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含有半乳糖修饰的 DNA、LNA 和 2'-氨基-LNA 单体的寡核苷酸的合成及生物物理研究。

Synthesis and Biophysical Investigations of Oligonucleotides Containing Galactose-Modified DNA, LNA, and 2'-Amino-LNA Monomers.

机构信息

Biomolecular Nanoscale Engineering Center, Department of Physics, Chemistry and Pharmacy, University of Southern Denmark , Campusvej 55, 5230 Odense M, Denmark.

Department of Bioorganic Chemistry, Instituto de Investigaciones Químicas, CSIC Universidad de Sevilla , Americo Vespucio 49, 41092 Sevilla, Spain.

出版信息

J Org Chem. 2016 Nov 18;81(22):10845-10856. doi: 10.1021/acs.joc.6b01917. Epub 2016 Oct 25.

DOI:10.1021/acs.joc.6b01917
PMID:27736097
Abstract

Galactose-modified thymidine, LNA-T, and 2'-amino-LNA-T nucleosides were synthesized, converted into the corresponding phosphoramidite derivatives and introduced into short oligonucleotides. Compared to the unmodified control strands, the galactose-modified oligonucleotides in general, and the N2'-functionalized 2'-amino-LNA derivatives in particular, showed improved duplex thermal stability against DNA and RNA complements and increased ability to discriminate mismatches. In addition, the 2'-amino-LNA-T derivatives induced remarkable 3'-exonuclease resistance. These results were further investigated using molecular modeling studies.

摘要

半乳糖修饰的胸苷、LNA-T 和 2'-氨基-LNA-T 核苷被合成,并转化为相应的磷酰胺衍生物,然后引入短寡核苷酸中。与未修饰的对照链相比,半乳糖修饰的寡核苷酸通常,特别是 N2'-功能化的 2'-氨基-LNA 衍生物,表现出与 DNA 和 RNA 互补物的热稳定性提高,并增加了区分错配的能力。此外,2'-氨基-LNA-T 衍生物诱导了显著的 3'-核酸外切酶抗性。这些结果通过分子建模研究进一步进行了研究。

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