• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

酶法合成用于可编程基因沉默的自组装 Dicer 底物 RNA 纳米结构。

Enzymatic Synthesis of Self-assembled Dicer Substrate RNA Nanostructures for Programmable Gene Silencing.

机构信息

College of Pharmacy, Graduate School of Pharmaceutical Sciences , Ewha Womans University , Seoul 03760 , Republic of Korea.

Faculté de Pharmacie de Paris , Université Paris Descartes , Paris 75006 , France.

出版信息

Nano Lett. 2018 Jul 11;18(7):4279-4284. doi: 10.1021/acs.nanolett.8b01267. Epub 2018 Jun 8.

DOI:10.1021/acs.nanolett.8b01267
PMID:29863365
Abstract

Enzymatic synthesis of RNA nanostructures is achieved by isothermal rolling circle transcription (RCT). Each arm of RNA nanostructures provides a functional role of Dicer substrate RNA inducing sequence specific RNA interference (RNAi). Three different RNAi sequences (GFP, RFP, and BFP) are incorporated within the three-arm junction RNA nanostructures (Y-RNA). The template and helper DNA strands are designed for the large-scale in vitro synthesis of RNA strands to prepare self-assembled Y-RNA. Interestingly, Dicer processing of Y-RNA is highly influenced by its physical structure and different gene silencing activity is achieved depending on its arm length and overhang. In addition, enzymatic synthesis allows the preparation of various Y-RNA structures using a single DNA template offering on demand regulation of multiple target genes.

摘要

通过等温滚环转录(RCT)实现 RNA 纳米结构的酶促合成。RNA 纳米结构的每一个臂都提供了 Dicer 底物 RNA 诱导序列特异性 RNA 干扰(RNAi)的功能作用。三个不同的 RNAi 序列(GFP、RFP 和 BFP)被整合到三臂连接 RNA 纳米结构(Y-RNA)中。模板和辅助 DNA 链被设计用于 RNA 链的大规模体外合成,以制备自组装的 Y-RNA。有趣的是,Dicer 对 Y-RNA 的加工受到其物理结构的高度影响,并且根据其臂长和突出端的不同,可以实现不同的基因沉默活性。此外,酶促合成允许使用单个 DNA 模板制备各种 Y-RNA 结构,从而按需调节多个靶基因。

相似文献

1
Enzymatic Synthesis of Self-assembled Dicer Substrate RNA Nanostructures for Programmable Gene Silencing.酶法合成用于可编程基因沉默的自组装 Dicer 底物 RNA 纳米结构。
Nano Lett. 2018 Jul 11;18(7):4279-4284. doi: 10.1021/acs.nanolett.8b01267. Epub 2018 Jun 8.
2
Truncated tetrahedral RNA nanostructures exhibit enhanced features for delivery of RNAi substrates.截短的四面体 RNA 纳米结构表现出增强的特性,可用于递送 RNAi 底物。
Nanoscale. 2020 Jan 28;12(4):2555-2568. doi: 10.1039/c9nr08197f. Epub 2020 Jan 14.
3
Branched RNA nanostructures for RNA interference.分支 RNA 纳米结构用于 RNA 干扰。
Chem Commun (Camb). 2011 Aug 7;47(29):8367-9. doi: 10.1039/c1cc11780g. Epub 2011 Jun 21.
4
RNA Interference-Mediated Gene Silencing by Branched Tripodal RNAs Does Not Require Dicer Processing.三臂树状分支 RNA 通过 RNA 干扰介导的基因沉默不需要 Dicer 加工。
Nucleic Acid Ther. 2018 Feb;28(1):44-49. doi: 10.1089/nat.2017.0681. Epub 2017 Dec 1.
5
Dissecting human dicer: some assembly required.剖析人类Dicer:需要一些组装。
J Mol Biol. 2012 Sep 28;422(4):464-5. doi: 10.1016/j.jmb.2012.07.001. Epub 2012 Jul 4.
6
Cryo-EM Structure of Human Dicer and Its Complexes with a Pre-miRNA Substrate.Cryo-EM 结构的人 Dicer 和其与前体 miRNA 底物的复合物。
Cell. 2018 May 17;173(5):1191-1203.e12. doi: 10.1016/j.cell.2018.03.080. Epub 2018 Apr 26.
7
Self-assembled DNA nanostructures prepared by rolling circle amplification for the delivery of siRNA conjugates.通过滚环扩增制备的用于递送小干扰RNA缀合物的自组装DNA纳米结构。
Chem Commun (Camb). 2014 Nov 7;50(86):13049-51. doi: 10.1039/c4cc03834g.
8
Nanostructured RNAs for RNA interference.用于RNA干扰的纳米结构RNA
Methods Mol Biol. 2015;1218:17-36. doi: 10.1007/978-1-4939-1538-5_2.
9
Receptor-targeted aptamer-siRNA conjugate-directed transcriptional regulation of HIV-1.受体靶向适体-siRNA 偶联物介导的 HIV-1 转录调控。
Theranostics. 2018 Feb 7;8(6):1575-1590. doi: 10.7150/thno.23085. eCollection 2018.
10
Molecular mechanisms of Dicer: endonuclease and enzymatic activity.Dicer的分子机制:核酸内切酶与酶活性
Biochem J. 2017 May 4;474(10):1603-1618. doi: 10.1042/BCJ20160759.

引用本文的文献

1
PEGylated Multimeric RNA Nanoparticles for siRNA Delivery in Traumatic Brain Injury.用于创伤性脑损伤中siRNA递送的聚乙二醇化多聚体RNA纳米颗粒
Small. 2025 Mar;21(10):e2405806. doi: 10.1002/smll.202405806. Epub 2024 Nov 5.
2
Development of an RNA Nanostructure for Effective Control through Spray-Induced Gene Silencing without an Extra Nanocarrier.通过喷雾诱导基因沉默实现有效控制且无需额外纳米载体的RNA纳米结构的开发。
J Fungi (Basel). 2024 Jul 14;10(7):483. doi: 10.3390/jof10070483.
3
Direct dsRNA preparation by promoter-free RCT and RNase H cleavage using one circular dsDNA template with a mismatched bubble.
使用带有错配泡的单个环状双链 DNA 模板通过无启动子 RCT 和 RNase H 切割制备直接 dsRNA。
RNA. 2023 Nov;29(11):1691-1702. doi: 10.1261/rna.079670.123. Epub 2023 Aug 3.
4
Multimeric RNAs for efficient RNA-based therapeutics and vaccines.用于高效基于 RNA 的治疗和疫苗的多聚 RNA。
J Control Release. 2022 May;345:770-785. doi: 10.1016/j.jconrel.2022.03.052. Epub 2022 Mar 31.
5
Application of Nucleic Acid Frameworks in the Construction of Nanostructures and Cascade Biocatalysts: Recent Progress and Perspective.核酸框架在纳米结构和级联生物催化剂构建中的应用:最新进展与展望
Front Bioeng Biotechnol. 2022 Jan 7;9:792489. doi: 10.3389/fbioe.2021.792489. eCollection 2021.
6
RNA Drug Delivery Using Biogenic Nanovehicles for Cancer Therapy.利用生物纳米载体进行RNA药物递送用于癌症治疗
Front Pharmacol. 2021 Dec 24;12:734443. doi: 10.3389/fphar.2021.734443. eCollection 2021.
7
pH-responsive DNA nanomicelles for chemo-gene synergetic therapy of anaplastic large cell lymphoma.pH 响应性 DNA 纳米胶束用于治疗间变大细胞淋巴瘤的化疗-基因协同治疗。
Theranostics. 2020 Jul 9;10(18):8250-8263. doi: 10.7150/thno.45803. eCollection 2020.
8
SSD - a free software for designing multimeric mono-, bi- and trivalent shRNAs.SSD - 一款用于设计多聚体单、双和三价短发夹RNA的免费软件。
Genet Mol Biol. 2020 Mar 2;43(1):e20190300. doi: 10.1590/1678-4685-GMB-2019-0300. eCollection 2020.