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从番茄根表/根际连续体中获得的序列型145附生分离株GP1999的基因组草图序列

Draft Genome Sequence of GP1999, Sequence Type 145, an Epiphytic Isolate Obtained from the Tomato's Rhizoplane/Rhizosphere Continuum.

作者信息

Chase Hannah R, Eberl Leo, Stephan Roger, Jeong HyeJin, Lee Chaeyoon, Finkelstein Samantha, Negrete Flavia, Gangiredla Jayanthi, Patel Isha, Tall Ben D, Gopinath Gopal R, Lehner Angelika

机构信息

Center for Food Safety and Applied Nutrition, U.S. Food and Drug Administration, Laurel, Maryland, USA.

Department of Plant and Microbial Biology, University of Zurich, Zurich, Switzerland.

出版信息

Genome Announc. 2017 Aug 3;5(31):e00723-17. doi: 10.1128/genomeA.00723-17.

Abstract

We present here the draft genome of GP1999, a sequence type 145 strain isolated from the rhizosphere of tomato plants. Assembly and annotation of the genome resulted in a genome of 4,504,670 bp in size, with 4,148 coding sequences, and a GC content of 56.8%.

摘要

我们在此展示GP1999的基因组草图,这是一种从番茄植物根际分离出的序列类型145菌株。该基因组的组装和注释结果显示,其大小为4,504,670碱基对,有4,148个编码序列,GC含量为56.8%。

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Evidence for a plant-associated natural habitat for Cronobacter spp.有关 Cronobacter spp. 植物相关自然栖息地的证据
Res Microbiol. 2009 Oct;160(8):608-14. doi: 10.1016/j.resmic.2009.08.013. Epub 2009 Sep 11.

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