• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

Anafora:一个基于网络的通用注释工具。

Anafora: A Web-based General Purpose Annotation Tool.

作者信息

Chen Wei-Te, Styler Will

机构信息

Department of Computer Science, University of Colorado at Boulder.

Department of Linguistics, University of Colorado at Boulder.

出版信息

Proc Conf. 2013 Jun;2013:14-19.

PMID:29082384
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC5657237/
Abstract

Anafora is a newly-developed open source web-based text annotation tool built to be lightweight, flexible, easy to use and capable of annotating with a variety of schemas, simple and complex. Anafora allows secure web-based annotation of any plaintext file with both spanned (e.g. named entity or markable) and relation annotations, as well as adjudication for both types of annotation. Anafora offers automatic set assignment and progress-tracking, centralized and human-editable XML annotation schemas, and file-based storage and organization of data in a human-readable single-file XML format.

摘要

Anafora是一个新开发的基于网络的开源文本注释工具,其设计轻巧、灵活、易于使用,能够使用各种简单和复杂的模式进行注释。Anafora允许通过安全的网络对任何纯文本文件进行注释,包括跨度注释(如命名实体或可标记项)和关系注释,以及对这两种注释类型进行裁决。Anafora提供自动集分配和进度跟踪、集中式且可人工编辑的XML注释模式,以及以人类可读的单文件XML格式进行基于文件的数据存储和组织。

相似文献

1
Anafora: A Web-based General Purpose Annotation Tool.Anafora:一个基于网络的通用注释工具。
Proc Conf. 2013 Jun;2013:14-19.
2
Genome Annotation Transfer Utility (GATU): rapid annotation of viral genomes using a closely related reference genome.基因组注释转移工具(GATU):利用密切相关的参考基因组对病毒基因组进行快速注释。
BMC Genomics. 2006 Jun 13;7:150. doi: 10.1186/1471-2164-7-150.
3
VariOtator, a Software Tool for Variation Annotation with the Variation Ontology.VariOtator,一款用于使用变异本体进行变异注释的软件工具。
Hum Mutat. 2016 Apr;37(4):344-9. doi: 10.1002/humu.22954. Epub 2016 Feb 4.
4
eL-DASionator: an LDAS upload file generator.电子延迟分析仪:一种延迟分析系统上传文件生成器。
BMC Bioinformatics. 2004 May 7;5:55. doi: 10.1186/1471-2105-5-55.
5
PDB explorer -- a web based algorithm for protein annotation viewer and 3D visualization.PDB浏览器——一种基于网络的蛋白质注释查看器和三维可视化算法。
Interdiscip Sci. 2014 Dec;6(4):279-84. doi: 10.1007/s12539-012-0044-x. Epub 2014 Aug 9.
6
MICheck: a web tool for fast checking of syntactic annotations of bacterial genomes.MICheck:一种用于快速检查细菌基因组句法注释的网络工具。
Nucleic Acids Res. 2005 Jul 1;33(Web Server issue):W471-9. doi: 10.1093/nar/gki498.
7
Computing human image annotation.计算人体图像标注。
Annu Int Conf IEEE Eng Med Biol Soc. 2009;2009:7065-8. doi: 10.1109/IEMBS.2009.5333365.
8
Var2GO: a web-based tool for gene variants selection.Var2GO:一个基于网络的基因变异体选择工具。
BMC Bioinformatics. 2016 Nov 8;17(Suppl 12):376. doi: 10.1186/s12859-016-1197-0.
9
OntologyWidget - a reusable, embeddable widget for easily locating ontology terms.本体小部件 - 一种可重复使用、可嵌入的小部件,用于轻松定位本体术语。
BMC Bioinformatics. 2007 Sep 13;8:338. doi: 10.1186/1471-2105-8-338.
10
FunctionAnnotator, a versatile and efficient web tool for non-model organism annotation.功能注释器,一个用于非模式生物注释的多功能且高效的网络工具。
Sci Rep. 2017 Sep 5;7(1):10430. doi: 10.1038/s41598-017-10952-4.

引用本文的文献

1
An End-to-End Natural Language Processing System for Automatically Extracting Radiation Therapy Events From Clinical Texts.用于从临床文本中自动提取放射治疗事件的端到端自然语言处理系统。
Int J Radiat Oncol Biol Phys. 2023 Sep 1;117(1):262-273. doi: 10.1016/j.ijrobp.2023.03.055. Epub 2023 Mar 27.
2
ANNO: A General Annotation Tool for Bilingual Clinical Note Information Extraction.ANNO:一种用于双语临床记录信息提取的通用注释工具。
Healthc Inform Res. 2022 Jan;28(1):89-94. doi: 10.4258/hir.2022.28.1.89. Epub 2022 Jan 31.
3
Markup: A Web-Based Annotation Tool Powered by Active Learning.

本文引用的文献

1
Towards comprehensive syntactic and semantic annotations of the clinical narrative.朝着临床叙述的全面句法和语义标注努力。
J Am Med Inform Assoc. 2013 Sep-Oct;20(5):922-30. doi: 10.1136/amiajnl-2012-001317. Epub 2013 Jan 25.
标记:一种由主动学习驱动的基于网络的注释工具。
Front Digit Health. 2021 Jul 26;3:598916. doi: 10.3389/fdgth.2021.598916. eCollection 2021.
4
Family History Extraction From Synthetic Clinical Narratives Using Natural Language Processing: Overview and Evaluation of a Challenge Data Set and Solutions for the 2019 National NLP Clinical Challenges (n2c2)/Open Health Natural Language Processing (OHNLP) Competition.利用自然语言处理从合成临床叙述中提取家族病史:2019年国家自然语言处理临床挑战(n2c2)/开放健康自然语言处理(OHNLP)竞赛的挑战数据集概述与评估及解决方案
JMIR Med Inform. 2021 Jan 27;9(1):e24008. doi: 10.2196/24008.
5
An extensive review of tools for manual annotation of documents.对文档手动标注工具的全面回顾。
Brief Bioinform. 2021 Jan 18;22(1):146-163. doi: 10.1093/bib/bbz130.
6
Supervised methods to extract clinical events from cardiology reports in Italian.从意大利语的心脏病学报告中提取临床事件的有监督方法。
J Biomed Inform. 2019 Jul;95:103219. doi: 10.1016/j.jbi.2019.103219. Epub 2019 May 28.
7
Doc2Hpo: a web application for efficient and accurate HPO concept curation.Doc2Hpo:一个用于高效准确的 HPO 概念编纂的网络应用程序。
Nucleic Acids Res. 2019 Jul 2;47(W1):W566-W570. doi: 10.1093/nar/gkz386.
8
Standardizing Heterogeneous Annotation Corpora Using HL7 FHIR for Facilitating their Reuse and Integration in Clinical NLP.使用HL7 FHIR对异构注释语料库进行标准化,以促进其在临床自然语言处理中的重用和整合。
AMIA Annu Symp Proc. 2018 Dec 5;2018:574-583. eCollection 2018.
9
Automated annotation and classification of BI-RADS assessment from radiology reports.从放射学报告中自动标注和分类乳腺影像报告和数据系统(BI-RADS)评估结果
J Biomed Inform. 2017 May;69:177-187. doi: 10.1016/j.jbi.2017.04.011. Epub 2017 Apr 18.