• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利：CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法，用中文像聊天一样搜索，搜遍4000万医学文献。AI智能推荐，让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版，准确专业，支持PDF/Word/PPT等文件格式，支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述，25分钟生成高质量综述，智能提取关键信息，辅助科研写作。

立即免费体验

相似文献

1
The incredible complexity of RNA splicing.RNA剪接的惊人复杂性。
Genome Biol. 2016 Dec 30;17(1):265. doi: 10.1186/s13059-016-1121-y.
2
Human splicing diversity and the extent of unannotated splice junctions across human RNA-seq samples on the Sequence Read Archive.人类剪接多样性以及序列读取存档中人类RNA测序样本间未注释剪接位点的程度。
Genome Biol. 2016 Dec 30;17(1):266. doi: 10.1186/s13059-016-1118-6.
3
Deep RNA sequencing reveals a high frequency of alternative splicing events in the fungus Trichoderma longibrachiatum.深度RNA测序揭示了长枝木霉中可变剪接事件的高频率。
BMC Genomics. 2015 Feb 6;16(1):54. doi: 10.1186/s12864-015-1251-8.
4
Observations on novel splice junctions from RNA sequencing data.从 RNA 测序数据中观察新的剪接接头。
Biochem Biophys Res Commun. 2011 Jun 3;409(2):299-303. doi: 10.1016/j.bbrc.2011.05.005. Epub 2011 May 7.
5
Ultra-deep sequencing reveals pre-mRNA splicing as a sequence driven high-fidelity process.超深度测序揭示了前体 mRNA 剪接作为一个序列驱动的高保真过程。
PLoS One. 2019 Oct 3;14(10):e0223132. doi: 10.1371/journal.pone.0223132. eCollection 2019.
6
Read-Split-Run: an improved bioinformatics pipeline for identification of genome-wide non-canonical spliced regions using RNA-Seq data.读取-分割-运行：一种利用RNA测序数据识别全基因组非经典剪接区域的改进型生物信息学流程。
BMC Genomics. 2016 Aug 22;17 Suppl 7(Suppl 7):503. doi: 10.1186/s12864-016-2896-7.
7
Subcutaneous adipose tissue splice quantitative trait loci reveal differences in isoform usage associated with cardiometabolic traits.皮下脂肪组织剪接数量性状基因座揭示了与心脏代谢特征相关的异构体使用差异。
Am J Hum Genet. 2022 Jan 6;109(1):66-80. doi: 10.1016/j.ajhg.2021.11.019.
8
Widespread splicing of repetitive element loci into coding regions of gene transcripts.重复元件位点广泛剪接到基因转录本的编码区域。
Hum Mol Genet. 2016 Nov 15;25(22):4962-4982. doi: 10.1093/hmg/ddw321.
9
Studying Isoform-Specific mRNA Recruitment to Polyribosomes with Frac-seq.使用Frac-seq研究特定异构体mRNA募集到多核糖体的情况。
Methods Mol Biol. 2016;1358:99-108. doi: 10.1007/978-1-4939-3067-8_6.
10
Ranking noncanonical 5' splice site usage by genome-wide RNA-seq analysis and splicing reporter assays.通过全基因组 RNA-seq 分析和剪接报告基因实验对非规范 5' 剪接位点的使用进行排名。
Genome Res. 2018 Dec;28(12):1826-1840. doi: 10.1101/gr.235861.118. Epub 2018 Oct 24.

引用本文的文献

1
Looking beyond the ER, PR, and HER2: what's new in the ARsenal for combating breast cancer?超越雌激素受体（ER）、孕激素受体（PR）和人表皮生长因子受体2（HER2）：对抗乳腺癌的武器库中有哪些新进展？
Reprod Biol Endocrinol. 2025 Jan 20;23(1):9. doi: 10.1186/s12958-024-01338-z.
2
Androgen receptor and its splice variant, AR-V7, differentially induce mRNA splicing in prostate cancer cells.雄激素受体及其剪接变体 AR-V7，在前列腺癌细胞中差异诱导 mRNA 剪接。
Sci Rep. 2021 Jan 14;11(1):1393. doi: 10.1038/s41598-021-81164-0.
3
Insights into Telomerase/hTERT Alternative Splicing Regulation Using Bioinformatics and Network Analysis in Cancer.利用生物信息学和网络分析深入了解癌症中端粒酶/hTERT的可变剪接调控
Cancers (Basel). 2019 May 14;11(5):666. doi: 10.3390/cancers11050666.
4
Prognostic value and potential function of splicing events in prostate adenocarcinoma.前列腺腺癌中剪接事件的预后价值和潜在功能。
Int J Oncol. 2018 Dec;53(6):2473-2487. doi: 10.3892/ijo.2018.4563. Epub 2018 Sep 17.

本文引用的文献

1
Human splicing diversity and the extent of unannotated splice junctions across human RNA-seq samples on the Sequence Read Archive.人类剪接多样性以及序列读取存档中人类RNA测序样本间未注释剪接位点的程度。
Genome Biol. 2016 Dec 30;17(1):266. doi: 10.1186/s13059-016-1118-6.
2
GO-FAANG meeting: a Gathering On Functional Annotation of Animal Genomes.GO-FAANG会议：动物基因组功能注释研讨会
Anim Genet. 2016 Oct;47(5):528-33. doi: 10.1111/age.12466. Epub 2016 Jul 24.
3
Errors in RNA-Seq quantification affect genes of relevance to human disease.RNA测序定量中的误差会影响与人类疾病相关的基因。
Genome Biol. 2015 Sep 3;16(1):177. doi: 10.1186/s13059-015-0734-x.
4
Detection of recurrent alternative splicing switches in tumor samples reveals novel signatures of cancer.肿瘤样本中复发性可变剪接开关的检测揭示了癌症的新特征。
Nucleic Acids Res. 2015 Feb 18;43(3):1345-56. doi: 10.1093/nar/gku1392. Epub 2015 Jan 10.
5
Design and development of exome capture sequencing for the domestic pig (Sus scrofa).家猪（Sus scrofa）外显子捕获测序的设计与开发。
BMC Genomics. 2014 Jul 3;15(1):550. doi: 10.1186/1471-2164-15-550.
6
Transcriptome and genome sequencing uncovers functional variation in humans.转录组和基因组测序揭示了人类功能变异。
Nature. 2013 Sep 26;501(7468):506-11. doi: 10.1038/nature12531. Epub 2013 Sep 15.
7
An integrated encyclopedia of DNA elements in the human genome.人类基因组中 DNA 元件的综合百科全书。
Nature. 2012 Sep 6;489(7414):57-74. doi: 10.1038/nature11247.
8
The NIH Roadmap Epigenomics Mapping Consortium.美国国立卫生研究院（NIH）路线图表观基因组学图谱联盟。
Nat Biotechnol. 2010 Oct;28(10):1045-8. doi: 10.1038/nbt1010-1045.
9
An exon skipping-associated nonsense mutation in the dystrophin gene uncovers a complex interplay between multiple antagonistic splicing elements.肌营养不良蛋白基因中一个与外显子跳跃相关的无义突变揭示了多个拮抗剪接元件之间的复杂相互作用。
Hum Mol Genet. 2006 Mar 15;15(6):999-1013. doi: 10.1093/hmg/ddl015. Epub 2006 Feb 6.
10
Nuclear factor TDP-43 binds to the polymorphic TG repeats in CFTR intron 8 and causes skipping of exon 9: a functional link with disease penetrance.核因子TDP-43与囊性纤维化跨膜传导调节因子（CFTR）第8内含子中的多态性TG重复序列结合，导致第9外显子跳跃：与疾病外显率的功能联系。
Am J Hum Genet. 2004 Jun;74(6):1322-5. doi: 10.1086/420978.

RNA剪接的惊人复杂性。

The incredible complexity of RNA splicing.

作者信息

Robert Christelle, Watson Mick

机构信息

The Roslin Institute and Royal (Dick) School of Veterinary Studies, University of Edinburgh, Edinburgh, UK.

出版信息

Genome Biol. 2016 Dec 30;17(1):265. doi: 10.1186/s13059-016-1121-y.

DOI:10.1186/s13059-016-1121-y
PMID:28038679
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC5203710/
Abstract

Alternative splice isoforms are common and important and have been shown to impact many human diseases. A new study by Nellore et al. offers a comprehensive study of splice junctions in humans by re-analyzing over 21,500 public human RNA sequencing datasets.

摘要

可变剪接异构体普遍且重要，已被证明会影响许多人类疾病。内洛尔等人的一项新研究通过重新分析超过21500个公开的人类RNA测序数据集，对人类的剪接位点进行了全面研究。