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从突尼斯香叶树根部根瘤中分离出的共生弗兰克氏菌属菌株BMG5.30的基因组序列草图

Draft genome sequence of the symbiotic Frankia sp. strain BMG5.30 isolated from root nodules of Coriaria myrtifolia in Tunisia.

作者信息

Gueddou Abdellatif, Swanson Erik, Hezbri Karima, Nouioui Imen, Ktari Amir, Simpson Stephen, Morris Krystalynne, Kelley Thomas W, Ghodhbane-Gtari Faten, Gtari Maher, Tisa Louis S

机构信息

Institut National des Sciences Appliquées et de Technologie, Université Carthage, Cente Urbain Nord, 676-1080, Tunis, Tunisia.

Laboratoire Microorganismes et Biomolécules Actives, Université Tunis El Manar (FST), 2092, Tunis, Tunisia.

出版信息

Antonie Van Leeuwenhoek. 2019 Jan;112(1):67-74. doi: 10.1007/s10482-018-1138-1. Epub 2018 Aug 1.

DOI:10.1007/s10482-018-1138-1
PMID:30069723
Abstract

Frankia sp. strain BMG5.30 was isolated from root nodules of a Coriaria myrtifolia seedling on soil collected in Tunisia and represents the second cluster 2 isolate. Frankia sp. strain BMG5.30 was able to re-infect C. myrtifolia generating root nodules. Here, we report its 5.8-Mbp draft genome sequence with a G + C content of 70.03% and 4509 candidate protein-encoding genes.

摘要

弗兰克氏菌属菌株BMG5.30是从突尼斯采集的土壤中生长的地锦草幼苗的根瘤中分离得到的，它代表了第二个聚类2分离株。弗兰克氏菌属菌株BMG5.30能够再次感染地锦草并形成根瘤。在此，我们报告其5.8兆碱基的草图基因组序列，G+C含量为70.03%，有4509个候选蛋白质编码基因。

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