Suppr超能文献

密码子优化性差作为一种信号,用于降解发生移码的转录本。

Poor codon optimality as a signal to degrade transcripts with frameshifts.

作者信息

Schikora-Tamarit Miquel Àngel, Carey Lucas B

机构信息

a Systems Bioengineering Program, Department of Experimental and Health Sciences , Universitat Pompeu Fabra , Barcelona , Spain.

出版信息

Transcription. 2018;9(5):327-333. doi: 10.1080/21541264.2018.1511676. Epub 2018 Aug 28.

Abstract

Frameshifting errors are common and mRNA quality control pathways, such as nonsense-mediated decay (NMD), exist to degrade these aberrant transcripts. Recent work has shown the existence of a genetic link between NMD and codon-usage mediated mRNA decay. Here we present computational evidence that these pathways are synergic for removing frameshifts.

摘要

移码错误很常见,并且存在诸如无义介导的衰变(NMD)等mRNA质量控制途径来降解这些异常转录本。最近的研究表明,NMD与密码子使用介导的mRNA衰变之间存在遗传联系。在此,我们提供计算证据表明这些途径在去除移码方面具有协同作用。

相似文献

9
The Branched Nature of the Nonsense-Mediated mRNA Decay Pathway.非编码 RNA 降解途径的分支性质。
Trends Genet. 2021 Feb;37(2):143-159. doi: 10.1016/j.tig.2020.08.010. Epub 2020 Sep 29.

本文引用的文献

1
2
Highly parallel genome variant engineering with CRISPR-Cas9.利用 CRISPR-Cas9 进行高度平行的基因组变异工程。
Nat Genet. 2018 Apr;50(4):510-514. doi: 10.1038/s41588-018-0087-y. Epub 2018 Apr 9.
3
Promoter architecture determines cotranslational regulation of mRNA.启动子结构决定了 mRNA 的共翻译调控。
Genome Res. 2018 Apr;28(4):509-518. doi: 10.1101/gr.230458.117. Epub 2018 Mar 22.
4
The landscape of transcription errors in eukaryotic cells.真核细胞中转录错误的全景。
Sci Adv. 2017 Oct 20;3(10):e1701484. doi: 10.1126/sciadv.1701484. eCollection 2017 Oct.
6
Codon optimality and mRNA decay.密码子优化与 mRNA 衰减。
Cell Res. 2016 Dec;26(12):1269-1270. doi: 10.1038/cr.2016.127. Epub 2016 Nov 4.
9
The Meaning of NMD: Translate or Perish.NMD 的含义:要么翻译,要么灭亡。
Trends Genet. 2016 Jul;32(7):395-407. doi: 10.1016/j.tig.2016.04.007. Epub 2016 May 14.

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验