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[蛋白质-蛋白质及蛋白质-核酸相互作用的研究方法及其在人肠道病毒A71研究中的应用]

[Research methods in protein-protein and protein-nucleic acid interactions and application in the study of human enterovirus A71].

作者信息

Zhang Zhi-Xiao, Zheng Ying, Hu Ting-Song, Li Qi-Han, Fan Quan-Shui

机构信息

enter for Disease Control and Prevention, Chengdu Military Region, Kunming, China.

出版信息

Bing Du Xue Bao. 2014 Sep;30(5):587-93.

PMID:25562971
Abstract

Methods for analyses of protein-protein interactions include: yeast two hybrid (Y2H), phage dis- play (PD), co-immunoprecipitation (Co-IP), glutathione S-transferase pull-down (GST pull-down), cellular co-localization, far-western blotting, virus overlay protein binding assay (VOPBA), surface plasmon resonance (SPR), and fluorescence resonance energy transfer (FRET). Technologies for the detection of protein-nucleic acid interactions include: yeast one hybrid (Y1H), chromatin immunoprecipitation (ChIP), electrophoretic mobility shift assay (EMSA), Southwestern blotting, reporter gene, Co-IP, GST pull-down, and PD. These methods are often used in the study of the human enterovirus A71 (EV-A71) by our research team. Reviews in the Chinese literature in this field are lacking, so we reviewed applications of these methods in the study of EV-A71. This review may impart important knowledge in the research of other viruses with regard to protein-protein and protein-nucleic acid interactions.

摘要

蛋白质-蛋白质相互作用的分析方法包括:酵母双杂交(Y2H)、噬菌体展示(PD)、免疫共沉淀(Co-IP)、谷胱甘肽S-转移酶下拉实验(GST下拉实验)、细胞共定位、远缘Western印迹法、病毒覆盖蛋白结合分析(VOPBA)、表面等离子体共振(SPR)和荧光共振能量转移(FRET)。蛋白质-核酸相互作用的检测技术包括:酵母单杂交(Y1H)、染色质免疫沉淀(ChIP)、电泳迁移率变动分析(EMSA)、Southwestern印迹法、报告基因、Co-IP、GST下拉实验和PD。我们的研究团队在人类肠道病毒A71(EV-A71)研究中经常使用这些方法。该领域中文文献缺乏综述,因此我们综述了这些方法在EV-A71研究中的应用。本综述可能会为其他病毒在蛋白质-蛋白质和蛋白质-核酸相互作用研究方面提供重要知识。

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