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柯萨奇病毒B5 C基因型的重组分析

Recombination analysis of coxsackievirus B5 genogroup C.

作者信息

Shen Hongxing

机构信息

Medical College, Jiangsu University, 301 Xuefu Road, 212013, Zhenjiang, People's Republic of China.

出版信息

Arch Virol. 2018 Feb;163(2):539-544. doi: 10.1007/s00705-017-3608-6. Epub 2017 Nov 13.

DOI:10.1007/s00705-017-3608-6
PMID:29134337
Abstract

Coxsackievirus B5 (CVB5) is a member of the species Enterovirus B of the genus Enterovirus, family Picornaviridae. Based on its VP1 sequence, CVB5 is divided into four genogroups: A, B, C, and D. From 2002 to 2012, CVB5 serotype genogroup C caused an outbreak of aseptic meningitis in China. In order to study the evolution of CVB5 genogroup C, phylogenetic and recombination analysis was performed using the 399 available enterovirus B genome sequences in the GenBank database. The results indicated that 10 strains of CVB5 serotype genogroup C resulted from recombination between members of genogroup B and echovirus serotype E6, and another 5 strains resulted from recombination between members of genogroup C and serotype CVB4. These recombination events were confirmed by phylogenetic analysis.

摘要

柯萨奇病毒B5(CVB5)是小RNA病毒科肠道病毒属肠道病毒B种的成员。基于其VP1序列,CVB5分为四个基因群:A、B、C和D。2002年至2012年,CVB5血清型基因群C在中国引发了无菌性脑膜炎疫情。为了研究CVB5基因群C的进化,利用GenBank数据库中399条可用的肠道病毒B基因组序列进行了系统发育和重组分析。结果表明,10株CVB5血清型基因群C菌株是由基因群B成员与埃可病毒血清型E6之间的重组产生的,另外5株是由基因群C成员与血清型CVB4之间的重组产生的。这些重组事件通过系统发育分析得到了证实。

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Recombination analysis of coxsackievirus B5 genogroup C.柯萨奇病毒B5 C基因型的重组分析
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