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一个用于查询基于网络的注释工具的R包。

: an R package for querying web-based annotation tools.

作者信息

Zhbannikov Ilya Y, Arbeev Konstantin, Ukraintseva Svetlana, Yashin Anatoliy I

机构信息

Biodemography of Aging Research Unit (BARU) at Social Science Research Institute, Duke University, Durham, NC, USA.

Duke Population Research Institute, Duke University, Durham, NC, USA.

出版信息

F1000Res. 2017 Feb 1;6:97. doi: 10.12688/f1000research.10742.2. eCollection 2017.

DOI:10.12688/f1000research.10742.2
PMID:28620455
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC5461892/
Abstract

We developed , an R package for querying web based genome annotation tools HaploReg and RegulomeDB. gathers information in a data frame which is suitable for downstream bioinformatic analyses. This will facilitate post-genome wide association studies streamline analysis for rapid discovery and interpretation of genetic associations.

摘要

我们开发了一个R包，用于查询基于网络的基因组注释工具HaploReg和RegulomeDB。该R包将信息收集到一个适合下游生物信息学分析的数据框中。这将有助于在全基因组关联研究后简化分析，以便快速发现和解释基因关联。