• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

GUIDES: sgRNA design for loss-of-function screens.

作者信息

Meier Joshua A, Zhang Feng, Sanjana Neville E

机构信息

Broad Institute of MIT and Harvard, Cambridge, Massachusetts, USA.

McGovern Institute for Brain Research, Department of Brain and Cognitive Sciences, Department of Biological Engineering, Massachusetts Institute of Technology, Cambridge, Massachusetts, USA.

出版信息

Nat Methods. 2017 Aug 31;14(9):831-832. doi: 10.1038/nmeth.4423.

DOI:10.1038/nmeth.4423
PMID:28858339
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC5870754/
Abstract
摘要

相似文献

1
GUIDES: sgRNA design for loss-of-function screens.指南:用于功能缺失筛选的sgRNA设计
Nat Methods. 2017 Aug 31;14(9):831-832. doi: 10.1038/nmeth.4423.
2
Choosing CRISPR-based screens in cancer.在癌症中选择基于CRISPR的筛选方法。
Nat Methods. 2017 Mar 31;14(4):343-346. doi: 10.1038/nmeth.4232.
3
Synthesis of an arrayed sgRNA library targeting the human genome.靶向人类基因组的阵列式sgRNA文库的合成。
Sci Rep. 2015 Oct 8;5:14987. doi: 10.1038/srep14987.
4
In vivo profiling of metastatic double knockouts through CRISPR-Cpf1 screens.通过 CRISPR-Cpf1 筛选对转移性双敲除体进行体内分析。
Nat Methods. 2019 May;16(5):405-408. doi: 10.1038/s41592-019-0371-5. Epub 2019 Apr 8.
5
Guide RNAs: it's good to be choosy.向导RNA:挑剔一点是有好处的。
Nat Methods. 2020 Dec;17(12):1179-1182. doi: 10.1038/s41592-020-01003-4.
6
"Split-and-Click" sgRNA."分割点击" sgRNA。
Methods Mol Biol. 2021;2162:61-78. doi: 10.1007/978-1-0716-0687-2_5.
7
CRISPR/Cas9-mediated 2-sgRNA cleavage facilitates pseudorabies virus editing.CRISPR/Cas9 介导的 2-sgRNA 切割促进伪狂犬病病毒编辑。
FASEB J. 2018 Aug;32(8):4293-4301. doi: 10.1096/fj.201701129R. Epub 2018 Mar 6.
8
Pooled library screening with multiplexed Cpf1 library.多重 Cpf1 文库的 pooled library screening。
Nat Commun. 2019 Jul 17;10(1):3144. doi: 10.1038/s41467-019-10963-x.
9
Enhancement of single guide RNA transcription for efficient CRISPR/Cas-based genomic engineering.增强单向导RNA转录以实现高效的基于CRISPR/Cas的基因组工程
Genome. 2017 Jun;60(6):537-545. doi: 10.1139/gen-2016-0127. Epub 2017 Jan 26.
10
A reporter does CRISPR.一名记者操作CRISPR技术。
Science. 2016 Nov 4;354(6312):541. doi: 10.1126/science.354.6312.541.

引用本文的文献

1
H3F3A K27M mutations drive a repressive transcriptome by modulating chromatin accessibility independent of H3K27me3 in Diffuse Midline Glioma.在弥漫性中线胶质瘤中,H3F3A K27M突变通过独立于H3K27me3调节染色质可及性来驱动抑制性转录组。
Epigenetics Chromatin. 2025 Apr 26;18(1):23. doi: 10.1186/s13072-025-00585-7.
2
In vivo functional screens reveal loss as a driver of chemoresistance in small cell lung cancer.体内功能筛选揭示缺失是小细胞肺癌化疗耐药的驱动因素。
Sci Adv. 2025 Apr 25;11(17):eadq7084. doi: 10.1126/sciadv.adq7084. Epub 2025 Apr 23.
3
A targeted CRISPR screen identifies ETS1 as a regulator of HIV-1 latency.一项靶向CRISPR筛选确定ETS1为HIV-1潜伏的调节因子。
PLoS Pathog. 2025 Apr 8;21(4):e1012467. doi: 10.1371/journal.ppat.1012467. eCollection 2025 Apr.
4
Functional analysis of cancer-associated germline risk variants.癌症相关种系风险变异的功能分析
Nat Genet. 2025 Mar;57(3):718-728. doi: 10.1038/s41588-024-02070-5. Epub 2025 Feb 17.
5
Pan-cancer analysis of biallelic inactivation in tumor suppressor genes identifies KEAP1 zygosity as a predictive biomarker in lung cancer.肿瘤抑制基因双等位基因失活的泛癌分析确定 KEAP1 纯合性为肺癌的预测生物标志物。
Cell. 2025 Feb 6;188(3):851-867.e17. doi: 10.1016/j.cell.2024.11.010. Epub 2024 Dec 18.
6
CRISPRoffT: comprehensive database of CRISPR/Cas off-targets.CRISPRoffT:CRISPR/Cas脱靶效应的综合数据库。
Nucleic Acids Res. 2025 Jan 6;53(D1):D914-D924. doi: 10.1093/nar/gkae1025.
7
Functional genomics screens reveal a role for TBC1D24 and SV2B in antibody-dependent enhancement of dengue virus infection.功能基因组学筛选揭示了 TBC1D24 和 SV2B 在登革热病毒感染的抗体依赖性增强中的作用。
J Virol. 2024 Nov 19;98(11):e0158224. doi: 10.1128/jvi.01582-24. Epub 2024 Oct 8.
8
The COMPASS complex maintains the metastatic capacity imparted by a subpopulation of cells in UPS.COMPASS复合物维持了UPS中一个细胞亚群赋予的转移能力。
iScience. 2024 Jun 5;27(7):110187. doi: 10.1016/j.isci.2024.110187. eCollection 2024 Jul 19.
9
Functional genomics screens reveal a role for TBC1D24 and SV2B in antibody-dependent enhancement of dengue virus infection.功能基因组学筛选揭示了TBC1D24和SV2B在登革病毒感染的抗体依赖性增强中的作用。
bioRxiv. 2024 Apr 27:2024.04.26.591029. doi: 10.1101/2024.04.26.591029.
10
Deep Learning-Based Identification of Intraocular Pressure-Associated Genes Influencing Trabecular Meshwork Cell Morphology.基于深度学习识别影响小梁网细胞形态的眼压相关基因
Ophthalmol Sci. 2024 Mar 5;4(4):100504. doi: 10.1016/j.xops.2024.100504. eCollection 2024 Jul-Aug.

本文引用的文献

1
GenomeCRISPR - a database for high-throughput CRISPR/Cas9 screens.GenomeCRISPR——一个用于高通量CRISPR/Cas9筛选的数据库。
Nucleic Acids Res. 2017 Jan 4;45(D1):D679-D686. doi: 10.1093/nar/gkw997. Epub 2016 Oct 26.
2
Optimized sgRNA design to maximize activity and minimize off-target effects of CRISPR-Cas9.优化sgRNA设计以最大化CRISPR-Cas9的活性并最小化脱靶效应。
Nat Biotechnol. 2016 Feb;34(2):184-191. doi: 10.1038/nbt.3437. Epub 2016 Jan 18.
3
Discovery of cancer drug targets by CRISPR-Cas9 screening of protein domains.通过蛋白质结构域的CRISPR-Cas9筛选发现癌症药物靶点。
Nat Biotechnol. 2015 Jun;33(6):661-7. doi: 10.1038/nbt.3235. Epub 2015 May 11.
4
Human genomics. The Genotype-Tissue Expression (GTEx) pilot analysis: multitissue gene regulation in humans.人类基因组学。基因型-组织表达(GTEx)试点分析:人类多组织基因调控
Science. 2015 May 8;348(6235):648-60. doi: 10.1126/science.1262110. Epub 2015 May 7.
5
High-throughput functional genomics using CRISPR-Cas9.使用CRISPR-Cas9的高通量功能基因组学。
Nat Rev Genet. 2015 May;16(5):299-311. doi: 10.1038/nrg3899. Epub 2015 Apr 9.
6
Alternative Splicing Shapes the Phenotype of a Mutation in BBS8 To Cause Nonsyndromic Retinitis Pigmentosa.可变剪接塑造BBS8基因突变表型致非综合征性视网膜色素变性
Mol Cell Biol. 2015 May;35(10):1860-70. doi: 10.1128/MCB.00040-15. Epub 2015 Mar 16.
7
Organizing principles of mammalian nonsense-mediated mRNA decay.哺乳动物无意义介导的 mRNA 降解的组织原则。
Annu Rev Genet. 2013;47:139-65. doi: 10.1146/annurev-genet-111212-133424.
8
The challenge of increasing Pfam coverage of the human proteome.提高 Pfam 对人类蛋白质组覆盖范围的挑战。
Database (Oxford). 2013 Apr 19;2013:bat023. doi: 10.1093/database/bat023. Print 2013.