• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

希瓦氏菌 OmcA 的 X 射线晶体结构揭示了微生物-矿物界面的新见解。

The X-ray crystal structure of Shewanella oneidensis OmcA reveals new insight at the microbe-mineral interface.

机构信息

Centre for Molecular and Structural Biochemistry, School of Biological Sciences and School of Chemistry, University of East Anglia, Norwich NR4 7TJ, United Kingdom.

Environmental Sciences Division, Oak Ridge National Laboratory, Oak Ridge, TN 37831, USA.

出版信息

FEBS Lett. 2014 May 21;588(10):1886-90. doi: 10.1016/j.febslet.2014.04.013. Epub 2014 Apr 18.

DOI:10.1016/j.febslet.2014.04.013
PMID:24747425
Abstract

The X-ray crystal structure of Shewanella oneidensis OmcA, an extracellular decaheme cytochrome involved in mineral reduction, was solved to a resolution of 2.7 Å. The four OmcA molecules in the asymmetric unit are arranged so the minimum distance between heme 5 on adjacent OmcA monomers is 9 Å, indicative of a transient OmcA dimer capable of intermolecular electron transfer. A previously identified hematite binding motif was identified near heme 10, forming a hydroxylated surface that would bring a heme 10 electron egress site to ∼10 Å of a mineral surface.

摘要

希瓦氏菌属脱细胞十联体细胞色素 OmcA 的 X 射线晶体结构已解析至 2.7Å 的分辨率,该结构涉及矿物还原。在不对称单元中排列有四个 OmcA 分子,使得相邻 OmcA 单体上的 5 号血红素之间的最小距离为 9Å,这表明存在瞬态 OmcA 二聚体,能够进行分子间电子转移。在 10 号血红素附近鉴定出了一个先前确定的赤铁矿结合基序,形成了一个羟基化表面,将血红素 10 的电子出口位点带到距矿物表面约 10Å 的位置。

相似文献

1
The X-ray crystal structure of Shewanella oneidensis OmcA reveals new insight at the microbe-mineral interface.希瓦氏菌 OmcA 的 X 射线晶体结构揭示了微生物-矿物界面的新见解。
FEBS Lett. 2014 May 21;588(10):1886-90. doi: 10.1016/j.febslet.2014.04.013. Epub 2014 Apr 18.
2
Role of outer membrane c-type cytochromes MtrC and OmcA in Shewanella oneidensis MR-1 cell production, accumulation, and detachment during respiration on hematite.在外膜 c 型细胞色素 MtrC 和 OmcA 在 Shewanella oneidensis MR-1 细胞呼吸过程中在赤铁矿上的产生、积累和脱落中的作用。
Geobiology. 2012 Jul;10(4):355-70. doi: 10.1111/j.1472-4669.2012.00321.x. Epub 2012 Feb 23.
3
Structure of a bacterial cell surface decaheme electron conduit.细菌细胞表面十联体电子导管的结构。
Proc Natl Acad Sci U S A. 2011 Jun 7;108(23):9384-9. doi: 10.1073/pnas.1017200108. Epub 2011 May 23.
4
Characterization of the decaheme c-type cytochrome OmcA in solution and on hematite surfaces by small angle x-ray scattering and neutron reflectometry.通过小角 X 射线散射和中子反射测量法对溶液中和赤铁矿表面上的 decaheme c 型细胞色素 OmcA 的特性进行研究。
Biophys J. 2010 Jun 16;98(12):3035-43. doi: 10.1016/j.bpj.2010.03.049.
5
Isolation of a high-affinity functional protein complex between OmcA and MtrC: Two outer membrane decaheme c-type cytochromes of Shewanella oneidensis MR-1.分离奥姆卡蛋白(OmcA)和MtrC之间的高亲和力功能性蛋白复合物:希瓦氏菌属MR-1的两种外膜十血红素c型细胞色素。
J Bacteriol. 2006 Jul;188(13):4705-14. doi: 10.1128/JB.01966-05.
6
The crystal structure of the extracellular 11-heme cytochrome UndA reveals a conserved 10-heme motif and defined binding site for soluble iron chelates.细胞外 11 血红素细胞色素 UndA 的晶体结构揭示了一个保守的 10 血红素基序和一个明确的可溶性铁螯合物结合位点。
Structure. 2012 Jul 3;20(7):1275-84. doi: 10.1016/j.str.2012.04.016. Epub 2012 Jun 7.
7
Outer Membrane -Type Cytochromes OmcA and MtrC Play Distinct Roles in Enhancing the Attachment of MR-1 Cells to Goethite.外膜型细胞色素 OmcA 和 MtrC 在外膜囊泡形成和铜绿假单胞菌 MR-1 细胞附着于针铁矿过程中的作用
Appl Environ Microbiol. 2020 Nov 10;86(23). doi: 10.1128/AEM.01941-20.
8
Regulation of Gene Expression in Shewanella oneidensis MR-1 during Electron Acceptor Limitation and Bacterial Nanowire Formation.嗜铁钩端螺旋菌MR-1在电子受体限制和细菌纳米线形成过程中的基因表达调控
Appl Environ Microbiol. 2016 Aug 15;82(17):5428-43. doi: 10.1128/AEM.01615-16. Print 2016 Sep 1.
9
Targeted protein degradation of outer membrane decaheme cytochrome MtrC metal reductase in Shewanella oneidensis MR-1 measured using biarsenical probe CrAsH-EDT(2).使用双砷探针 CrAsH-EDT(2)测定希瓦氏菌属 MR-1 外膜 decaheme 细胞色素 MtrC 金属还原酶的靶向蛋白降解
Biochemistry. 2011 Nov 15;50(45):9738-51. doi: 10.1021/bi200602f. Epub 2011 Oct 25.
10
A kinetic approach to the dependence of dissimilatory metal reduction by Shewanella oneidensis MR-1 on the outer membrane cytochromes c OmcA and OmcB.一种关于嗜水气单胞菌MR-1异化金属还原对外膜细胞色素c OmcA和OmcB依赖性的动力学方法。
FEBS J. 2007 Jul;274(14):3728-3738. doi: 10.1111/j.1742-4658.2007.05907.x. Epub 2007 Jul 2.

引用本文的文献

1
Extracellular catalysis of environmental substrates by Shewanella oneidensis MR-1 occurs via active sites on the C-terminal domains of MtrC.嗜温栖热袍菌MR-1对环境底物的细胞外催化作用通过MtrC C末端结构域上的活性位点发生。
Protein Sci. 2025 Aug;34(8):e70243. doi: 10.1002/pro.70243.
2
Dynamic synthesis and transport of phenazine-1-carboxylic acid to boost extracellular electron transfer rate.吩嗪-1-羧酸的动态合成与转运以提高细胞外电子传递速率。
Nat Commun. 2025 Mar 25;16(1):2882. doi: 10.1038/s41467-025-57497-z.
3
Electron transfer in multicentre redox proteins: from fundamentals to extracellular electron transfer.
多中心氧化还原蛋白中的电子转移:从基础到细胞外电子转移
Biosci Rep. 2025 Jan 30;45(1):1-18. doi: 10.1042/BSR20240576.
4
A survey of the Desulfuromonadia "cytochromome" provides a glimpse of the unexplored diversity of multiheme cytochromes in nature.对脱硫单胞菌“细胞色素”的调查为我们了解自然界中多种血红素细胞色素的未知多样性提供了一个视角。
BMC Genomics. 2024 Oct 20;25(1):982. doi: 10.1186/s12864-024-10872-4.
5
Electron Transfer Mechanism at the Interface of Multi-Heme Cytochromes and Metal Oxide.多血红素细胞色素与金属氧化物界面的电子转移机制。
Adv Sci (Weinh). 2023 Oct;10(29):e2302670. doi: 10.1002/advs.202302670. Epub 2023 Aug 16.
6
The Outer Membrane Cytochrome OmcA Is Essential for Infection of Shewanella oneidensis by a Zebrafish-Associated Bacteriophage.外膜细胞色素 OmcA 对斑马鱼相关噬菌体感染希瓦氏菌至关重要。
J Bacteriol. 2023 Jun 27;205(6):e0046922. doi: 10.1128/jb.00469-22. Epub 2023 May 25.
7
Deciphering Molecular Factors That Affect Electron Transfer at the Cell Surface of Electroactive Bacteria: The Case of OmcA from MR-1.解析影响电活性细菌细胞表面电子转移的分子因素:以MR-1菌的OmcA为例。
Microorganisms. 2022 Dec 28;11(1):79. doi: 10.3390/microorganisms11010079.
8
Evidence for Horizontal and Vertical Transmission of Mtr-Mediated Extracellular Electron Transfer among the .证据表明 Mtr 介导的细胞外电子传递在 之间存在水平和垂直传播。
mBio. 2021 Feb 22;13(1):e0290421. doi: 10.1128/mbio.02904-21. Epub 2022 Feb 1.
9
The Proposed Molecular Mechanisms Used by Archaea for Fe(III) Reduction and Fe(II) Oxidation.古菌用于铁(III)还原和铁(II)氧化的推测分子机制。
Front Microbiol. 2021 Jul 1;12:690918. doi: 10.3389/fmicb.2021.690918. eCollection 2021.
10
Outer Membrane -Type Cytochromes OmcA and MtrC Play Distinct Roles in Enhancing the Attachment of MR-1 Cells to Goethite.外膜型细胞色素 OmcA 和 MtrC 在外膜囊泡形成和铜绿假单胞菌 MR-1 细胞附着于针铁矿过程中的作用
Appl Environ Microbiol. 2020 Nov 10;86(23). doi: 10.1128/AEM.01941-20.