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艰难梭菌扩展多位点可变数目串联重复序列分析的新型多重格式与串联重复序列分型相关。

Novel multiplex format of an extended multilocus variable-number-tandem-repeat analysis of Clostridium difficile correlates with tandem repeat sequence typing.

作者信息

Jensen Mie Birgitte Frid, Engberg Jørgen, Larsson Jonas T, Olsen Katharina E P, Torpdahl Mia

机构信息

Department of Clinical Microbiology, Slagelse Hospital, Ingemannsvej 18, DK-4200 Slagelse, Denmark; Department of Microbiology and Infection Control, Statens Serum Institut, Artillerivej 5, DK-2300 Copenhagen, Denmark.

Department of Clinical Microbiology, Slagelse Hospital, Ingemannsvej 18, DK-4200 Slagelse, Denmark.

出版信息

J Microbiol Methods. 2015 Mar;110:98-101. doi: 10.1016/j.mimet.2015.01.018. Epub 2015 Jan 22.

DOI:10.1016/j.mimet.2015.01.018
PMID:25620018
Abstract

Subtyping of Clostridium difficile is crucial for outbreak investigations. An extended multilocus variable-number tandem-repeat analysis (eMLVA) of 14 variable number tandem repeat (VNTR) loci was validated in multiplex format compatible with a routine typing laboratory and showed excellent concordance with tandem repeat sequence typing (TRST) and high discriminatory power.

摘要

艰难梭菌的分型对于暴发调查至关重要。对14个可变数目串联重复序列(VNTR)位点进行的扩展多位点可变数目串联重复序列分析(eMLVA)以与常规分型实验室兼容的多重形式得到验证,并且与串联重复序列分型(TRST)显示出极好的一致性以及高鉴别力。

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