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相似文献

1
Identification of NAD+ capped mRNAs in Saccharomyces cerevisiae.酿酒酵母中NAD⁺封端mRNA的鉴定。
Proc Natl Acad Sci U S A. 2017 Jan 17;114(3):480-485. doi: 10.1073/pnas.1619369114. Epub 2016 Dec 28.
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Extensive 5'-surveillance guards against non-canonical NAD-caps of nuclear mRNAs in yeast.广泛的 5' 监控可防止酵母核 mRNA 的非规范 NAD 帽。
Nat Commun. 2020 Nov 2;11(1):5508. doi: 10.1038/s41467-020-19326-3.
3
Xrn1 is a deNADding enzyme modulating mitochondrial NAD-capped RNA.Xrn1 是一种去 NAD 酶,可调节线粒体 NAD 帽 RNA。
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Pokeweed antiviral protein binds to the cap structure of eukaryotic mRNA and depurinates the mRNA downstream of the cap.商陆抗病毒蛋白与真核生物mRNA的帽结构结合,并使帽下游的mRNA脱嘌呤。
RNA. 2002 Sep;8(9):1148-59. doi: 10.1017/s1355838202026638.
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Identification of a quality-control mechanism for mRNA 5'-end capping.鉴定 mRNA 5'端加帽的质量控制机制。
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Decoying the cap- mRNA degradation system by a double-stranded RNA virus and poly(A)- mRNA surveillance by a yeast antiviral system.双链RNA病毒对帽状mRNA降解系统的诱骗以及酵母抗病毒系统对聚腺苷酸化mRNA的监测。
Mol Cell Biol. 1995 May;15(5):2763-71. doi: 10.1128/MCB.15.5.2763.
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RNA. 2012 Aug;18(8):1563-72. doi: 10.1261/rna.033779.112. Epub 2012 Jul 2.
8
Eukaryotic RNA 5'-End NAD Capping and DeNADding.真核 RNA 5′-端 NAD 加帽和去 NAD 化。
Trends Cell Biol. 2018 Jun;28(6):454-464. doi: 10.1016/j.tcb.2018.02.005. Epub 2018 Mar 12.
9
Nuclear pre-mRNA decapping and 5' degradation in yeast require the Lsm2-8p complex.酵母中的核前体mRNA去帽和5'端降解需要Lsm2-8p复合体。
Mol Cell Biol. 2004 Nov;24(21):9646-57. doi: 10.1128/MCB.24.21.9646-9657.2004.
10
Highly efficient 5' capping of mitochondrial RNA with NAD and NADH by yeast and human mitochondrial RNA polymerase.酵母和人线粒体 RNA 聚合酶对线粒体 RNA 的高效 5' 加帽作用,NAD 和 NADH。
Elife. 2018 Dec 12;7:e42179. doi: 10.7554/eLife.42179.

引用本文的文献

1
Structural insights into polymerase-catalyzed FAD capping of hepatitis C virus RNA.丙型肝炎病毒RNA聚合酶催化FAD加帽的结构见解
Nat Commun. 2025 Aug 7;16(1):7298. doi: 10.1038/s41467-025-62609-w.
2
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Nat Commun. 2025 Jul 20;16(1):6676. doi: 10.1038/s41467-025-61697-y.
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A short ncRNA modulates gene expression and affects stress response and parasite differentiation in .一种短链非编码RNA调节基因表达,并影响应激反应和寄生虫分化。
Front Cell Infect Microbiol. 2025 Feb 5;15:1513908. doi: 10.3389/fcimb.2025.1513908. eCollection 2025.
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Pathobiochemistry of Aging and Neurodegeneration: Deregulation of NAD+ Metabolism in Brain Cells.衰老与神经退行性变的病理生物化学:脑细胞中NAD+代谢的失调
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The Mysterious World of Non-Canonical Caps - What We Know and Why We Need New Sequencing Techniques.非经典帽的神秘世界——我们所知道的以及我们为何需要新的测序技术
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RNA Biol. 2024 Jan;21(1):1-13. doi: 10.1080/15476286.2024.2372138. Epub 2024 Jul 15.
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ACS Chem Biol. 2024 Jun 21;19(6):1243-1249. doi: 10.1021/acschembio.4c00151. Epub 2024 May 15.
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本文引用的文献

1
The mechanism of RNA 5′ capping with NAD+, NADH and desphospho-CoA.RNA 5′端与NAD+、NADH及去磷酸辅酶A进行加帽修饰的机制。
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The dynamic N(1)-methyladenosine methylome in eukaryotic messenger RNA.真核生物信使核糖核酸中的动态N(1)-甲基腺苷甲基化组
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5' UTR m(6)A Promotes Cap-Independent Translation.5'非翻译区N6-甲基腺苷促进不依赖帽子结构的翻译。
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NAD captureSeq indicates NAD as a bacterial cap for a subset of regulatory RNAs.NAD captureSeq 表明 NAD 是一组调控 RNA 的细菌帽。
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Trimmomatic: a flexible trimmer for Illumina sequence data.Trimmomatic:一款适用于 Illumina 测序数据的灵活修剪工具。
Bioinformatics. 2014 Aug 1;30(15):2114-20. doi: 10.1093/bioinformatics/btu170. Epub 2014 Apr 1.

酿酒酵母中NAD⁺封端mRNA的鉴定。

Identification of NAD+ capped mRNAs in Saccharomyces cerevisiae.

作者信息

Walters Robert W, Matheny Tyler, Mizoue Laura S, Rao Bhalchandra S, Muhlrad Denise, Parker Roy

机构信息

Department of Chemistry and Biochemistry, University of Colorado Boulder, Boulder, CO 80303.

Howard Hughes Medical Institute, University of Colorado Boulder, Boulder, CO 80303.

出版信息

Proc Natl Acad Sci U S A. 2017 Jan 17;114(3):480-485. doi: 10.1073/pnas.1619369114. Epub 2016 Dec 28.

DOI:10.1073/pnas.1619369114
PMID:28031484
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC5255579/
Abstract

RNAs besides tRNA and rRNA contain chemical modifications, including the recently described 5' nicotinamide-adenine dinucleotide (NAD) RNA in bacteria. Whether 5' NAD-RNA exists in eukaryotes remains unknown. We demonstrate that 5' NAD-RNA is found on subsets of nuclear and mitochondrial encoded mRNAs in Saccharomyces cerevisiae NAD-mRNA appears to be produced cotranscriptionally because NAD-RNA is also found on pre-mRNAs, and only on mitochondrial transcripts that are not 5' end processed. These results define an additional 5' RNA cap structure in eukaryotes and raise the possibility that this 5' NAD cap could modulate RNA stability and translation on specific subclasses of mRNAs.

摘要

除了转运RNA(tRNA)和核糖体RNA(rRNA)之外,核糖核酸(RNA)还含有化学修饰,包括细菌中最近描述的5'-烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(NAD)RNA。真核生物中是否存在5'-NAD-RNA仍然未知。我们证明,在酿酒酵母中,5'-NAD-RNA存在于核编码和线粒体编码的信使核糖核酸(mRNA)亚群上。NAD-mRNA似乎是在转录过程中产生的,因为在信使前体核糖核酸(pre-mRNA)上也发现了NAD-RNA,并且仅在线粒体转录本上发现,这些转录本的5'端未经过加工。这些结果定义了真核生物中一种额外的5'RNA帽结构,并增加了这种5'-NAD帽可能调节特定mRNA亚类的RNA稳定性和翻译的可能性。