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植物共生菌中的 RNA 沉默:从以蛋白质为中心的视角看。

RNA silencing in plant symbiotic bacteria: Insights from a protein-centric view.

机构信息

a Grupo de Ecología Genética de la Rizosfera, Estación Experimental del Zaidín , Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC) , Granada , Spain.

出版信息

RNA Biol. 2017 Dec 2;14(12):1672-1677. doi: 10.1080/15476286.2017.1356565. Epub 2017 Sep 13.

Abstract

Extensive work in model enterobacteria has evidenced that the RNA chaperone Hfq and several endoribonucleases, such as RNase E or RNase III, serve pivotal roles in small RNA-mediated post-transcriptional silencing of gene expression. Characterization of these protein hubs commonly provide global functional and mechanistic insights into complex sRNA regulatory networks. The legume endosymbiont Sinorhizobium meliloti is a non-classical model bacterium with a very complex lifestyle in which riboregulation is expected to play important adaptive functions. Here, we discuss current knowledge about RNA silencing in S. meliloti from the perspective of the activity of Hfq and a recently discovered endoribonuclease (YbeY) exhibiting unprecedented catalytic versatility for the cleavage of single- and double-stranded RNA molecules.

摘要

在模式大肠杆菌中的广泛研究表明,RNA 伴侣 Hfq 和几种内切核酸酶(如 RNase E 或 RNase III)在小 RNA 介导的基因表达转录后沉默中起着关键作用。这些蛋白质枢纽的特性通常为复杂的 sRNA 调控网络提供了全局功能和机制见解。豆科植物共生体根瘤菌是一种非经典的模式细菌,具有非常复杂的生活方式,预计核糖调控将发挥重要的适应功能。在这里,我们从 Hfq 的活性和最近发现的内切核酸酶 (YbeY) 的角度讨论了 S. meliloti 中 RNA 沉默的现有知识,该酶表现出前所未有的催化多功能性,可切割单链和双链 RNA 分子。

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