• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

相似文献

1
Rational and Semirational Protein Design.理性与半理性蛋白质设计
Methods Mol Biol. 2018;1685:15-23. doi: 10.1007/978-1-4939-7366-8_2.
2
Milestones in directed enzyme evolution.定向酶进化的里程碑。
Curr Opin Chem Biol. 2002 Dec;6(6):858-64. doi: 10.1016/s1367-5931(02)00396-4.
3
Improved biocatalysts by directed evolution and rational protein design.通过定向进化和合理的蛋白质设计改进生物催化剂。
Curr Opin Chem Biol. 2001 Apr;5(2):137-43. doi: 10.1016/s1367-5931(00)00182-4.
4
Engineered enzymes for improved organic synthesis.用于改进有机合成的工程酶。
Curr Opin Biotechnol. 2003 Aug;14(4):395-400. doi: 10.1016/s0958-1669(03)00095-8.
5
Protein engineering of microbial enzymes.微生物酶的蛋白质工程。
Curr Opin Microbiol. 2010 Jun;13(3):274-82. doi: 10.1016/j.mib.2010.01.010. Epub 2010 Feb 17.
6
Directed evolution of enzymes for applied biocatalysis.用于应用生物催化的酶的定向进化。
Trends Biotechnol. 2003 Nov;21(11):474-8. doi: 10.1016/j.tibtech.2003.09.001.
7
Directed Evolution of Protein Catalysts.蛋白质催化剂的定向进化。
Annu Rev Biochem. 2018 Jun 20;87:131-157. doi: 10.1146/annurev-biochem-062917-012034. Epub 2018 Mar 1.
8
Enzyme engineering: Reshaping the biocatalytic functions.酶工程:重塑生物催化功能。
Biotechnol Bioeng. 2020 Jun;117(6):1877-1894. doi: 10.1002/bit.27329. Epub 2020 Mar 27.
9
Computational biochemistry: old enzymes, new tricks.计算生物化学:旧酶新用
Nature. 2008 May 8;453(7192):164-6. doi: 10.1038/453164a.
10
De novo enzymes by computational design.通过计算设计的从头酶。
Curr Opin Chem Biol. 2013 Apr;17(2):221-8. doi: 10.1016/j.cbpa.2013.02.012. Epub 2013 Mar 14.

引用本文的文献

1
Exploring Evolution to Uncover Insights Into Protein Mutational Stability.探索进化以揭示蛋白质突变稳定性的见解。
Mol Biol Evol. 2025 Jan 6;42(1). doi: 10.1093/molbev/msae267.
2
Autonomous Nucleic Acid and Protein Nanocomputing Agents Engineered to Operate in Living Cells.经设计可在活细胞中运行的自主核酸和蛋白质纳米计算剂。
ACS Nano. 2025 Jan 21;19(2):1865-1883. doi: 10.1021/acsnano.4c13663. Epub 2025 Jan 6.
3
ProteinReDiff: Complex-based ligand-binding proteins redesign by equivariant diffusion-based generative models.ProteinReDiff:基于等变扩散生成模型的基于复合物的配体结合蛋白重新设计
Struct Dyn. 2024 Nov 25;11(6):064102. doi: 10.1063/4.0000271. eCollection 2024 Nov.
4
New advances in protein engineering for industrial applications: Key takeaways.用于工业应用的蛋白质工程新进展:要点总结。
Open Life Sci. 2024 Jun 17;19(1):20220856. doi: 10.1515/biol-2022-0856. eCollection 2024.
5
AbMelt: Learning antibody thermostability from molecular dynamics.AbMelt:从分子动力学角度学习抗体热稳定性。
Biophys J. 2024 Sep 3;123(17):2921-2933. doi: 10.1016/j.bpj.2024.06.003. Epub 2024 Jun 7.
6
Protein engineering in the computational age: An open source framework for exploring mutational landscapes .计算时代的蛋白质工程:一个用于探索突变景观的开源框架
Eng Biol. 2023 Dec 7;7(1-4):29-38. doi: 10.1049/enb2.12028. eCollection 2023 Dec.
7
Stabilization challenges and aggregation in protein-based therapeutics in the pharmaceutical industry.制药行业中基于蛋白质的治疗药物的稳定性挑战与聚集
RSC Adv. 2023 Dec 11;13(51):35947-35963. doi: 10.1039/d3ra06476j. eCollection 2023 Dec 8.
8
Engineering and Expression Strategies for Optimization of L-Asparaginase Development and Production.工程化与表达策略优化 L-天冬酰胺酶的开发与生产。
Int J Mol Sci. 2023 Oct 16;24(20):15220. doi: 10.3390/ijms242015220.
9
Trends in guided engineering of efficient polyethylene terephthalate (PET) hydrolyzing enzymes to enable bio-recycling and upcycling of PET.高效聚对苯二甲酸乙二酯(PET)水解酶的导向工程趋势,以实现PET的生物回收和升级循环利用。
Comput Struct Biotechnol J. 2023 Jun 5;21:3513-3521. doi: 10.1016/j.csbj.2023.06.004. eCollection 2023.
10
Structure-Guided Evolution Modulate Alcohol Oxidase to Improve Ethanol Oxidation Performance.结构导向进化调控醇氧化酶以改善乙醇氧化性能。
Appl Biochem Biotechnol. 2024 Apr;196(4):1948-1965. doi: 10.1007/s12010-023-04626-3. Epub 2023 Jul 15.

本文引用的文献

1
Insights from molecular dynamics simulations for computational protein design.用于计算蛋白质设计的分子动力学模拟见解。
Mol Syst Des Eng. 2017 Feb 1;2(1):9-33. doi: 10.1039/C6ME00083E. Epub 2017 Jan 9.
2
Installing hydrolytic activity into a completely de novo protein framework.在全新的蛋白质框架中引入水解活性。
Nat Chem. 2016 Sep;8(9):837-44. doi: 10.1038/nchem.2555. Epub 2016 Jul 4.
3
Abiological catalysis by artificial haem proteins containing noble metals in place of iron.含贵金属替代铁的人工血红素蛋白的生物催化作用。
Nature. 2016 Jun 23;534(7608):534-7. doi: 10.1038/nature17968. Epub 2016 Jun 13.
4
Thermostability of Enzymes from Molecular Dynamics Simulations.基于分子动力学模拟的酶的热稳定性
J Chem Theory Comput. 2016 Jun 14;12(6):2489-92. doi: 10.1021/acs.jctc.6b00120. Epub 2016 May 6.
5
New Tricks for Old Proteins: Single Mutations in a Nonenzymatic Protein Give Rise to Various Enzymatic Activities.旧蛋白的新把戏:非酶蛋白中的单个突变可产生各种酶活性。
J Am Chem Soc. 2015 Dec 2;137(47):14905-11. doi: 10.1021/jacs.5b07812. Epub 2015 Nov 20.
6
Enantioselective enzymes by computational design and in silico screening.通过计算设计和计算机筛选获得对映选择性酶。
Angew Chem Int Ed Engl. 2015 Mar 16;54(12):3726-30. doi: 10.1002/anie.201411415. Epub 2015 Feb 4.
7
Design of an allosterically regulated retroaldolase.变构调节型逆羟醛酶的设计
Protein Sci. 2015 Apr;24(4):561-70. doi: 10.1002/pro.2622. Epub 2015 Jan 13.
8
Catalytic efficiency of designed catalytic proteins.设计的催化蛋白的催化效率。
Curr Opin Struct Biol. 2014 Aug;27:113-21. doi: 10.1016/j.sbi.2014.06.006. Epub 2014 Jul 19.
9
Computationally efficient and accurate enantioselectivity modeling by clusters of molecular dynamics simulations.通过分子动力学模拟簇进行计算高效且准确的对映选择性建模。
J Chem Inf Model. 2014 Jul 28;54(7):2079-92. doi: 10.1021/ci500126x. Epub 2014 Jun 30.
10
Computationally designed libraries for rapid enzyme stabilization.用于快速酶稳定化的计算设计文库。
Protein Eng Des Sel. 2014 Feb;27(2):49-58. doi: 10.1093/protein/gzt061. Epub 2014 Jan 8.

理性与半理性蛋白质设计

Rational and Semirational Protein Design.

作者信息

Korendovych Ivan V

机构信息

Department of Chemistry, Syracuse University, 111 College Place, Syracuse, NY, 13244, USA.

出版信息

Methods Mol Biol. 2018;1685:15-23. doi: 10.1007/978-1-4939-7366-8_2.

DOI:10.1007/978-1-4939-7366-8_2
PMID:29086301
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC5912912/
Abstract

This mini review gives an overview over different design approaches and methodologies applied in rational and semirational enzyme engineering. The underlying principles for engineering novel activities, enantioselectivity, substrate specificity, stability, and pH optimum are summarized.

摘要

本综述概述了合理和半合理酶工程中应用的不同设计方法和策略。总结了工程化新活性、对映选择性、底物特异性、稳定性和最适pH值的基本原理。