• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

从南非纳马夸兰灌木地土壤中分离出的CRA2菌株的基因组序列草图。

The draft genome sequence of sp. CRA2 isolated from Nama Karoo shrub land soils from South Africa.

作者信息

Kabwe Mubanga H, Govender Nerissa, Vikram Surendra, Bezuidt Oliver M, Makhalanyane Thulani P

机构信息

Centre for Microbial Ecology and Genomics, University of Pretoria, Pretoria 0028, South Africa.

Department of Microbiology and Plant Pathology, University of Pretoria, Pretoria 0028, South Africa.

出版信息

Genom Data. 2017 Jun 8;13:21-23. doi: 10.1016/j.gdata.2017.06.001. eCollection 2017 Sep.

DOI:10.1016/j.gdata.2017.06.001
PMID:28652974
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC5476970/
Abstract

Here we report the draft genome sequence of sp. CRA2 isolated from the Nama Karoo shrub land soils of the Northern Cape, South Africa. This genome is approximately 5.88 Mb long and the assembly comprised 45 contigs. The draft genome sequence has been deposited in DDBJ/EMBL/GenBank under the accession number NZ_MVBC00000000 and is available for download at: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NZ_MVBC00000000.1.

摘要

在此,我们报告从南非北开普省纳马夸鲁灌木地土壤中分离出的 sp. CRA2 的基因组序列草图。该基因组长度约为 588 万个碱基对,组装后包含 45 个重叠群。该基因组序列草图已存入 DDBJ/EMBL/GenBank,登录号为 NZ_MVBC00000000,可在以下网址下载:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NZ_MVBC00000000.1 。

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/8e79/5476970/394c8debc53a/gr2.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/8e79/5476970/039209102e18/gr1.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/8e79/5476970/394c8debc53a/gr2.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/8e79/5476970/039209102e18/gr1.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/8e79/5476970/394c8debc53a/gr2.jpg

相似文献

1
The draft genome sequence of sp. CRA2 isolated from Nama Karoo shrub land soils from South Africa.从南非纳马夸兰灌木地土壤中分离出的CRA2菌株的基因组序列草图。
Genom Data. 2017 Jun 8;13:21-23. doi: 10.1016/j.gdata.2017.06.001. eCollection 2017 Sep.
2
Draft genome sequence of sp. KIM isolated from South African grassland biome soils.从南非草原生物群落土壤中分离出的[物种名称]KIM的基因组序列草图。 (这里原文“sp.”未明确写出具体物种名称,可根据实际情况补充完整准确的物种中文名)
Genom Data. 2017 Jun 10;13:24-26. doi: 10.1016/j.gdata.2017.06.002. eCollection 2017 Sep.
3
Draft genome sequence of . Gus2-1 isolated from the hot-spring Gusikha in Bargusin Valley (Baikal Rift Zone, Russia).从俄罗斯贝加尔裂谷带巴尔古辛山谷的热泉古西哈分离出的 Gus2-1 的基因组序列草图。
Genom Data. 2016 Nov 14;11:1-2. doi: 10.1016/j.gdata.2016.11.014. eCollection 2017 Mar.
4
Draft genome sequence data of strain GM, isolated from potato phyllosphere as a potential probiotic.从马铃薯叶际分离出的潜在益生菌GM菌株的基因组序列数据草案。
Data Brief. 2018 Nov 24;21:2504-2509. doi: 10.1016/j.dib.2018.11.107. eCollection 2018 Dec.
5
Draft genome sequence data of a tigecycline-resistant ST93 clinical strain isolated from bloodstream infection.从血流感染中分离出的一株耐替加环素ST93临床菌株的基因组序列数据草案。
Data Brief. 2018 Oct 5;21:414-418. doi: 10.1016/j.dib.2018.10.004. eCollection 2018 Dec.
6
Draft genome sequence of KU2-6-11 isolated from hot-spring in Uzon caldera (Kamchatka, Russia).从俄罗斯堪察加半岛乌宗火山口温泉中分离出的KU2-6-11的基因组序列草图。
Data Brief. 2017 Dec 6;16:758-761. doi: 10.1016/j.dib.2017.11.095. eCollection 2018 Feb.
7
Draft genome sequence data and analysis of sp. strain EE-P12 isolated from a laboratory-scale anaerobic reactor.从实验室规模厌氧反应器中分离出的[具体物种名]菌株EE-P12的基因组序列数据草案及分析
Data Brief. 2018 Nov 26;21:2576-2580. doi: 10.1016/j.dib.2018.11.104. eCollection 2018 Dec.
8
Intraspecies comparative genomics of three strains of with different antibiotic sensitivity.具有不同抗生素敏感性的三株[具体物种名称未给出]的种内比较基因组学
Genom Data. 2017 Mar 28;12:84-88. doi: 10.1016/j.gdata.2017.03.012. eCollection 2017 Jun.
9
Whole-genome sequence data and analysis of type strains ' and ' isolated from nitrate- and radionuclide-contaminated groundwater in Russia.从俄罗斯受硝酸盐和放射性核素污染的地下水中分离出的模式菌株“ ”和“ ”的全基因组序列数据及分析。
Data Brief. 2018 Oct 25;21:882-887. doi: 10.1016/j.dib.2018.10.060. eCollection 2018 Dec.
10
Draft genome sequence data of strain DTA83 isolated from infant stools.从婴儿粪便中分离出的菌株DTA83的基因组序列数据草稿。
Data Brief. 2019 Jan 19;22:1064-1067. doi: 10.1016/j.dib.2019.01.041. eCollection 2019 Feb.

本文引用的文献

1
NCBI prokaryotic genome annotation pipeline.美国国立生物技术信息中心原核生物基因组注释管道
Nucleic Acids Res. 2016 Aug 19;44(14):6614-24. doi: 10.1093/nar/gkw569. Epub 2016 Jun 24.
2
MEGA7: Molecular Evolutionary Genetics Analysis Version 7.0 for Bigger Datasets.MEGA7:适用于更大数据集的分子进化遗传学分析版本7.0
Mol Biol Evol. 2016 Jul;33(7):1870-4. doi: 10.1093/molbev/msw054. Epub 2016 Mar 22.
3
Complete genome sequence of ionizing radiation-resistant Hymenobacter sp. strain PAMC26628 isolated from an Arctic lichen.从北极地衣中分离出的抗电离辐射的嗜冷杆菌属菌株PAMC26628的全基因组序列
J Biotechnol. 2016 Apr 10;223:50-1. doi: 10.1016/j.jbiotec.2016.02.031. Epub 2016 Feb 26.
4
Hymenobacter terrenus sp. nov., isolated from biological soil crusts.新种地衣芽孢杆菌,从生物土壤结皮中分离得到。
Int J Syst Evol Microbiol. 2015 Dec;65(12):4557-4562. doi: 10.1099/ijsem.0.000610. Epub 2015 Sep 14.
5
Draft Genome Sequence of Hymenobacter sp. Strain IS2118, Isolated from a Freshwater Lake in Schirmacher Oasis, Antarctica, Reveals Diverse Genes for Adaptation to Cold Ecosystems.从南极施密特绿洲淡水湖分离出的嗜冷杆菌属菌株IS2118的基因组草图序列揭示了适应寒冷生态系统的多样基因。
Genome Announc. 2014 Aug 7;2(4):e00739-14. doi: 10.1128/genomeA.00739-14.
6
SPAdes: a new genome assembly algorithm and its applications to single-cell sequencing.SPAdes:一种新的基因组组装算法及其在单细胞测序中的应用
J Comput Biol. 2012 May;19(5):455-77. doi: 10.1089/cmb.2012.0021. Epub 2012 Apr 16.
7
Analyzing and minimizing PCR amplification bias in Illumina sequencing libraries.分析并最小化 Illumina 测序文库中的 PCR 扩增偏倚。
Genome Biol. 2011;12(2):R18. doi: 10.1186/gb-2011-12-2-r18. Epub 2011 Feb 21.
8
Quality control and preprocessing of metagenomic datasets.宏基因组数据集的质量控制和预处理。
Bioinformatics. 2011 Mar 15;27(6):863-4. doi: 10.1093/bioinformatics/btr026. Epub 2011 Jan 28.
9
Accurate whole human genome sequencing using reversible terminator chemistry.使用可逆终止子化学法进行准确的全人类基因组测序。
Nature. 2008 Nov 6;456(7218):53-9. doi: 10.1038/nature07517.
10
The RAST Server: rapid annotations using subsystems technology.RAST服务器:使用子系统技术进行快速注释。
BMC Genomics. 2008 Feb 8;9:75. doi: 10.1186/1471-2164-9-75.