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加氏乳球菌菌株PAQ102015 - 99的基因组草图序列,该菌株是从美国西北部一家商业鳟鱼养殖场分离出的一株暴发菌株。

Draft Genome Sequence of Lactococcus garvieae Strain PAQ102015-99, an Outbreak Strain Isolated from a Commercial Trout Farm in the Northwestern United States.

作者信息

Nelson Michael C, Varney Jed S, Welch Timothy J, Graf Joerg

机构信息

Department of Molecular and Cell Biology, University of Connecticut, Storrs, Connecticut, USA.

Pacific Aquaculture, Nespelem, Washington, USA.

出版信息

Genome Announc. 2016 Aug 4;4(4):e00781-16. doi: 10.1128/genomeA.00781-16.

Abstract

We announce the draft genome assembly of Lactococcus garvieae strain PAQ102015-99, a recently isolated strain from an outbreak of lactococcosis at a commercial trout farm in the northwestern United States. The draft genome comprises 14 contigs totaling 2,068,357 bp with an N50 of 496,618 bp and average G+C content of 38%.

摘要

我们公布了格氏乳球菌PAQ102015 - 99菌株的基因组草图组装结果,该菌株是最近从美国西北部一家商业鳟鱼养殖场爆发的乳球菌病疫情中分离出来的。该基因组草图由14个重叠群组成,总长2,068,357 bp,N50为496,618 bp,平均G+C含量为38%。

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