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凸起的入侵探针:用于混合序列双链DNA识别的活化双链体,具有改善的热力学和动力学特征。

Bulged Invader probes: activated duplexes for mixed-sequence dsDNA recognition with improved thermodynamic and kinetic profiles.

作者信息

Guenther Dale C, Karmakar Saswata, Hrdlicka Patrick J

机构信息

Department of Chemistry, University of Idaho, 875 Perimeter Dr, Moscow, ID 83844-2343, USA.

出版信息

Chem Commun (Camb). 2015 Oct 18;51(81):15051-4. doi: 10.1039/c5cc06264k.

Abstract

Double-stranded oligonucleotides with +1 interstrand zipper arrangements of intercalator-functionalized nucleotides are energetically activated for recognition of mixed-sequence double-stranded DNA. Incorporation of nonyl (C9) bulges at specific positions of these probes, results in more highly affine (>5-fold), faster (>4-fold) and more persistent dsDNA recognition relative to conventional Invader probes.

摘要

具有嵌入剂功能化核苷酸的 +1 链间拉链排列的双链寡核苷酸在能量上被激活,用于识别混合序列双链 DNA。在这些探针的特定位置引入壬基(C9)凸起,相对于传统的入侵探针,可实现更高亲和力(>5 倍)、更快速度(>4 倍)和更持久的双链 DNA 识别。

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/180a/4589525/e7b531d6b9e3/nihms719477f1.jpg

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引用本文的文献

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