• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

从一名戊型肝炎病毒感染患者分离出的人佩吉病毒变异株的近乎完整基因组序列。

Near-Complete Genome Sequence of a Human Pegivirus Variant Isolated from a Hepatitis E Virus-Infected Patient.

作者信息

Zhang Xiaodan, Li Wang, Zhou Chenglin

机构信息

Zhenjiang Center for Disease Prevention and Control, Zhenjiang, Jiangsu, China.

Clinical Laboratory Center, Taizhou People's Hospital, Taizhou, Jiangsu, China.

出版信息

Microbiol Resour Announc. 2019 Jan 24;8(4). doi: 10.1128/MRA.01151-18. eCollection 2019 Jan.

DOI:10.1128/MRA.01151-18
PMID:30701229
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC6346178/
Abstract

Using viral metagenomics, we analyzed the virome of a blood sample from a hepatitis E patient. We identified viral sequences showing significant similarity to human pegivirus (HPgV), anellovirus, and hepatitis E virus. The near-complete genome of a genotype 3 HPgV strain was acquired and characterized.

摘要

我们使用病毒宏基因组学分析了一名戊型肝炎患者血液样本中的病毒组。我们鉴定出与人类pegivirus(HPgV)、环病毒和戊型肝炎病毒具有显著相似性的病毒序列。获得并表征了一株3型HPgV毒株的近乎完整的基因组。

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/87e4/6346178/4548953fea2e/MRA.01151-18-f0000.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/87e4/6346178/4548953fea2e/MRA.01151-18-f0000.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/87e4/6346178/4548953fea2e/MRA.01151-18-f0000.jpg

相似文献

1
Near-Complete Genome Sequence of a Human Pegivirus Variant Isolated from a Hepatitis E Virus-Infected Patient.从一名戊型肝炎病毒感染患者分离出的人佩吉病毒变异株的近乎完整基因组序列。
Microbiol Resour Announc. 2019 Jan 24;8(4). doi: 10.1128/MRA.01151-18. eCollection 2019 Jan.
2
Preliminary assessment of viral metagenome from cancer tissue and blood from patients with lung adenocarcinoma.对肺腺癌患者癌组织及血液中病毒宏基因组的初步评估。
J Med Virol. 2021 Aug;93(8):5126-5133. doi: 10.1002/jmv.26887. Epub 2021 Mar 1.
3
Whole-genome sequencing of human Pegivirus variant from an Egyptian patient co-infected with hepatitis C virus: a case report.埃及丙型肝炎病毒合并感染患者人 Pegivirus 变异体的全基因组测序:病例报告。
Virol J. 2019 Nov 11;16(1):132. doi: 10.1186/s12985-019-1242-5.
4
Human pegivirus isolates characterized by deep sequencing from hepatitis C virus-RNA and human immunodeficiency virus-RNA-positive blood donations, France.从丙型肝炎病毒 RNA 和人类免疫缺陷病毒 RNA 阳性的献血者中通过深度测序鉴定的人类杯状病毒分离株,法国。
J Med Virol. 2019 Jan;91(1):38-44. doi: 10.1002/jmv.25290. Epub 2018 Sep 24.
5
Virome Analysis of Transfusion Recipients Reveals a Novel Human Virus That Shares Genomic Features with Hepaciviruses and Pegiviruses.输血受者的病毒组分析揭示了一种与肝炎病毒和pegiviruses具有基因组特征的新型人类病毒。
mBio. 2015 Sep 22;6(5):e01466-15. doi: 10.1128/mBio.01466-15.
6
Exploring the Diversity of the Human Blood Virome.探索人类血液病毒组的多样性。
Viruses. 2021 Nov 21;13(11):2322. doi: 10.3390/v13112322.
7
Detection and phylogenetic analysis of human pegivirus (GBV-C) among blood donors and patients infected with hepatitis B virus (HBV) in Qatar.在卡塔尔的献血者和乙型肝炎病毒 (HBV) 感染者中检测和系统进化分析人类戊型肝炎病毒 (GBV-C)。
J Med Virol. 2015 Dec;87(12):2074-81. doi: 10.1002/jmv.24289. Epub 2015 Jun 12.
8
Tropism of human pegivirus (formerly known as GB virus C/hepatitis G virus) and host immunomodulation: insights into a highly successful viral infection.人细小病毒(原称为GB病毒C/庚型肝炎病毒)的嗜性与宿主免疫调节:对一种高度成功的病毒感染的见解
J Gen Virol. 2015 Jul;96(Pt 7):1521-32. doi: 10.1099/vir.0.000086. Epub 2015 Feb 9.
9
A Novel Human Pegivirus, HPgV-2 (HHpgV-1), Is Tightly Associated With Hepatitis C Virus (HCV) Infection and HCV/Human Immunodeficiency Virus Type 1 Coinfection.一种新型人类杯状病毒,HPgV-2(HHpgV-1),与丙型肝炎病毒(HCV)感染和 HCV/人类免疫缺陷病毒 1 型合并感染密切相关。
Clin Infect Dis. 2018 Jan 6;66(1):29-35. doi: 10.1093/cid/cix748.
10
Second Human Pegivirus in Hepatitis C Virus-Infected and Hepatitis C Virus/HIV-1-Co-infected Persons Who Inject Drugs, China.中国丙型肝炎病毒感染者和丙型肝炎病毒/人类免疫缺陷病毒 1 型共感染者中的第二种人类杯状病毒。
Emerg Infect Dis. 2018 May;24(5):908-911. doi: 10.3201/eid2405.161162.

引用本文的文献

1
A Case of Persistent Human Pegivirus Infection in Two Separate Pregnancies of a Woman.一名女性两次不同孕期持续性人pegivirus感染病例。
Microorganisms. 2022 Sep 28;10(10):1925. doi: 10.3390/microorganisms10101925.

本文引用的文献

1
Virome comparisons in wild-diseased and healthy captive giant pandas.野生患病和健康圈养大熊猫的病毒组比较。
Microbiome. 2017 Aug 7;5(1):90. doi: 10.1186/s40168-017-0308-0.
2
RDP4: Detection and analysis of recombination patterns in virus genomes.RDP4:病毒基因组中重组模式的检测与分析
Virus Evol. 2015 May 26;1(1):vev003. doi: 10.1093/ve/vev003. eCollection 2015.
3
Viral nucleic acids in human plasma pools.人血浆样本中的病毒核酸。
Transfusion. 2016 Sep;56(9):2248-55. doi: 10.1111/trf.13692. Epub 2016 Jun 16.
4
An ensemble strategy that significantly improves de novo assembly of microbial genomes from metagenomic next-generation sequencing data.一种可显著改进从宏基因组新一代测序数据中进行微生物基因组从头组装的整合策略。
Nucleic Acids Res. 2015 Apr 20;43(7):e46. doi: 10.1093/nar/gkv002. Epub 2015 Jan 13.
5
Comparing viral metagenomics methods using a highly multiplexed human viral pathogens reagent.使用高度多重的人类病毒病原体试剂比较病毒宏基因组学方法。
J Virol Methods. 2015 Mar;213:139-46. doi: 10.1016/j.jviromet.2014.12.002. Epub 2014 Dec 11.
6
Profile hidden Markov models for the detection of viruses within metagenomic sequence data.用于在宏基因组序列数据中检测病毒的轮廓隐马尔可夫模型。
PLoS One. 2014 Aug 20;9(8):e105067. doi: 10.1371/journal.pone.0105067. eCollection 2014.
7
A novel genotype of GB virus C: its identification and predominance among injecting drug users in Yunnan, China.一种新型的庚型肝炎病毒基因型:在中国云南的静脉吸毒人群中的鉴定及其流行情况。
PLoS One. 2011;6(10):e21151. doi: 10.1371/journal.pone.0021151. Epub 2011 Oct 6.
8
HMMER web server: interactive sequence similarity searching.HMMER 网页服务器:交互式序列相似性搜索。
Nucleic Acids Res. 2011 Jul;39(Web Server issue):W29-37. doi: 10.1093/nar/gkr367. Epub 2011 May 18.
9
The GB viruses: a review and proposed classification of GBV-A, GBV-C (HGV), and GBV-D in genus Pegivirus within the family Flaviviridae.GB 病毒:黄病毒科中的杯状病毒属内的 GBV-A、GBV-C(HGV)和 GBV-D 的综述和分类建议。
J Gen Virol. 2011 Feb;92(Pt 2):233-46. doi: 10.1099/vir.0.027490-0. Epub 2010 Nov 17.
10
Hepatitis E virus genotype diversity in eastern China.中国东部地区戊型肝炎病毒基因型多样性。
Emerg Infect Dis. 2010 Oct;16(10):1630-2. doi: 10.3201/eid1610.100873.