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1
The Ku heterodimer and the metabolism of single-ended DNA double-strand breaks.Ku 异源二聚体与单链 DNA 双链断裂的代谢。
Cell Rep. 2013 Jun 27;3(6):2033-45. doi: 10.1016/j.celrep.2013.05.026. Epub 2013 Jun 13.
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Functional significance of the interaction with Ku in DNA double-strand break recognition of XLF.XLF 在 DNA 双链断裂识别中与 Ku 相互作用的功能意义。
FEBS Lett. 2011 Mar 23;585(6):841-6. doi: 10.1016/j.febslet.2011.02.020. Epub 2011 Feb 22.
3
Phosphorylation of Ku dictates DNA double-strand break (DSB) repair pathway choice in S phase.Ku 的磷酸化决定了 S 期 DNA 双链断裂(DSB)修复途径的选择。
Nucleic Acids Res. 2016 Feb 29;44(4):1732-45. doi: 10.1093/nar/gkv1499. Epub 2015 Dec 27.
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Functional interplay of the Mre11 nuclease and Ku in the response to replication-associated DNA damage.Mre11 核酸酶与 Ku 在复制相关 DNA 损伤反应中的功能相互作用。
Mol Cell Biol. 2011 Nov;31(21):4379-89. doi: 10.1128/MCB.05854-11. Epub 2011 Aug 29.
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PARP-1 and Ku compete for repair of DNA double strand breaks by distinct NHEJ pathways.PARP-1和Ku通过不同的非同源末端连接途径竞争修复DNA双链断裂。
Nucleic Acids Res. 2006;34(21):6170-82. doi: 10.1093/nar/gkl840. Epub 2006 Nov 6.
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A nonhomologous end-joining pathway is required for protein phosphatase 2A promotion of DNA double-strand break repair.非同源末端连接途径是蛋白磷酸酶 2A 促进 DNA 双链断裂修复所必需的。
Neoplasia. 2009 Oct;11(10):1012-21. doi: 10.1593/neo.09720.
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Human Ku70/80 protein blocks exonuclease 1-mediated DNA resection in the presence of human Mre11 or Mre11/Rad50 protein complex.人 Ku70/80 蛋白在人 Mre11 或 Mre11/Rad50 蛋白复合物存在的情况下,阻止外切酶 1 介导的 DNA 切除。
J Biol Chem. 2012 Feb 10;287(7):4936-45. doi: 10.1074/jbc.M111.306167. Epub 2011 Dec 15.
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Ku counteracts mobilization of PARP1 and MRN in chromatin damaged with DNA double-strand breaks.Ku 抑制 DNA 双链断裂损伤染色质中 PARP1 和 MRN 的募集。
Nucleic Acids Res. 2011 Dec;39(22):9605-19. doi: 10.1093/nar/gkr656. Epub 2011 Aug 31.
9
Release of Ku and MRN from DNA ends by Mre11 nuclease activity and Ctp1 is required for homologous recombination repair of double-strand breaks.Mre11 核酸酶活性促使 Ku 和 MRN 从 DNA 末端释放,并且 Ctp1 对于双链断裂的同源重组修复是必需的。
PLoS Genet. 2011 Sep;7(9):e1002271. doi: 10.1371/journal.pgen.1002271. Epub 2011 Sep 8.
10
Single-stranded DNA oligomers stimulate error-prone alternative repair of DNA double-strand breaks through hijacking Ku protein.单链DNA寡聚体通过劫持Ku蛋白刺激DNA双链断裂的易出错替代修复。
Nucleic Acids Res. 2015 Dec 2;43(21):10264-76. doi: 10.1093/nar/gkv894. Epub 2015 Sep 8.

引用本文的文献

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Pathogenic variants in MAEA disrupt DNA replication fork stability and are associated with developmental abnormalities in humans.MAEA中的致病变异会破坏DNA复制叉的稳定性,并与人类发育异常相关。
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DNA nicks in both leading and lagging strand templates can trigger break-induced replication.前导链和滞后链模板中的DNA切口均可触发断裂诱导复制。
Mol Cell. 2025 Jan 2;85(1):91-106.e5. doi: 10.1016/j.molcel.2024.10.026. Epub 2024 Nov 18.
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Exo1 cooperates with Tel1/ATM in promoting recombination events at DNA replication forks.Exo1与Tel1/ATM协同作用,促进DNA复制叉处的重组事件。
iScience. 2024 Jun 28;27(8):110410. doi: 10.1016/j.isci.2024.110410. eCollection 2024 Aug 16.
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Identification of the main barriers to Ku accumulation in chromatin.鉴定染色质中 Ku 积累的主要障碍。
Cell Rep. 2024 Aug 27;43(8):114538. doi: 10.1016/j.celrep.2024.114538. Epub 2024 Jul 25.
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Cell Rep. 2024 Apr 23;43(4):114006. doi: 10.1016/j.celrep.2024.114006. Epub 2024 Mar 30.
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The SAP domain of Ku facilitates its efficient loading onto DNA ends.Ku 蛋白的 SAP 结构域有助于其高效地加载到 DNA 末端。
Nucleic Acids Res. 2023 Nov 27;51(21):11706-11716. doi: 10.1093/nar/gkad850.
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Multi-step processing of replication stress-derived nascent strand DNA gaps by MRE11 and EXO1 nucleases.MRE11 和 EXO1 核酸酶对复制压力诱导的新生链 DNA 缺口的多步处理。
Nat Commun. 2023 Oct 7;14(1):6265. doi: 10.1038/s41467-023-42011-0.
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DNA-PK and the TRF2 iDDR inhibit MRN-initiated resection at leading-end telomeres.DNA-PK 和 TRF2 iDDR 在端粒的起始端抑制 MRN 引发的切除。
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Nucleic Acids Res. 2023 Feb 28;51(4):1783-1802. doi: 10.1093/nar/gkad062.

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Everything you ever wanted to know about Saccharomyces cerevisiae telomeres: beginning to end.关于酿酒酵母端粒的一切你想知道的:从开始到结束。
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J Biol Chem. 2012 Feb 10;287(7):4936-45. doi: 10.1074/jbc.M111.306167. Epub 2011 Dec 15.
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The Rad50 coiled-coil domain is indispensable for Mre11 complex functions.Rad50 卷曲螺旋结构域对于 Mre11 复合物的功能不可或缺。
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Mol Cell Biol. 2011 Nov;31(21):4379-89. doi: 10.1128/MCB.05854-11. Epub 2011 Aug 29.
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Ku must load directly onto the chromosome end in order to mediate its telomeric functions.Ku 必须直接加载到染色体末端,才能介导其端粒功能。
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EMBO J. 2010 Oct 6;29(19):3370-80. doi: 10.1038/emboj.2010.219. Epub 2010 Sep 10.
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EMBO J. 2010 Oct 6;29(19):3358-69. doi: 10.1038/emboj.2010.193. Epub 2010 Aug 20.
9
Regulation of homologous recombination in eukaryotes.真核生物同源重组的调控。
Annu Rev Genet. 2010;44:113-39. doi: 10.1146/annurev-genet-051710-150955.
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Extensive DNA end processing by exo1 and sgs1 inhibits break-induced replication.外切酶 1(exo1)和 SGS1 对 DNA 末端的广泛处理抑制了断裂诱导的复制。
PLoS Genet. 2010 Jul 8;6(7):e1001007. doi: 10.1371/journal.pgen.1001007.

Ku 异源二聚体与单链 DNA 双链断裂的代谢。

The Ku heterodimer and the metabolism of single-ended DNA double-strand breaks.

机构信息

Molecular Biology Program, Sloan-Kettering Institute, New York, NY 10065, USA.

出版信息

Cell Rep. 2013 Jun 27;3(6):2033-45. doi: 10.1016/j.celrep.2013.05.026. Epub 2013 Jun 13.

DOI:10.1016/j.celrep.2013.05.026
PMID:23770241
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC3815622/
Abstract

Single-ended double-strand breaks (DSBs) are a common form of spontaneous DNA break, generated when the replisome encounters a discontinuity in the DNA template. Given their prevalence, understanding the mechanisms governing the fate(s) of single-ended DSBs is important. We describe the influence of the Ku heterodimer and Mre11 nuclease activity on processing of single-ended DSBs. Separation-of-function alleles of yku70 were derived that phenocopy Ku deficiency with respect to single-ended DSBs but remain proficient for NHEJ. The Ku mutants fail to regulate Exo1 activity, and bypass the requirement for Mre11 nuclease activity in the repair of camptothecin-induced single-ended DSBs. Ku mutants exhibited reduced affinity for DNA ends, manifest as both reduced end engagement and enhanced probability of diffusing inward on linear DNA. This study reveals an interplay between Ku and Mre11 in the metabolism of single-ended DSBs that is distinct from repair pathway choice at double-ended DSBs.

摘要

单链末端双链断裂(DSBs)是一种常见的自发 DNA 断裂形式,当复制体遇到 DNA 模板中的不连续性时就会产生。鉴于它们的普遍性,了解控制单链末端 DSBs 命运的机制非常重要。我们描述了 Ku 异二聚体和 Mre11 核酸酶活性对单链末端 DSBs 处理的影响。衍生出的 yku70 分离功能等位基因在单链末端 DSBs 方面表现出类似于 Ku 缺陷的表型,但仍能有效进行非同源末端连接(NHEJ)。Ku 突变体不能调节 Exo1 活性,并且在修复喜树碱诱导的单链末端 DSBs 时绕过了对 Mre11 核酸酶活性的要求。Ku 突变体对 DNA 末端的亲和力降低,表现在线性 DNA 上的末端结合减少和向内扩散的概率增加。这项研究揭示了 Ku 和 Mre11 在单链末端 DSBs 代谢中的相互作用,与双链末端 DSBs 修复途径选择不同。