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结构决定因素对甲酰肽受体 2 与肽配体的相互作用。

Structural determinants for the interaction of formyl peptide receptor 2 with peptide ligands.

机构信息

From the School of Pharmacy, Shanghai Jiao Tong University, Shanghai 200240, China.

出版信息

J Biol Chem. 2014 Jan 24;289(4):2295-306. doi: 10.1074/jbc.M113.509216. Epub 2013 Nov 27.

DOI:10.1074/jbc.M113.509216
PMID:24285541
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC3900973/
Abstract

Unlike formyl peptide receptor 1 (FPR1), FPR2/ALX (FPR2) interacts with peptides of diverse sequences but has low affinity for the Escherichia coli-derived chemotactic peptide fMet-Leu-Phe (fMLF). Using computer modeling and site-directed mutagenesis, we investigated the structural requirements for FPR2 to interact with formyl peptides of different length and composition. In calcium flux assay, the N-formyl group of these peptides is necessary for activation of both FPR2 and FPR1, whereas the composition of the C-terminal amino acids appears more important for FPR2 than FPR1. FPR2 interacts better with pentapeptides (fMLFII, fMLFIK) than tetrapeptides (fMLFK, fMLFW) and tripeptide (fMLF) but only weakly with peptides carrying negative charges at the C terminus (e.g. fMLFE). In contrast, FPR1 is less sensitive to negative charges at the C terminus. A CXCR4-based homology model of FPR1 and FPR2 suggested that Asp-281(7.32) is crucial for the interaction of FPR2 with certain formyl peptides as its negative charge may be repulsive with the terminal COO- group of fMLF and negatively charged Glu in fMLFE. Asp-281(7.32) might also form a stable interaction with the positively charged Lys in fMLFK. Site-directed mutagenesis was performed to remove the negative charge at position 281 in FPR2. The D281(7.32)G mutant showed improved affinity for fMLFE and fMLF and reduced affinity for fMLFK compared with wild type FPR2. These results indicate that different structural determinants are used by FPR1 and FPR2 to interact with formyl peptides.

摘要

与甲酰肽受体 1(FPR1)不同,FPR2/ALX(FPR2)与多种序列的肽相互作用,但对大肠杆菌衍生的趋化肽 fMet-Leu-Phe(fMLF)的亲和力较低。使用计算机建模和定点突变,我们研究了 FPR2 与不同长度和组成的甲酰肽相互作用的结构要求。在钙通量测定中,这些肽的 N-甲酰基对于 FPR2 和 FPR1 的激活都是必需的,而 C 末端氨基酸的组成对于 FPR2 比对 FPR1 更为重要。FPR2 与五肽(fMLFII、fMLFIK)的相互作用优于四肽(fMLFK、fMLFW)和三肽(fMLF),但与 C 末端带负电荷的肽(例如 fMLFE)的相互作用较弱。相比之下,FPR1 对 C 末端的负电荷不那么敏感。基于 CXCR4 的 FPR1 和 FPR2 的同源模型表明,Asp-281(7.32)对于 FPR2 与某些甲酰肽的相互作用至关重要,因为其负电荷可能与 fMLF 的末端 COO-基团和 fMLFE 中的带负电荷的 Glu 产生排斥作用。Asp-281(7.32)也可能与 fMLFK 中的带正电荷的 Lys 形成稳定的相互作用。进行了定点突变以去除 FPR2 中位置 281 的负电荷。与野生型 FPR2 相比,D281(7.32)G 突变体对 fMLFE 和 fMLF 的亲和力提高,对 fMLFK 的亲和力降低。这些结果表明,FPR1 和 FPR2 用不同的结构决定因素与甲酰肽相互作用。