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植物磷酸化蛋白质组学数据库

Databases for plant phosphoproteomics.

作者信息

Schulze Waltraud X, Yao Qiuming, Xu Dong

机构信息

Department of Plant Systems Biology, Universität Hohenheim, Stuttgart, 70593, Germany,

出版信息

Methods Mol Biol. 2015;1306:207-16. doi: 10.1007/978-1-4939-2648-0_16.

DOI:10.1007/978-1-4939-2648-0_16
PMID:25930705
Abstract

Phosphorylation is the most studied posttranslational modification involved in signal transduction in stress responses, development, and growth. In the recent years large-scale phosphoproteomic studies were carried out using various model plants and several growth and stress conditions. Here we present an overview of online resources for plant phosphoproteomic databases: PhosPhAt as a resource for Arabidopsis phosphoproteins, P3DB as a resource expanding to crop plants, and Medicago PhosphoProtein Database as a resource for the model plant Medicago trunculata.

摘要

磷酸化是应激反应、发育和生长过程中信号转导所涉及的研究最为深入的翻译后修饰。近年来,利用各种模式植物以及多种生长和胁迫条件开展了大规模的磷酸化蛋白质组学研究。在此,我们概述植物磷酸化蛋白质组学数据库的在线资源:作为拟南芥磷酸化蛋白质资源的PhosPhAt、扩展到作物植物的资源P3DB以及作为模式植物蒺藜苜蓿资源的苜蓿磷酸化蛋白质数据库。

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