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iS-CellR：一个用于分析和可视化单细胞 RNA 测序数据的用户友好工具。

iS-CellR: a user-friendly tool for analyzing and visualizing single-cell RNA sequencing data.

机构信息

Immunocore Ltd, Abingdon, Oxfordshire, UK.

出版信息

Bioinformatics. 2018 Dec 15;34(24):4305-4306. doi: 10.1093/bioinformatics/bty517.

DOI:10.1093/bioinformatics/bty517
PMID:29982379
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC6289135/
Abstract

SUMMARY

Interactive platform for single-cell RNA-sequencing (iS-CellR) is a web-based Shiny application that is designed to provide user-friendly, comprehensive analysis of single-cell RNA sequencing data. iS-CellR has the capability to run on any modern web browser and provides an accessible graphical user interface that enables the user to perform complex single-cell RNA-sequencing analysis without requiring programming skills.

AVAILABILITY AND IMPLEMENTATION

iS-CellR is open source and available through GitHub at https://github.com/immcore/iS-CellR. iS-CellR is implemented in Docker and can be launched on any operating system with Docker installed.

SUPPLEMENTARY INFORMATION

Supplementary data are available at Bioinformatics online.

摘要

摘要

交互式单细胞 RNA 测序平台（iS-CellR）是一个基于网络的 Shiny 应用程序，旨在为单细胞 RNA 测序数据提供用户友好、全面的分析。iS-CellR 可以在任何现代网络浏览器上运行，并提供一个易于访问的图形用户界面，使用户能够执行复杂的单细胞 RNA 测序分析，而无需编程技能。

可用性和实现

iS-CellR 是开源的，并可通过 GitHub 获得，网址为 https://github.com/immcore/iS-CellR。iS-CellR 是用 Docker 实现的，可以在安装了 Docker 的任何操作系统上启动。

补充信息

补充数据可在 Bioinformatics 在线获得。

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/173f/6289135/166f98a7db68/bty517f1.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/173f/6289135/166f98a7db68/bty517f1.jpg
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