Suppr超能文献

ProtVista:蛋白质序列注释的可视化。

ProtVista: visualization of protein sequence annotations.

机构信息

EMBL-EBI, Hinxton, UK.

Open Targets Wellcome Genome Campus, Hinxton, Cambridgeshire CB10 1SD, UK.

出版信息

Bioinformatics. 2017 Jul 1;33(13):2040-2041. doi: 10.1093/bioinformatics/btx120.

Abstract

SUMMARY

ProtVista is a comprehensive visualization tool for the graphical representation of protein sequence features in the UniProt Knowledgebase, experimental proteomics and variation public datasets. The complexity and relationships in this wealth of data pose a challenge in interpretation. Integrative visualization approaches such as provided by ProtVista are thus essential for researchers to understand the data and, for instance, discover patterns affecting function and disease associations.

AVAILABILITY AND IMPLEMENTATION

ProtVista is a JavaScript component released as an open source project under the Apache 2 License. Documentation and source code are available at http://ebi-uniprot.github.io/ProtVista/ .

CONTACT

martin@ebi.ac.uk.

SUPPLEMENTARY INFORMATION

Supplementary data are available at Bioinformatics online.

摘要

摘要

ProtVista 是一个全面的可视化工具,用于在 UniProt 知识库、实验蛋白质组学和变异公共数据集中图形化表示蛋白质序列特征。这些丰富数据中的复杂性和关系给解释带来了挑战。因此,ProtVista 等综合可视化方法对于研究人员理解数据,例如发现影响功能和疾病关联的模式至关重要。

可用性和实现

ProtVista 是一个 JavaScript 组件,作为 Apache 2 许可证下的开源项目发布。文档和源代码可在 http://ebi-uniprot.github.io/ProtVista/ 获得。

联系人

martin@ebi.ac.uk

补充信息

补充数据可在“Bioinformatics”在线获取。

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/9e81/5963392/f00dc4d09de3/btx120f1.jpg

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