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我的基因组浏览器：构建并共享你自己的基因组浏览器。

myGenomeBrowser: building and sharing your own genome browser.

作者信息

Carrere Sébastien, Gouzy Jérôme

出版信息

Bioinformatics. 2017 Apr 15;33(8):1255-1257. doi: 10.1093/bioinformatics/btw800.

DOI:10.1093/bioinformatics/btw800
PMID:28011789
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC5408841/
Abstract

UNLABELLED

myGenomeBrowser is a web-based environment that provides biologists with a way to build, query and share their genome browsers. This tool, that builds on JBrowse, is designed to give users more autonomy while simplifying and minimizing intervention from system administrators. We have extended genome browser basic features to allow users to query, analyze and share their data.

AVAILABILITY AND IMPLEMENTATION

myGenomeBrowser is freely available at https://bbric-pipelines.toulouse.inra.fr/myGenomeBrowser and includes tutorial screencasts. Source code and installation instructions can be found at https://framagit.org/BBRIC/myGenomeBrowser . myGenomeBrowser is open-source and mainly implemented in Perl, JavaScript, Apache and Docker.

CONTACT

sebastien.carrere@inra.fr.

摘要

未标记

myGenomeBrowser是一个基于网络的环境，为生物学家提供构建、查询和共享其基因组浏览器的方法。该工具基于JBrowse构建，旨在给予用户更多自主权，同时简化并尽量减少系统管理员的干预。我们扩展了基因组浏览器的基本功能，以允许用户查询、分析和共享他们的数据。

可用性和实现方式

myGenomeBrowser可在https://bbric-pipelines.toulouse.inra.fr/myGenomeBrowser免费获取，其中包括教程屏幕录像。源代码和安装说明可在https://framagit.org/BBRIC/myGenomeBrowser找到。myGenomeBrowser是开源的，主要用Perl、JavaScript、Apache和Docker实现。

联系方式

sebastien.carrere@inra.fr