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新热带鲶鱼马格达莱纳平口鲶(鲇形目,油鲶科)的完整线粒体基因组

Complete mitochondrial genome of the Neotropical catfish Pseudoplatystoma magdaleniatum (Siluriformes, Pimelodidae).

作者信息

Rangel-Medrano Jose D, Alzate Juan F, Márquez Edna J

机构信息

a Facultad de Ciencias , Universidad Nacional de Colombia-Sede Medellín , Medellín , Colombia and.

b Facultad de Medicina , Centro Nacional de Secuenciación Genómica-CNSG, Universidad de Antioquia , Medellín , Colombia.

出版信息

Mitochondrial DNA A DNA Mapp Seq Anal. 2016 Nov;27(6):4033-4034. doi: 10.3109/19401736.2014.1003830. Epub 2015 Jan 28.

Abstract

The Neotropical freshwater fish Pseudoplatystoma magdaleniatum is a trans-Andean species that belongs to the family of long-whiskered catfishes (family Pimelodidae). In this study, the complete mitochondrial genome of P. magdaleniatum was sequenced using the MiSeq Illumina platform. The complete circular mitogenome is 16,568 bp in length, exhibiting an average GC content of 44.19% and codes for 13 proteins, 2 ribosomal RNA genes and 22 transfer RNA genes. Additionally, it exhibits perfect synteny and similar length with the mitogenome of Pimelodus pictus.

摘要

新热带淡水鱼马格达莱纳真须鲶是一种跨安第斯山脉的物种,属于长须鲶科(油鲶科)。在本研究中,利用Illumina MiSeq平台对马格达莱纳真须鲶的完整线粒体基因组进行了测序。完整的环状线粒体基因组长度为16,568 bp,平均GC含量为44.19%,编码13种蛋白质、2个核糖体RNA基因和22个转运RNA基因。此外,它与图氏油鲶的线粒体基因组具有完美的同线性和相似的长度。

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