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tRNAscan-SE: a program for improved detection of transfer RNA genes in genomic sequence.tRNAscan-SE:用于改进基因组序列中转运RNA基因检测的程序。
Nucleic Acids Res. 1997 Mar 1;25(5):955-64. doi: 10.1093/nar/25.5.955.

盐沼螺旋菌M19-40的基因组草图,一种在水生高盐环境中大量存在的γ-变形菌。

Draft Genome of Spiribacter salinus M19-40, an Abundant Gammaproteobacterium in Aquatic Hypersaline Environments.

作者信息

Leon Maria Jose, Ghai Rohit, Fernandez Ana Beatriz, Sanchez-Porro Cristina, Rodriguez-Valera Francisco, Ventosa Antonio

机构信息

Department of Microbiology and Parasitology, Faculty of Pharmacy, University of Sevilla, Sevilla, Spain.

出版信息

Genome Announc. 2013 Jan;1(1). doi: 10.1128/genomeA.00179-12. Epub 2013 Feb 14.

DOI:10.1128/genomeA.00179-12
PMID:23409269
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC3569344/
Abstract

We have previously used a de novo metagenomic assembly approach to describe the presence of an abundant gammaproteobacterium comprising nearly 15% of the microbial community in an intermediate salinity solar saltern pond. We have obtained this microbe in pure culture and describe the genome sequencing of the halophilic photoheterotrophic microbe, Spiribacter salinus M19-40.

摘要

我们之前使用了一种从头宏基因组组装方法来描述在中等盐度的太阳能盐田池塘中存在的一种丰富的γ-变形菌,它占微生物群落的近15%。我们已通过纯培养获得了这种微生物,并描述了嗜盐光异养微生物盐沼螺旋菌M19-40的基因组测序。