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化脓性链球菌六种皮肤分离株的基因组序列草图

Draft Genome Sequences of Six Skin Isolates of Streptococcus pyogenes.

作者信息

Liang Zhong, Stephens Melissa, Ploplis Victoria A, Lee Shaun W, Castellino Francis J

机构信息

W.M. Keck Center for Transgene Research, University of Notre Dame, Notre Dame, Indiana, USA.

Genomics and Bioinformatics Core Facility, University of Notre Dame, Notre Dame, Indiana, USA.

出版信息

Genome Announc. 2018 Jun 28;6(26):e00592-18. doi: 10.1128/genomeA.00592-18.

DOI:10.1128/genomeA.00592-18
PMID:29954901
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC6025946/
Abstract

Whole-genome shotgun sequences and bottom-up assembly of contigs of six skin isolates of , , NS88.3 (98.1), NS223 (91), NS455 (52), SS1448 (86.2), SS1572 (223), and SS1574 (224), are presented here. All contigs were annotated, and the gene arrangements and the inferred proteins were consistent with a pattern D classification.

摘要

本文展示了6株皮肤分离株NS88.3(98.1)、NS223(91)、NS455(52)、SS1448(86.2)、SS1572(223)和SS1574(224)的全基因组鸟枪法序列以及重叠群的自下而上组装。所有重叠群均已注释,基因排列和推断的蛋白质与模式D分类一致。

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