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寻找相关的生物医学数据集:加州大学圣地亚哥分校为 bioCADDIE 检索挑战赛提供的解决方案。

Finding relevant biomedical datasets: the UC San Diego solution for the bioCADDIE Retrieval Challenge.

机构信息

University of California, San Diego, 9500 Gilman Drive, MC 0728, La Jolla, CA 92093-0728, USA.

Department of Computer Science, Northern Kentucky University, Nunn Drive Highland Heights, KY 41099, USA.

出版信息

Database (Oxford). 2018 Jan 1;2018. doi: 10.1093/database/bay017.

DOI:10.1093/database/bay017
PMID:29688374
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC5861401/
Abstract

https://github.com/w2wei/dataset_retrieval_pipeline.

摘要

https://github.com/w2wei/dataset_retrieval_pipeline.

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/c48c/5861401/4aa20a2c6a17/bay017f2.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/c48c/5861401/8d1b9b82d971/bay017f1.jpg
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J Am Med Inform Assoc. 2015 Nov;22(6):1148-52. doi: 10.1093/jamia/ocv048. Epub 2015 Jun 25.

引用本文的文献

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J Am Med Inform Assoc. 2012 Mar-Apr;19(2):196-201. doi: 10.1136/amiajnl-2011-000538. Epub 2011 Nov 10.
10
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