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脉冲式稳定同位素标记氨基酸细胞培养技术作为一种在细胞培养中鉴定微小RNA靶点的方法。

Pulsed SILAC as a Approach for miRNA Targets Identification in Cell Culture.

作者信息

Duque-Guimarães Daniella E, de Almeida-Faria Juliana, Ong Thomas Prates, Ozanne Susan E

机构信息

University of Cambridge Metabolic Research Laboratories and MRC Metabolic Diseases Unit, Wellcome Trust-MRC Institute of Metabolic Science, Addenbrooke's Hospital, Cambridge, UK.

Department of Physiology and Biophysics, Institute of Biomedical Sciences, University of São Paulo, São Paulo, Brazil.

出版信息

Methods Mol Biol. 2017;1546:149-159. doi: 10.1007/978-1-4939-6730-8_11.

DOI:10.1007/978-1-4939-6730-8_11
PMID:27896764
Abstract

Pulsed stable isotope labeling by amino acids in cell culture (pSILAC) comprises a variation of the classical SILAC proteomic methodology that enables the identification of short-term proteomic responses such as those elicited by micro RNAs (miRNAs). Here, we describe a detailed pSILAC protocol for global identification and quantification of protein translation alterations induced by a miRNA using 3T3-L1 pre-adipocytes as a model system.

摘要

细胞培养中氨基酸脉冲稳定同位素标记(pSILAC)是经典SILAC蛋白质组学方法的一种变体,可用于识别短期蛋白质组反应,如由微小RNA(miRNA)引发的反应。在此,我们描述了一种详细的pSILAC方案,以3T3-L1前脂肪细胞为模型系统,用于全面鉴定和定量由miRNA诱导的蛋白质翻译变化。

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