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酵母基因组数据库(SGD)简介。

An Introduction to the Saccharomyces Genome Database (SGD).

作者信息

Lang Olivia W, Nash Robert S, Hellerstedt Sage T, Engel Stacia R

机构信息

Department of Genetics, Stanford University, Palo Alto, CA, USA.

出版信息

Methods Mol Biol. 2018;1757:21-30. doi: 10.1007/978-1-4939-7737-6_2.

Abstract

The Saccharomyces Genome Database (SGD) is a well-established, key resource for researchers studying Saccharomyces cerevisiae. In addition to updating and maintaining the official genomic sequence of this highly studied organism, SGD provides integrated data regarding gene functions and phenotypes, which are extracted from the published literature. The vast amount and variety of data housed in the database can prove challenging to navigate for the first-time user. Therefore, this chapter serves as an introduction describing how to search the database in order to discover new information. We introduce the different types of pages on the website, and describe how to manipulate the tables and diagrams therein to display, download, or analyze the data using various SGD tools.

摘要

酿酒酵母基因组数据库(SGD)是研究酿酒酵母的科研人员广泛使用的关键资源。除了更新和维护这种经过深入研究的生物体的官方基因组序列外,SGD还提供从已发表文献中提取的有关基因功能和表型的综合数据。对于初次使用该数据库的用户而言,其中存储的大量且多样的数据可能颇具挑战性。因此,本章旨在介绍如何搜索该数据库以发现新信息。我们将介绍网站上不同类型的页面,并描述如何操作其中的表格和图表,以便使用各种SGD工具来显示、下载或分析数据。

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