Biol. 2013;939:141-81. doi: 10.1007/978-1-62703-107-3_11.
2
VisANT: an online visualization and analysis tool for biological interaction data.VisANT:一款用于生物相互作用数据的在线可视化与分析工具。
BMC Bioinformatics. 2004 Feb 19;5:17. doi: 10.1186/1471-2105-5-17.
3
Integrated web visualizations for protein-protein interaction databases.蛋白质-蛋白质相互作用数据库的集成网络可视化
BMC Bioinformatics. 2015 Jun 16;16(1):195. doi: 10.1186/s12859-015-0615-z.
4
Visualization of Metabolic Interaction Networks in Microbial Communities Using VisANT 5.0.使用VisANT 5.0可视化微生物群落中的代谢相互作用网络。
PLoS Comput Biol. 2016 Apr 15;12(4):e1004875. doi: 10.1371/journal.pcbi.1004875. eCollection 2016 Apr.
5
Visualization of protein interaction networks: problems and solutions.蛋白质相互作用网络的可视化:问题与解决方案。
BMC Bioinformatics. 2013;14 Suppl 1(Suppl 1):S1. doi: 10.1186/1471-2105-14-S1-S1. Epub 2013 Jan 14.
6
VisANT: an integrative framework for networks in systems biology.VisANT:系统生物学中网络的综合框架。
Brief Bioinform. 2008 Jul;9(4):317-25. doi: 10.1093/bib/bbn020. Epub 2008 May 7.
7
Prequips--an extensible software platform for integration, visualization and analysis of LC-MS/MS proteomics data.Prequips——一个用于液相色谱-串联质谱蛋白质组学数据集成、可视化和分析的可扩展软件平台。
Bioinformatics. 2009 Mar 1;25(5):682-3. doi: 10.1093/bioinformatics/btp005. Epub 2009 Jan 6.
8
VisANT: data-integrating visual framework for biological networks and modules.VisANT:用于生物网络和模块的数据整合可视化框架。
Nucleic Acids Res. 2005 Jul 1;33(Web Server issue):W352-7. doi: 10.1093/nar/gki431.
9
Exploratory Analysis of Biological Networks through Visualization, Clustering, and Functional Annotation in Cytoscape.通过Cytoscape中的可视化、聚类和功能注释对生物网络进行探索性分析
Cold Spring Harb Protoc. 2016 Jun 1;2016(6):pdb.prot077644. doi: 10.1101/pdb.prot077644.
10
Visualization and analysis of biological networks.生物网络的可视化与分析
Methods Mol Biol. 2013;1021:63-88. doi: 10.1007/978-1-62703-450-0_4.

引用本文的文献

1
Alzheimer disease: An interactome of many diseases.阿尔茨海默病:多种疾病的相互作用组。
Ann Indian Acad Neurol. 2014 Jan;17(1):48-54. doi: 10.4103/0972-2327.128551.