相似文献
1
Finding useful data across multiple biomedical data repositories using DataMed.利用 DataMed 在多个生物医学数据存储库中查找有用数据。
Nat Genet. 2017 May 26;49(6):816-819. doi: 10.1038/ng.3864.
2
SATORI: a system for ontology-guided visual exploration of biomedical data repositories.SATORI：一个用于本体指导的生物医学数据存储库可视化探索系统。
Bioinformatics. 2018 Apr 1;34(7):1200-1207. doi: 10.1093/bioinformatics/btx739.
3
Extensible biosignal metadata a model for physiological time-series data.可扩展生物信号元数据：一种生理时间序列数据模型。
Annu Int Conf IEEE Eng Med Biol Soc. 2009;2009:3881-4. doi: 10.1109/IEMBS.2009.5332642.
4
KaBOB: ontology-based semantic integration of biomedical databases.KaBOB：基于本体的生物医学数据库语义集成
BMC Bioinformatics. 2015 Apr 23;16(1):126. doi: 10.1186/s12859-015-0559-3.
5
A method and software framework for enriching private biomedical sources with data from public online repositories.一种利用来自公共在线知识库的数据丰富私人生物医学数据源的方法和软件框架。
J Biomed Inform. 2016 Apr;60:177-86. doi: 10.1016/j.jbi.2016.02.004. Epub 2016 Feb 10.
6
Toward a view-oriented approach for aligning RDF-based biomedical repositories.迈向一种基于视图的方法来对齐基于RDF的生物医学知识库。
Methods Inf Med. 2015;54(1):50-5. doi: 10.3414/ME13-02-0020. Epub 2014 Apr 29.
7
Using association rule mining and ontologies to generate metadata recommendations from multiple biomedical databases.使用关联规则挖掘和本体生成来自多个生物医学数据库的元数据推荐。
Database (Oxford). 2019 Jan 1;2019. doi: 10.1093/database/baz059.
8
From bytes to bedside: data integration and computational biology for translational cancer research.从字节到床边：用于转化癌症研究的数据整合与计算生物学
PLoS Comput Biol. 2007 Feb 23;3(2):e12. doi: 10.1371/journal.pcbi.0030012.
9
DataMed - an open source discovery index for finding biomedical datasets.DataMed——一个用于查找生物医学数据集的开源发现索引。
J Am Med Inform Assoc. 2018 Mar 1;25(3):300-308. doi: 10.1093/jamia/ocx121.
10
SCALEUS-FD: A FAIR Data Tool for Biomedical Applications.SCALEUS-FD：用于生物医学应用的公平数据工具。
Biomed Res Int. 2020 Aug 26;2020:3041498. doi: 10.1155/2020/3041498. eCollection 2020.
引用本文的文献
1
Using semantic search to find publicly available gene-expression datasets.使用语义搜索来查找公开可用的基因表达数据集。
bioRxiv. 2025 Mar 15:2025.03.13.643153. doi: 10.1101/2025.03.13.643153.
2
Pathway-based, reaction-specific annotation of disease variants for elucidation of molecular phenotypes.基于通路的、针对疾病变异的反应特异性注释，以阐明分子表型。
Database (Oxford). 2024 May 7;2024. doi: 10.1093/database/baae031.
3
Towards Machine-FAIR: Representing software and datasets to facilitate reuse and scientific discovery by machines.迈向机器 FAIR：通过机器来表示软件和数据集，以促进其重复利用和科学发现。
J Biomed Inform. 2024 Jun;154:104647. doi: 10.1016/j.jbi.2024.104647. Epub 2024 Apr 30.
4
Joint Representation Learning for Retrieval and Annotation of Genomic Interval Sets.用于基因组区间集检索和注释的联合表示学习
Bioengineering (Basel). 2024 Mar 8;11(3):263. doi: 10.3390/bioengineering11030263.
5
Applying Findable, Accessible, Interoperable, and Reusable Principles to Biospecimens and Biobanks.将可查找、可访问、可互操作和可重用原则应用于生物样本和生物样本库。
Biopreserv Biobank. 2024 Dec;22(6):550-556. doi: 10.1089/bio.2023.0110. Epub 2024 Feb 12.
6
The Translational Data Catalog - discoverable biomedical datasets.转化型数据目录 - 可发现的生物医学数据集。
Sci Data. 2023 Jul 20;10(1):470. doi: 10.1038/s41597-023-02258-0.
7
FAIRness through automation: development of an automated medical data integration infrastructure for FAIR health data in a maximum care university hospital.通过自动化实现公平性：为最大关怀型大学医院的 FAIR 健康数据开发自动化医疗数据集成基础设施。
BMC Med Inform Decis Mak. 2023 May 15;23(1):94. doi: 10.1186/s12911-023-02195-3.
8
Towards self-describing and FAIR bulk formats for biomedical data.朝着生物医学数据的自我描述和 FAIR 批量格式发展。
PLoS Comput Biol. 2023 Mar 13;19(3):e1010944. doi: 10.1371/journal.pcbi.1010944. eCollection 2023 Mar.
9
Addressing barriers in FAIR data practices for biomedical data.解决生物医学数据的公平数据实践中的障碍。
Sci Data. 2023 Feb 23;10(1):98. doi: 10.1038/s41597-023-01969-8.
10
Developing a standardized but extendable framework to increase the findability of infectious disease datasets.开发一个标准化但可扩展的框架，以提高传染病数据集的可发现性。
Sci Data. 2023 Feb 23;10(1):99. doi: 10.1038/s41597-023-01968-9.
本文引用的文献
1
DATS, the data tag suite to enable discoverability of datasets.DATS，用于实现数据集可发现性的数据标签套件。
Sci Data. 2017 Jun 6;4:170059. doi: 10.1038/sdata.2017.59.
2
Discovering and linking public omics data sets using the Omics Discovery Index.使用组学发现指数发现并链接公共组学数据集。
Nat Biotechnol. 2017 May 9;35(5):406-409. doi: 10.1038/nbt.3790.
3
The FAIR Guiding Principles for scientific data management and stewardship.科学数据管理和保存的 FAIR 指导原则。
Sci Data. 2016 Mar 15;3:160018. doi: 10.1038/sdata.2016.18.
4
The NIH Big Data to Knowledge (BD2K) initiative.美国国立卫生研究院大数据到知识（BD2K）计划。
J Am Med Inform Assoc. 2015 Nov;22(6):1114. doi: 10.1093/jamia/ocv136.
5
Policy: NIH plans to enhance reproducibility.政策：NIH 计划提高可重复性。
Nature. 2014 Jan 30;505(7485):612-3. doi: 10.1038/505612a.
6
PubMed and beyond: a survey of web tools for searching biomedical literature.PubMed 及其他：生物医学文献检索网络工具调查。
Database (Oxford). 2011 Jan 18;2011:baq036. doi: 10.1093/database/baq036. Print 2011.
7
PDBML: the representation of archival macromolecular structure data in XML.PDBML：以XML形式表示的存档大分子结构数据
Bioinformatics. 2005 Apr 1;21(7):988-92. doi: 10.1093/bioinformatics/bti082. Epub 2004 Oct 27.
Zotero 插件